More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_1940 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  99.55 
 
 
224 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  100 
 
 
224 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  99.55 
 
 
224 aa  454  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  96.43 
 
 
224 aa  441  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  78.77 
 
 
223 aa  359  2e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  74.52 
 
 
211 aa  337  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  75.48 
 
 
211 aa  336  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  75 
 
 
210 aa  334  7e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  74.52 
 
 
210 aa  333  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  75.36 
 
 
210 aa  332  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  75.36 
 
 
211 aa  332  3e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  74.88 
 
 
211 aa  330  9e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  71.9 
 
 
210 aa  325  3e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  65.88 
 
 
221 aa  302  2.0000000000000002e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  65.42 
 
 
219 aa  301  7.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  60.99 
 
 
223 aa  297  8e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  66.83 
 
 
233 aa  297  8e-80  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  62.2 
 
 
210 aa  293  1e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  61.33 
 
 
249 aa  292  3e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 
219 aa  291  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  61.79 
 
 
218 aa  286  1e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  60.36 
 
 
236 aa  287  1e-76  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  62.04 
 
 
220 aa  287  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  60.36 
 
 
236 aa  287  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  60.36 
 
 
236 aa  287  1e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  60.71 
 
 
222 aa  285  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  62.68 
 
 
226 aa  285  5e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 
218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 
218 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  57.66 
 
 
243 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  59.91 
 
 
225 aa  283  2.0000000000000002e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  57.66 
 
 
243 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  64.29 
 
 
214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  58.59 
 
 
232 aa  282  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  62.62 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  59.21 
 
 
240 aa  282  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  57.83 
 
 
235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  57.45 
 
 
239 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  58.15 
 
 
232 aa  281  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  57.4 
 
 
235 aa  281  6.000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
231 aa  281  7.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  60.47 
 
 
241 aa  281  7.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  57.73 
 
 
237 aa  280  9e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  57.92 
 
 
231 aa  280  9e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  57.99 
 
 
225 aa  279  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  57.71 
 
 
232 aa  279  3e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  60.93 
 
 
222 aa  279  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  58.74 
 
 
220 aa  279  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  61.9 
 
 
221 aa  279  3e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  58.11 
 
 
236 aa  278  4e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  61.43 
 
 
222 aa  278  7e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  61.43 
 
 
222 aa  278  7e-74  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  59.33 
 
 
229 aa  277  8e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  59.55 
 
 
238 aa  277  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  59.55 
 
 
238 aa  277  9e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  60.55 
 
 
223 aa  277  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  61.01 
 
 
234 aa  277  1e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  57.8 
 
 
252 aa  277  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 
219 aa  277  1e-73  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  60 
 
 
239 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  57.01 
 
 
222 aa  276  2e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  59.09 
 
 
238 aa  275  3e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  60.77 
 
 
216 aa  275  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  59.63 
 
 
240 aa  275  4e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  60.19 
 
 
278 aa  275  5e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  54.87 
 
 
236 aa  275  5e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  54.87 
 
 
236 aa  275  5e-73  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  58.41 
 
 
237 aa  275  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  56.5 
 
 
217 aa  274  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  56.5 
 
 
217 aa  274  6e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  60.09 
 
 
220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  60.09 
 
 
228 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  58.41 
 
 
244 aa  273  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  56.02 
 
 
260 aa  272  3e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  57.8 
 
 
251 aa  272  4.0000000000000004e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  55.31 
 
 
262 aa  272  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 
217 aa  271  5.000000000000001e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  62.2 
 
 
213 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  62.68 
 
 
212 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  57.34 
 
 
252 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 
217 aa  271  6e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  58.14 
 
 
248 aa  271  6e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
217 aa  271  8.000000000000001e-72  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  58.14 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  58.14 
 
 
248 aa  271  8.000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  59.52 
 
 
227 aa  271  8.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  58.14 
 
 
248 aa  271  9e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  61.84 
 
 
213 aa  270  9e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 
213 aa  270  9e-72  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  62.09 
 
 
228 aa  270  1e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 
236 aa  270  1e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 
315 aa  269  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  62.56 
 
 
244 aa  270  2e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  61.61 
 
 
244 aa  269  2.9999999999999997e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
219 aa  268  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 
217 aa  269  2.9999999999999997e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>