More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4020 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  100 
 
 		 260 aa  523  1e-147  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  92.05 
 
 		 262 aa  442  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  77.43 
 
 		 241 aa  363  1e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  79.02 
 
 		 230 aa  338  4e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0721  ribosomal protein S3  65.92 
 
 		 226 aa  295  4e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  63.33 
 
 		 219 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  60.66 
 
 		 219 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  61.79 
 
 		 221 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 211 aa  277  2e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 211 aa  274  1.0000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  60.38 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 218 aa  272  4.0000000000000004e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 210 aa  271  7e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  56.02 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  61.11 
 
 		 220 aa  271  1e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  55.36 
 
 		 224 aa  270  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 		 218 aa  270  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 224 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 224 aa  268  5e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  58.96 
 
 		 226 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 278 aa  268  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  58.37 
 
 		 229 aa  268  8.999999999999999e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 211 aa  267  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 211 aa  267  1e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  57.97 
 
 		 210 aa  267  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.34 
 
 		 223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 210 aa  265  5e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  59.24 
 
 		 217 aa  265  5.999999999999999e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  59.72 
 
 		 217 aa  264  8.999999999999999e-70  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 210 aa  264  8.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  53.09 
 
 		 228 aa  263  2e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 223 aa  263  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 219 aa  263  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 235 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 232 aa  263  3e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 232 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  55.91 
 
 		 228 aa  262  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  262  4e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 219 aa  261  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  58.99 
 
 		 278 aa  261  8e-69  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 232 aa  261  8e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  58.29 
 
 		 217 aa  261  8.999999999999999e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  55.65 
 
 		 223 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  55.91 
 
 		 228 aa  261  1e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 236 aa  259  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  58.49 
 
 		 222 aa  259  2e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  55.83 
 
 		 325 aa  260  2e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  55.45 
 
 		 223 aa  260  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 214 aa  259  3e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  59.43 
 
 		 278 aa  259  3e-68  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  55.91 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  55.91 
 
 		 228 aa  259  3e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  57.67 
 
 		 221 aa  259  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 231 aa  258  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  57.89 
 
 		 226 aa  258  6e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  56.8 
 
 		 278 aa  258  7e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 222 aa  258  7e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  59.43 
 
 		 278 aa  258  8e-68  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 218 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  55.34 
 
 		 315 aa  258  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 228 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 228 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 228 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 245 aa  257  1e-67  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  50.42 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  56.86 
 
 		 210 aa  257  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  55.12 
 
 		 272 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 258 aa  256  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  53.67 
 
 		 221 aa  256  3e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  55.12 
 
 		 288 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  55.29 
 
 		 286 aa  255  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 223 aa  255  4e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  54.85 
 
 		 341 aa  255  4e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 274 aa  255  4e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  54.15 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  54.34 
 
 		 268 aa  255  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  55.12 
 
 		 270 aa  255  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 243 aa  255  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  55.34 
 
 		 279 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 275 aa  255  6e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 272 aa  255  6e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 239 aa  254  7e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0464  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  51.15 
 
 		 288 aa  254  9e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 222 aa  254  9e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 395 aa  254  1.0000000000000001e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  51.15 
 
 		 288 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 287 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 227 aa  254  1.0000000000000001e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 230 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>