More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1352 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 210 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  88.57 
 
 		 211 aa  390  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  90 
 
 		 210 aa  388  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  87.14 
 
 		 211 aa  384  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  87.62 
 
 		 210 aa  380  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  87.14 
 
 		 211 aa  378  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  87.14 
 
 		 211 aa  378  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  82.61 
 
 		 210 aa  363  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  74.52 
 
 		 224 aa  333  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  74.52 
 
 		 224 aa  333  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  74.52 
 
 		 224 aa  333  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  73.08 
 
 		 224 aa  327  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  70.19 
 
 		 223 aa  317  7.999999999999999e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  70.53 
 
 		 210 aa  310  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  68.75 
 
 		 233 aa  310  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  69.23 
 
 		 249 aa  305  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  67.31 
 
 		 219 aa  303  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  66.51 
 
 		 221 aa  300  9e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  65.7 
 
 		 223 aa  299  2e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 219 aa  298  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 237 aa  297  8e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  64.25 
 
 		 225 aa  297  9e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  64.25 
 
 		 225 aa  295  3e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 243 aa  294  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  65.22 
 
 		 228 aa  294  5e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  65.22 
 
 		 220 aa  294  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 243 aa  294  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 236 aa  293  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 236 aa  293  1e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  65.87 
 
 		 236 aa  292  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  65.55 
 
 		 216 aa  292  2e-78  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  65.55 
 
 		 226 aa  290  1e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 218 aa  289  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 236 aa  289  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 231 aa  288  3e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  67.46 
 
 		 244 aa  288  4e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  64.11 
 
 		 220 aa  288  4e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 222 aa  288  4e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 235 aa  288  5.0000000000000004e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 218 aa  287  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 232 aa  287  7e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 252 aa  286  1e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  65.24 
 
 		 237 aa  286  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 235 aa  287  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 236 aa  285  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 232 aa  286  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 236 aa  285  2e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 218 aa  285  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 220 aa  285  4e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 232 aa  285  5e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 213 aa  284  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  61.9 
 
 		 213 aa  284  7e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  62.8 
 
 		 213 aa  284  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 241 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 248 aa  283  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  64.73 
 
 		 227 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  64.73 
 
 		 227 aa  283  2.0000000000000002e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  61.43 
 
 		 212 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 248 aa  281  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 238 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 238 aa  281  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  62.98 
 
 		 234 aa  281  4.0000000000000003e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 238 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  62.98 
 
 		 223 aa  281  5.000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  63.64 
 
 		 214 aa  281  5.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  59.9 
 
 		 213 aa  280  8.000000000000001e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 219 aa  280  1e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 239 aa  280  1e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  63.94 
 
 		 227 aa  280  2e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1347  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 231 aa  279  3e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  59.62 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 239 aa  278  4e-74  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  60.48 
 
 		 230 aa  278  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  63.46 
 
 		 244 aa  278  6e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 233 aa  278  6e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  62.98 
 
 		 235 aa  277  8e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 233 aa  277  9e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 223 aa  276  1e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  64.42 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  65.38 
 
 		 231 aa  276  2e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  60.95 
 
 		 235 aa  276  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 244 aa  275  3e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 232 aa  275  3e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 235 aa  275  3e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  62.02 
 
 		 240 aa  275  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  64.9 
 
 		 233 aa  275  4e-73  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1846  30S ribosomal protein S3  64.97 
 
 		 226 aa  274  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00843492  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  61.9 
 
 		 232 aa  274  6e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  62.86 
 
 		 227 aa  274  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 232 aa  274  7e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  62.68 
 
 		 221 aa  274  7e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>