More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1477 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 221 aa  451  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  76.92 
 
 		 217 aa  356  9.999999999999999e-98  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  75.57 
 
 		 217 aa  352  2.9999999999999997e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  76.82 
 
 		 222 aa  349  2e-95  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  76.04 
 
 		 217 aa  348  3e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  75.57 
 
 		 218 aa  347  1e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  76.02 
 
 		 218 aa  345  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  74.21 
 
 		 219 aa  342  2.9999999999999997e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  73.3 
 
 		 219 aa  338  5e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  72.85 
 
 		 219 aa  337  7e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  75.23 
 
 		 223 aa  330  1e-89  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  72.3 
 
 		 217 aa  322  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  72.3 
 
 		 217 aa  322  3e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  70.59 
 
 		 217 aa  321  6e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  69.12 
 
 		 226 aa  321  6e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  61.99 
 
 		 219 aa  298  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  63.18 
 
 		 221 aa  298  5e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  68.08 
 
 		 267 aa  295  5e-79  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  63.81 
 
 		 219 aa  290  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  61.36 
 
 		 226 aa  290  2e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  61.71 
 
 		 220 aa  288  5.0000000000000004e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  63.68 
 
 		 219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  63.51 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  63.46 
 
 		 229 aa  285  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  60.36 
 
 		 222 aa  285  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  63.16 
 
 		 214 aa  283  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  62.56 
 
 		 220 aa  280  9e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  61.26 
 
 		 222 aa  280  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  62.44 
 
 		 238 aa  276  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 210 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 211 aa  271  5.000000000000001e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 		 211 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 210 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 		 211 aa  270  9e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.35 
 
 		 211 aa  270  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  58.45 
 
 		 222 aa  267  1e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 395 aa  265  2.9999999999999995e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  57.77 
 
 		 302 aa  264  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  57.66 
 
 		 221 aa  264  5.999999999999999e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  58.85 
 
 		 278 aa  264  7e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 275 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 272 aa  263  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 228 aa  262  3e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 224 aa  261  6.999999999999999e-69  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  53 
 
 		 325 aa  260  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 229 aa  260  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 228 aa  259  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  53.18 
 
 		 224 aa  259  2e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  56.46 
 
 		 278 aa  259  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 230 aa  259  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  54.13 
 
 		 262 aa  259  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  53.6 
 
 		 223 aa  259  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  55.29 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  55.29 
 
 		 224 aa  259  3e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 237 aa  258  3e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  56.74 
 
 		 249 aa  258  4e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  52.75 
 
 		 223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 275 aa  258  5.0000000000000005e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  52.53 
 
 		 315 aa  258  6e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 244 aa  258  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 228 aa  258  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  54.63 
 
 		 234 aa  258  6e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 229 aa  258  7e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  53.67 
 
 		 260 aa  257  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 341 aa  257  9e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  59.13 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  56.46 
 
 		 288 aa  257  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 230 aa  256  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 229 aa  257  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  55.56 
 
 		 227 aa  257  1e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 268 aa  257  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 228 aa  256  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  56.73 
 
 		 271 aa  256  2e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 233 aa  256  2e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>