More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1739 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  100 
 
 
222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  71.9 
 
 
226 aa  325  4.0000000000000003e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  69.41 
 
 
220 aa  324  6e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  70.48 
 
 
222 aa  315  2e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  66.52 
 
 
220 aa  315  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  68.02 
 
 
221 aa  314  6e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  69.41 
 
 
219 aa  313  9.999999999999999e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  69.63 
 
 
218 aa  313  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  66.06 
 
 
221 aa  301  7.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  65.45 
 
 
219 aa  298  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  64.06 
 
 
238 aa  298  4e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  67.58 
 
 
218 aa  294  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  63.51 
 
 
214 aa  294  9e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  63.96 
 
 
219 aa  293  1e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  66.67 
 
 
218 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  61.32 
 
 
222 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  61.32 
 
 
222 aa  290  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  62.61 
 
 
226 aa  287  9e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  64.09 
 
 
219 aa  286  2e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  61.61 
 
 
229 aa  282  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  61.4 
 
 
224 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  61.4 
 
 
224 aa  281  7.000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  62.86 
 
 
211 aa  280  1e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  61.16 
 
 
245 aa  279  2e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  61.26 
 
 
221 aa  280  2e-74  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  62.73 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  60.93 
 
 
224 aa  279  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  62.27 
 
 
219 aa  278  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  60.47 
 
 
224 aa  277  9e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  62.38 
 
 
211 aa  276  1e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  63.03 
 
 
227 aa  272  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  60.48 
 
 
210 aa  272  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  61.32 
 
 
210 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  60.38 
 
 
211 aa  271  6e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  60.38 
 
 
211 aa  271  6e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  61.36 
 
 
217 aa  270  1e-71  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  60.48 
 
 
210 aa  270  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  62.5 
 
 
278 aa  268  4e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  60.91 
 
 
217 aa  268  5e-71  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  57.78 
 
 
233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 
210 aa  267  8.999999999999999e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  59.07 
 
 
213 aa  267  8.999999999999999e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  59.17 
 
 
235 aa  266  1e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 
233 aa  267  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  57.62 
 
 
216 aa  266  2e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  62.2 
 
 
241 aa  266  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  61.32 
 
 
217 aa  266  2e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  58.72 
 
 
223 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  57.52 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  60.09 
 
 
325 aa  266  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  57.52 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  57.52 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1561  ribosomal protein S3  61.43 
 
 
233 aa  265  2.9999999999999995e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.311089  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  62.2 
 
 
213 aa  265  4e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  57.52 
 
 
233 aa  265  4e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  60.55 
 
 
288 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  60.48 
 
 
223 aa  264  7e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  57.01 
 
 
244 aa  264  8e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  57.42 
 
 
308 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  57.59 
 
 
222 aa  264  8.999999999999999e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  60.09 
 
 
288 aa  263  1e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  59.33 
 
 
213 aa  263  1e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 
315 aa  263  1e-69  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  58.85 
 
 
233 aa  263  1e-69  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  58.26 
 
 
249 aa  263  1e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  60.29 
 
 
341 aa  263  1e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  58.74 
 
 
237 aa  263  2e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  54.02 
 
 
256 aa  262  2e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  58.53 
 
 
232 aa  262  3e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  57.59 
 
 
232 aa  262  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  60.66 
 
 
224 aa  262  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  58.53 
 
 
232 aa  262  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  58.53 
 
 
232 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  58.53 
 
 
232 aa  262  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  57.59 
 
 
232 aa  262  4e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  58.37 
 
 
226 aa  261  4e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  57.55 
 
 
210 aa  262  4e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  57.8 
 
 
240 aa  262  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>