More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2705 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  77.21 
 
 		 218 aa  341  7e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  339  2e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  75.35 
 
 		 218 aa  339  2e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  74.65 
 
 		 219 aa  336  1.9999999999999998e-91  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  74.19 
 
 		 219 aa  334  5e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  72.09 
 
 		 217 aa  325  3e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  72.09 
 
 		 217 aa  324  8.000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  69.12 
 
 		 221 aa  321  6e-87  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  70.09 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  70.09 
 
 		 217 aa  315  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  69.59 
 
 		 217 aa  315  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  68.37 
 
 		 217 aa  313  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  68.08 
 
 		 222 aa  307  8e-83  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  66.36 
 
 		 219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  66.2 
 
 		 221 aa  306  2.0000000000000002e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  67.77 
 
 		 219 aa  300  1e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 218 aa  300  1e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  64.06 
 
 		 220 aa  298  6e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  64.76 
 
 		 214 aa  297  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  66.82 
 
 		 220 aa  295  4e-79  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  65.24 
 
 		 229 aa  294  7e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  64.59 
 
 		 222 aa  294  7e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  63.64 
 
 		 226 aa  291  4e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  61.88 
 
 		 223 aa  288  6e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  62.61 
 
 		 222 aa  287  9e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  63.21 
 
 		 221 aa  285  5e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  61.97 
 
 		 238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 219 aa  282  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  60.89 
 
 		 302 aa  279  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  59.91 
 
 		 211 aa  278  6e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  59.46 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  59.46 
 
 		 227 aa  277  1e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  58.96 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  58.96 
 
 		 211 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  63.38 
 
 		 267 aa  272  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  58.49 
 
 		 211 aa  271  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  59.33 
 
 		 210 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 240 aa  271  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 275 aa  271  6e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  59.91 
 
 		 262 aa  271  6e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 210 aa  271  7e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  58.6 
 
 		 234 aa  271  8.000000000000001e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 228 aa  271  9e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  58.96 
 
 		 260 aa  270  1e-71  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  57.47 
 
 		 241 aa  269  2e-71  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 222 aa  269  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 222 aa  269  2e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 230 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  59.81 
 
 		 210 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 228 aa  269  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 235 aa  268  4e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  56.89 
 
 		 252 aa  268  4e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  54.71 
 
 		 223 aa  268  5e-71  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  58.64 
 
 		 230 aa  268  5e-71  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  57.96 
 
 		 235 aa  268  5e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  57.71 
 
 		 228 aa  268  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2327  30S ribosomal protein S3  58.93 
 
 		 227 aa  268  7e-71  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000359117  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 229 aa  268  7e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  61.06 
 
 		 229 aa  267  8e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  59.07 
 
 		 223 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 229 aa  267  8.999999999999999e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 243 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0457  30S ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 278 aa  267  1e-70  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000991742  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  58.17 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  57.69 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  58.82 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  56.44 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 226 aa  266  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  57.33 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  59.62 
 
 		 228 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  57.33 
 
 		 238 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  56.7 
 
 		 245 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 232 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  62.38 
 
 		 249 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_423  ribosomal protein S3  57.47 
 
 		 278 aa  265  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652723  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  55.71 
 
 		 256 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  54.71 
 
 		 223 aa  265  4e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 232 aa  265  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0480  30S ribosomal protein S3  57.47 
 
 		 278 aa  265  5.999999999999999e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  55.2 
 
 		 241 aa  265  5.999999999999999e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  58.37 
 
 		 236 aa  265  5.999999999999999e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  60.1 
 
 		 230 aa  264  7e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 239 aa  264  8e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>