More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2224 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  100 
 
 		 317 aa  608  1e-173  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  96.26 
 
 		 335 aa  424  1e-117  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  70.12 
 
 		 317 aa  391  1e-108  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  68.28 
 
 		 312 aa  384  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  83.86 
 
 		 326 aa  381  1e-104  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  55.38 
 
 		 276 aa  275  7e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  59.2 
 
 		 311 aa  266  4e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  57.92 
 
 		 234 aa  266  4e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  57.87 
 
 		 234 aa  264  2e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  54.5 
 
 		 304 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  56.92 
 
 		 231 aa  262  4.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  57.95 
 
 		 237 aa  258  8e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  53.54 
 
 		 231 aa  248  8e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  44.86 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  46.88 
 
 		 208 aa  205  6e-52  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  46.35 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  46.35 
 
 		 211 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  45.83 
 
 		 211 aa  196  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  46.88 
 
 		 211 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  39.81 
 
 		 229 aa  178  9e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  48.89 
 
 		 187 aa  176  6e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  43.01 
 
 		 240 aa  175  8e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  33.05 
 
 		 236 aa  137  3.0000000000000003e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  35.5 
 
 		 220 aa  136  5e-31  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  34.5 
 
 		 217 aa  135  7.000000000000001e-31  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  35 
 
 		 224 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  35 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  31.95 
 
 		 251 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  32.09 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.63 
 
 		 231 aa  122  7e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  29.81 
 
 		 252 aa  117  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  30.37 
 
 		 264 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  35.84 
 
 		 250 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  28.3 
 
 		 253 aa  102  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  33.93 
 
 		 253 aa  97.1  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  31.89 
 
 		 222 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  31.89 
 
 		 222 aa  96.7  5e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  34.52 
 
 		 249 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 248 aa  92  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  33.71 
 
 		 213 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  31.15 
 
 		 247 aa  86.3  7e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  32.11 
 
 		 226 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  32.18 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  32.74 
 
 		 218 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  30.98 
 
 		 219 aa  82.8  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  32.42 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  32.97 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  30.95 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  29.17 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  30.99 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  32.77 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  32.14 
 
 		 226 aa  80.1  0.00000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  29.23 
 
 		 228 aa  80.1  0.00000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  32.93 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  28.42 
 
 		 226 aa  79.7  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf436  30S ribosomal protein S3  30.88 
 
 		 247 aa  79.7  0.00000000000006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  30.36 
 
 		 244 aa  79.3  0.00000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  79.3  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  32.46 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  30.34 
 
 		 223 aa  78.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  29.89 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  27.87 
 
 		 229 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  28.96 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  32.4 
 
 		 219 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  27.87 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2149  SSU ribosomal protein S3P  32.94 
 
 		 218 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0519385  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  28.96 
 
 		 228 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  30.36 
 
 		 244 aa  78.2  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  30.05 
 
 		 227 aa  78.2  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  28.64 
 
 		 246 aa  77.4  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  29.59 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  28.42 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  32.4 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  28.42 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  28.42 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  27.87 
 
 		 229 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 228 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  27.81 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  27.72 
 
 		 233 aa  76.3  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>