More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0488 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  100 
 
 		 187 aa  373  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  51.96 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  47.78 
 
 		 211 aa  180  8.000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  48.33 
 
 		 317 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  49.72 
 
 		 335 aa  178  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  48.6 
 
 		 326 aa  177  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  46.99 
 
 		 208 aa  176  1e-43  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  46.67 
 
 		 211 aa  176  1e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  46.67 
 
 		 211 aa  176  2e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  49.16 
 
 		 317 aa  173  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  46.67 
 
 		 211 aa  171  5e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  48.07 
 
 		 312 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  45.3 
 
 		 240 aa  169  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  45.76 
 
 		 220 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  47.22 
 
 		 276 aa  161  6e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  48.07 
 
 		 237 aa  160  8.000000000000001e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  43.92 
 
 		 224 aa  160  1e-38  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  42.25 
 
 		 236 aa  160  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  44.63 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  42.47 
 
 		 304 aa  159  3e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  43.58 
 
 		 231 aa  157  8e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  44.07 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  46.51 
 
 		 237 aa  156  2e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  42.29 
 
 		 234 aa  155  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  44.32 
 
 		 311 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  45.45 
 
 		 234 aa  151  5e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  43.02 
 
 		 231 aa  151  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  42.2 
 
 		 251 aa  147  7e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  35.45 
 
 		 242 aa  108  6e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  32.11 
 
 		 252 aa  105  5e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  32.63 
 
 		 264 aa  102  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  33.68 
 
 		 231 aa  99.4  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  32.75 
 
 		 253 aa  91.3  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  33.88 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  32 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  31.64 
 
 		 219 aa  79.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  30.29 
 
 		 221 aa  77.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  39.09 
 
 		 248 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  29.55 
 
 		 218 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  30.99 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  30.99 
 
 		 228 aa  75.1  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  35.51 
 
 		 250 aa  74.3  0.0000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  30.69 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  31.95 
 
 		 210 aa  73.6  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  31.69 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  29.51 
 
 		 217 aa  73.9  0.000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  29.71 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  29.28 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3989  ribosomal protein S3  31.43 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  29.55 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  31.4 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  29.82 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 228 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 241 aa  72  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 261 aa  72.4  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  30.53 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  31.4 
 
 		 242 aa  72  0.000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  29.65 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  35.42 
 
 		 240 aa  71.6  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  28.41 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 253 aa  71.2  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  28.99 
 
 		 246 aa  71.2  0.000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  32.73 
 
 		 278 aa  71.2  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  32.47 
 
 		 217 aa  71.2  0.000000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  29.95 
 
 		 262 aa  71.2  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  31.52 
 
 		 249 aa  70.9  0.000000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  32.12 
 
 		 272 aa  71.2  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2149  SSU ribosomal protein S3P  32.16 
 
 		 218 aa  70.9  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0519385  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  28.65 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  33.1 
 
 		 223 aa  70.5  0.00000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  26.44 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  26.44 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  29.82 
 
 		 228 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  30.11 
 
 		 219 aa  70.9  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  27.59 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  27.84 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0320  30S ribosomal protein S3  29.17 
 
 		 268 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000941491  decreased coverage  0.00272793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  30.18 
 
 		 233 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>