More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MARTH_orf436 on replicon NC_011025
Organism: Mycoplasma arthritidis 158L3-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011025  MARTH_orf436  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 247 aa  504  9.999999999999999e-143  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  48.64 
 
 		 218 aa  209  3e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  48.64 
 
 		 218 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl129  30S ribosomal protein S3  46.22 
 
 		 241 aa  207  1e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0690  30S ribosomal protein S3  46.25 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  44.59 
 
 		 221 aa  204  8e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  45.34 
 
 		 247 aa  204  1e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  44.59 
 
 		 227 aa  203  2e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  51.89 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  51.89 
 
 		 217 aa  203  2e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  47.51 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  42.8 
 
 		 228 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 219 aa  202  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  44.73 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0232  ribosomal protein S3  48.15 
 
 		 257 aa  202  3e-51  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  42.8 
 
 		 228 aa  203  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  47.95 
 
 		 217 aa  201  7e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  47.2 
 
 		 218 aa  201  8e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  50.94 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  47.49 
 
 		 217 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  42.56 
 
 		 256 aa  198  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  45.98 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  45.98 
 
 		 222 aa  198  6e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  45.25 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  46.61 
 
 		 217 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  47.17 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  42.92 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  42.92 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  45.28 
 
 		 230 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  42.92 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  42.92 
 
 		 228 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  45.25 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  43.78 
 
 		 221 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  42.24 
 
 		 232 aa  196  3e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  45.25 
 
 		 227 aa  196  3e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  46.09 
 
 		 226 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  46.61 
 
 		 226 aa  195  5.000000000000001e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  45.75 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  44.8 
 
 		 229 aa  195  6e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  42.06 
 
 		 228 aa  195  6e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  42.49 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  42.49 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  42.49 
 
 		 228 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  45.74 
 
 		 238 aa  195  7e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  45.75 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  44.14 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  45.28 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  44.34 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  44.29 
 
 		 240 aa  194  1e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  44.14 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  44.14 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  44.34 
 
 		 229 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  44.39 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  42.06 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  42.79 
 
 		 261 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  44.1 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  42.06 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  45.91 
 
 		 219 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  44.81 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  42.06 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  42.06 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  40.65 
 
 		 236 aa  192  6e-48  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  43.69 
 
 		 232 aa  192  6e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  44.39 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  43.87 
 
 		 308 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  43.32 
 
 		 228 aa  191  7e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  43.4 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  43.26 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  42.62 
 
 		 244 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  45.09 
 
 		 222 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  46.79 
 
 		 216 aa  191  1e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  45.45 
 
 		 223 aa  190  2e-47  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  45.05 
 
 		 222 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  43.17 
 
 		 252 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  45.28 
 
 		 210 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  41.78 
 
 		 267 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  41.63 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>