More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0690 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007633  MCAP_0690  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl129  30S ribosomal protein S3  82.46 
 
 		 241 aa  358  5e-98  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  51.72 
 
 		 218 aa  229  4e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 218 aa  228  7e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  48.48 
 
 		 226 aa  222  4e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  52.13 
 
 		 219 aa  219  3e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 217 aa  218  5e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 217 aa  216  2.9999999999999998e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  51.66 
 
 		 219 aa  215  5.9999999999999996e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  51.18 
 
 		 219 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  50.71 
 
 		 219 aa  212  3.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 217 aa  209  2e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 217 aa  210  2e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  49.52 
 
 		 288 aa  207  9e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  47.47 
 
 		 248 aa  206  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  47.77 
 
 		 239 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  47.79 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  47.79 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  48.82 
 
 		 217 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  47.47 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  47.47 
 
 		 248 aa  206  3e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  51.66 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0232  ribosomal protein S3  48.86 
 
 		 257 aa  206  3e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  44.07 
 
 		 275 aa  206  4e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf436  30S ribosomal protein S3  46.25 
 
 		 247 aa  205  4e-52  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  48.58 
 
 		 214 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  45.91 
 
 		 325 aa  205  5e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  50 
 
 		 228 aa  205  6e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  46.88 
 
 		 241 aa  205  6e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23750  SSU ribosomal protein S3P  45.15 
 
 		 280 aa  204  8e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.167158  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  46.32 
 
 		 288 aa  204  9e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  48.57 
 
 		 278 aa  204  1e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  45.45 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  46.32 
 
 		 288 aa  204  1e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  45.09 
 
 		 341 aa  203  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  43.1 
 
 		 282 aa  203  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  47.93 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  47.14 
 
 		 232 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  47.66 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  47.06 
 
 		 222 aa  203  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  45.89 
 
 		 235 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  47.47 
 
 		 251 aa  202  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  46.7 
 
 		 232 aa  202  3e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  44.84 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  44.84 
 
 		 222 aa  202  3e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0404  ribosomal protein S3  49.54 
 
 		 288 aa  202  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  46.82 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  46.7 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  50.24 
 
 		 226 aa  202  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  45.26 
 
 		 221 aa  202  5e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  46.43 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  47.39 
 
 		 222 aa  202  5e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  45.89 
 
 		 236 aa  201  6e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  45.12 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  47.87 
 
 		 222 aa  201  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  49.76 
 
 		 228 aa  201  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  47.62 
 
 		 292 aa  201  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  47.47 
 
 		 248 aa  201  7e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  46.7 
 
 		 286 aa  201  8e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  50.47 
 
 		 232 aa  201  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  46.55 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  46.55 
 
 		 224 aa  201  8e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  46.48 
 
 		 395 aa  200  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  44.4 
 
 		 231 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  45.18 
 
 		 237 aa  200  9.999999999999999e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  47.62 
 
 		 272 aa  200  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  46.29 
 
 		 268 aa  200  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  46.89 
 
 		 270 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  46.55 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  46.29 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  45.92 
 
 		 224 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  49.36 
 
 		 237 aa  199  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  45.05 
 
 		 221 aa  199  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 233 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  46.3 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  46.3 
 
 		 236 aa  198  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  44.83 
 
 		 231 aa  198  5e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  43.78 
 
 		 241 aa  198  6e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  50 
 
 		 233 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  49.29 
 
 		 228 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  46.3 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  43.28 
 
 		 276 aa  197  9e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>