More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0232 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0232  ribosomal protein S3  100 
 
 		 257 aa  525  1e-148  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  50.93 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 219 aa  211  1e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 218 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 219 aa  207  1e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  49.07 
 
 		 219 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0690  30S ribosomal protein S3  48.86 
 
 		 233 aa  206  3e-52  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf436  30S ribosomal protein S3  48.15 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  47.25 
 
 		 222 aa  202  6e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  46.67 
 
 		 226 aa  199  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  44.39 
 
 		 221 aa  199  5e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl129  30S ribosomal protein S3  48.37 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  45.11 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  47.27 
 
 		 219 aa  195  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  47.2 
 
 		 217 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  47.2 
 
 		 217 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  44.73 
 
 		 241 aa  194  2e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  46.73 
 
 		 286 aa  193  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  48.34 
 
 		 214 aa  193  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  45.5 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  44.55 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  45.79 
 
 		 217 aa  192  5e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  41.53 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  42.34 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  41.53 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  41.53 
 
 		 287 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  45.97 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  46.92 
 
 		 221 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  45.5 
 
 		 217 aa  190  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  44.68 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  45.97 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  44.55 
 
 		 218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  41.88 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  45.97 
 
 		 222 aa  189  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  42.34 
 
 		 278 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  188  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  44.76 
 
 		 325 aa  188  8e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0404  ribosomal protein S3  40.16 
 
 		 288 aa  188  9e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  40.86 
 
 		 282 aa  188  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  42.37 
 
 		 233 aa  187  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  44.76 
 
 		 315 aa  187  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  43.88 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0206  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000455667  unclonable  0.00000997439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  44.08 
 
 		 217 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  49.53 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3753  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000131663  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  43.64 
 
 		 302 aa  187  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4164  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 230 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000278564  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  43.13 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  44.55 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  40.47 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  44.7 
 
 		 219 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  44.08 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  43.46 
 
 		 217 aa  186  3e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  42.55 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  41.35 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  42.92 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1771  30S ribosomal protein S3  46.92 
 
 		 232 aa  186  4e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000585037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  44.44 
 
 		 222 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  44.44 
 
 		 222 aa  186  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  42.86 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  42.44 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  42.86 
 
 		 228 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  45.12 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  40.69 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  44.08 
 
 		 229 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  42.55 
 
 		 235 aa  185  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  40.69 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  45.93 
 
 		 288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  44.19 
 
 		 229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  44.08 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  36.7 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  43.46 
 
 		 341 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  46.92 
 
 		 232 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  43.98 
 
 		 243 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 229 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1027  30S ribosomal protein S3  46.45 
 
 		 232 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000269281  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  45.37 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  44.55 
 
 		 233 aa  183  2.0000000000000003e-45  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  42.79 
 
 		 230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  44.44 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  44.44 
 
 		 236 aa  182  3e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  44.44 
 
 		 236 aa  183  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  43.42 
 
 		 276 aa  183  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  45.5 
 
 		 234 aa  182  3e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  44.34 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  44.34 
 
 		 233 aa  182  3e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>