92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_49305 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 		 231 aa  472  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  68.69 
 
 		 253 aa  305  3e-82  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  66.22 
 
 		 264 aa  304  6e-82  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  65.71 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  55.95 
 
 		 242 aa  251  5.000000000000001e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  33.33 
 
 		 317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  32.7 
 
 		 312 aa  125  6e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  31.63 
 
 		 335 aa  124  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  31.63 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  35.02 
 
 		 311 aa  122  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  37.44 
 
 		 237 aa  121  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  31.78 
 
 		 326 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  32.89 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  31.22 
 
 		 234 aa  113  3e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  31.53 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  31.5 
 
 		 304 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  34.17 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  29.56 
 
 		 211 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  30.54 
 
 		 211 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  35.05 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  33.33 
 
 		 276 aa  107  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  31.08 
 
 		 231 aa  107  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  29.56 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  29.56 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  33.68 
 
 		 187 aa  99.4  4e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  31.5 
 
 		 229 aa  97.8  1e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  31.49 
 
 		 240 aa  86.7  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  28.8 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  30.73 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  27.81 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  27.81 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  28.49 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  24.75 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1842  ribosomal protein S3  30.06 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000278031  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  28.76 
 
 		 226 aa  49.7  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  23.94 
 
 		 260 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  27.2 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  23.98 
 
 		 248 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  29.66 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  25.24 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  26.11 
 
 		 234 aa  46.2  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  25.24 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  25.24 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  25.24 
 
 		 228 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  25.81 
 
 		 253 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  25.26 
 
 		 245 aa  45.8  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  28.23 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  25.7 
 
 		 261 aa  45.4  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  25.83 
 
 		 219 aa  45.4  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  26.57 
 
 		 238 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl129  30S ribosomal protein S3  25.71 
 
 		 241 aa  44.7  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  23.67 
 
 		 262 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  30.23 
 
 		 233 aa  43.9  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  28.23 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  26.67 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  24.87 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  26.6 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  27.43 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  26.6 
 
 		 228 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  25 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  28.03 
 
 		 395 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  25 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  26.4 
 
 		 249 aa  43.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  26.39 
 
 		 235 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  25.12 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  24.14 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  28.8 
 
 		 233 aa  43.1  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  25.12 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  24.14 
 
 		 248 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  31.5 
 
 		 223 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  24.04 
 
 		 251 aa  42.4  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  28.08 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  22.46 
 
 		 241 aa  42.7  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  24.14 
 
 		 248 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  28.08 
 
 		 227 aa  42.7  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3173  30S ribosomal protein S3  24.65 
 
 		 264 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000329373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1845  30S ribosomal protein S3  26.75 
 
 		 253 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.478423  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  24.58 
 
 		 248 aa  42.4  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  27.13 
 
 		 226 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  24.42 
 
 		 249 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  28.8 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  24.04 
 
 		 252 aa  42  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  28.8 
 
 		 233 aa  42.4  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0187  30S ribosomal protein S3  27.22 
 
 		 252 aa  42  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.0000114695  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  26.09 
 
 		 231 aa  42  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  25.88 
 
 		 219 aa  42  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  26.24 
 
 		 222 aa  42  0.008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  23.08 
 
 		 236 aa  42  0.009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  24.27 
 
 		 228 aa  42  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  24.27 
 
 		 228 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  24.27 
 
 		 228 aa  42  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3311  30S ribosomal protein S3  24.65 
 
 		 265 aa  41.6  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000058787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>