More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1269 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  100 
 
 		 211 aa  427  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  99.53 
 
 		 211 aa  426  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  96.68 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  87.2 
 
 		 211 aa  381  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  78.87 
 
 		 208 aa  328  3e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  49 
 
 		 234 aa  222  4e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  49.32 
 
 		 237 aa  215  4e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  49.22 
 
 		 231 aa  214  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  46.73 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  48.33 
 
 		 326 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  47.18 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  46.5 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  47.29 
 
 		 317 aa  206  2e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  48.19 
 
 		 276 aa  203  2e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  46.88 
 
 		 335 aa  199  3e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  44.79 
 
 		 311 aa  198  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  44.44 
 
 		 312 aa  197  7.999999999999999e-50  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  44.16 
 
 		 304 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  46.35 
 
 		 317 aa  194  6e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  46.67 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  35.45 
 
 		 229 aa  156  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  37.16 
 
 		 240 aa  153  1e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  35.29 
 
 		 251 aa  147  8e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  39.15 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  39.15 
 
 		 222 aa  144  7.0000000000000006e-34  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  38.1 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  38.1 
 
 		 224 aa  141  6e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  32.21 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  31.19 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  30.54 
 
 		 264 aa  113  2.0000000000000002e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  29.7 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  29.56 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  33.69 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  33.69 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  33.69 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0284  30S ribosomal protein S3  32.8 
 
 		 288 aa  95.9  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128971  hitchhiker  0.0000000454249 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 249 aa  95.9  4e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0279  30S ribosomal protein S3  32.8 
 
 		 288 aa  95.9  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000626052  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  31.67 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  34.86 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  34.86 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  34.86 
 
 		 228 aa  94.7  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  35.26 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  35.26 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  35.26 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  35.26 
 
 		 228 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0397  30S ribosomal protein S3  31.72 
 
 		 290 aa  93.2  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.26331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  34.21 
 
 		 226 aa  93.2  3e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  33.51 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  31.91 
 
 		 226 aa  92.8  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  33.15 
 
 		 242 aa  92  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1270  30S ribosomal protein S3  31.89 
 
 		 294 aa  92  6e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00251085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  33.15 
 
 		 242 aa  91.7  7e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  31.46 
 
 		 247 aa  91.7  8e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  33.16 
 
 		 210 aa  90.9  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  26.34 
 
 		 253 aa  90.9  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  34.44 
 
 		 218 aa  90.5  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  31.72 
 
 		 301 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  33.81 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4907  30S ribosomal protein S3  30.65 
 
 		 308 aa  90.5  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0459562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3789  30S ribosomal protein S3  30.65 
 
 		 298 aa  89.4  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.461405  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  32.6 
 
 		 227 aa  89.7  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  31.77 
 
 		 223 aa  89.4  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  31.28 
 
 		 210 aa  89  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0344  30S ribosomal protein S3  30.65 
 
 		 293 aa  89  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.212701  decreased coverage  0.000331478 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  31.77 
 
 		 221 aa  89  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  31.22 
 
 		 295 aa  88.6  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  88.6  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 213 aa  88.6  7e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  34.31 
 
 		 253 aa  88.2  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  32.8 
 
 		 234 aa  88.2  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  28.86 
 
 		 285 aa  88.2  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  32.58 
 
 		 222 aa  88.2  8e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  87.8  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  32.28 
 
 		 238 aa  87.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  30.68 
 
 		 224 aa  87.4  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  30.69 
 
 		 299 aa  87.8  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  87.4  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 		 232 aa  87.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  34.64 
 
 		 214 aa  86.7  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4538  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 		 232 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472984  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  31.47 
 
 		 219 aa  87  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  33.52 
 
 		 233 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>