47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_33660 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  100 
 
 		 253 aa  521  1e-147  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  68.69 
 
 		 231 aa  305  4.0000000000000004e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  66.51 
 
 		 264 aa  286  2e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  66.04 
 
 		 252 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  59.62 
 
 		 242 aa  245  6e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  33.65 
 
 		 311 aa  115  6e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  32.38 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  31.38 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  33.67 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  30.35 
 
 		 312 aa  108  8.000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  34.03 
 
 		 231 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  35.29 
 
 		 234 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  28.3 
 
 		 317 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  29.95 
 
 		 326 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  29.41 
 
 		 335 aa  103  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  34.22 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  31.38 
 
 		 304 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  34.42 
 
 		 237 aa  98.6  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  32.09 
 
 		 276 aa  98.6  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  29.33 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  27.8 
 
 		 211 aa  96.3  4e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  27.96 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  26.34 
 
 		 211 aa  91.3  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  26.34 
 
 		 211 aa  90.9  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  32.75 
 
 		 187 aa  91.3  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  29.95 
 
 		 240 aa  90.1  3e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  26.34 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  30.77 
 
 		 220 aa  85.1  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  28.4 
 
 		 217 aa  82  0.000000000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  28.4 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  27.22 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  26.63 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  24.06 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  24.87 
 
 		 260 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  24.06 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  30.15 
 
 		 232 aa  46.2  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  26.37 
 
 		 262 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  26.61 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  28.18 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  24.28 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  25.13 
 
 		 226 aa  42.7  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  25.79 
 
 		 221 aa  42.7  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  24.8 
 
 		 248 aa  42.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  27.21 
 
 		 231 aa  42  0.008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  25.58 
 
 		 231 aa  42  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  26.4 
 
 		 250 aa  42.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 224 aa  42  0.009  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>