More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0715 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  100 
 
 
211 aa  422  1e-117  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  87.2 
 
 
211 aa  381  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  86.73 
 
 
211 aa  379  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  85.78 
 
 
211 aa  377  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  74.74 
 
 
208 aa  311  5.999999999999999e-84  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  54.87 
 
 
237 aa  215  5e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  46 
 
 
234 aa  206  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  47.37 
 
 
231 aa  203  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  45.73 
 
 
231 aa  202  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  46.41 
 
 
326 aa  201  5e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  47.4 
 
 
317 aa  198  6e-50  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  47.15 
 
 
276 aa  197  7.999999999999999e-50  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  47.4 
 
 
335 aa  196  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  45.13 
 
 
234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  46.56 
 
 
311 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  43.75 
 
 
312 aa  193  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  41.63 
 
 
237 aa  194  1e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  46.88 
 
 
317 aa  192  4e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  42.64 
 
 
304 aa  191  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  46.67 
 
 
187 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  40.98 
 
 
229 aa  157  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  37.7 
 
 
240 aa  152  5e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  39.38 
 
 
217 aa  143  2e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  36.36 
 
 
251 aa  142  4e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  39.38 
 
 
220 aa  141  6e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  39.38 
 
 
224 aa  141  9e-33  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  38.86 
 
 
222 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  35.1 
 
 
236 aa  121  8e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  31.84 
 
 
242 aa  111  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0437402 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  30.54 
 
 
264 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  29.56 
 
 
231 aa  108  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  28.22 
 
 
252 aa  101  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  32.42 
 
 
223 aa  91.3  9e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  35.62 
 
 
226 aa  90.1  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  31.02 
 
 
226 aa  89.4  4e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  35.91 
 
 
218 aa  88.6  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  34.23 
 
 
249 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  31.49 
 
 
213 aa  86.7  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  26.34 
 
 
253 aa  87  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0490  30S ribosomal protein S3  31.67 
 
 
242 aa  87  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000127993  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0495  30S ribosomal protein S3  31.67 
 
 
242 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000115275  hitchhiker  0.00400345 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  33.16 
 
 
210 aa  86.3  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  31.55 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  31.55 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  31.55 
 
 
228 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0432  30S ribosomal protein S3  29.94 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392005  hitchhiker  0.0000319768 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  32.29 
 
 
238 aa  84.7  9e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  32.24 
 
 
234 aa  84  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  36.73 
 
 
221 aa  84.7  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  35.07 
 
 
222 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  35.07 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0271  ribosomal protein S3  28.09 
 
 
231 aa  83.6  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386927  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  32.04 
 
 
267 aa  84  0.000000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  31.28 
 
 
210 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  34.46 
 
 
214 aa  82.8  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  32.57 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  32.57 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  32.57 
 
 
228 aa  83.2  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  30.81 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  32.95 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  30.81 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  30.81 
 
 
299 aa  82  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  32.65 
 
 
219 aa  82  0.000000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  31.91 
 
 
221 aa  82  0.000000000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  33.33 
 
 
222 aa  81.6  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  34.48 
 
 
236 aa  81.6  0.000000000000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  33.07 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  31.29 
 
 
231 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  30.56 
 
 
211 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  33.56 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  35.82 
 
 
229 aa  80.9  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0284  30S ribosomal protein S3  29.26 
 
 
288 aa  80.9  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128971  hitchhiker  0.0000000454249 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3993  30S ribosomal protein S3  28.88 
 
 
285 aa  80.9  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000371657 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  30 
 
 
246 aa  80.1  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  32.45 
 
 
219 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  32 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0725  30S ribosomal protein S3  31.65 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000305587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  33.58 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0279  30S ribosomal protein S3  29.26 
 
 
288 aa  80.5  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000626052  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2058  30S ribosomal protein S3  32.19 
 
 
251 aa  79.7  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00124748  normal  0.255543 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  29.71 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  29.71 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  29.19 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>