More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_0007 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  100 
 
 		 304 aa  620  1e-177  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  65.05 
 
 		 311 aa  403  1e-111  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  70.77 
 
 		 276 aa  304  1.0000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  57.95 
 
 		 231 aa  265  7e-70  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  54.22 
 
 		 234 aa  265  8e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  57.51 
 
 		 234 aa  264  1e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  59.09 
 
 		 237 aa  263  2e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  59.18 
 
 		 312 aa  260  2e-68  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  55.9 
 
 		 231 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  56.19 
 
 		 335 aa  254  8e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  57.95 
 
 		 317 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  54.75 
 
 		 326 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  55.24 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  46.12 
 
 		 237 aa  206  4e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  44.16 
 
 		 211 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  44.16 
 
 		 211 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  43.65 
 
 		 211 aa  197  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  43.37 
 
 		 208 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  42.64 
 
 		 211 aa  192  8e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  42.08 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  42.62 
 
 		 229 aa  176  4e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  42.47 
 
 		 187 aa  158  1e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  32.28 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  33.83 
 
 		 236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  33.17 
 
 		 217 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  30.17 
 
 		 242 aa  119  9e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  32.66 
 
 		 220 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  33.17 
 
 		 224 aa  117  3e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  32.16 
 
 		 222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  30.65 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  31.52 
 
 		 252 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  31.5 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  31.38 
 
 		 253 aa  100  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  34.09 
 
 		 210 aa  96.3  6e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  33.53 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  33.92 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  30.64 
 
 		 248 aa  93.6  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  32.24 
 
 		 250 aa  93.6  4e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  32.97 
 
 		 249 aa  92.8  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  34.71 
 
 		 224 aa  92.4  8e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  31.94 
 
 		 222 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  31.94 
 
 		 222 aa  92.4  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  34.88 
 
 		 238 aa  90.1  4e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  32.07 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2149  SSU ribosomal protein S3P  33.73 
 
 		 218 aa  89.7  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0519385  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  34.3 
 
 		 219 aa  89.7  6e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2613  30S ribosomal protein S3  30.89 
 
 		 253 aa  89.4  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00358822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  34.29 
 
 		 226 aa  89  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  32.57 
 
 		 211 aa  89  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  33.71 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  31.58 
 
 		 224 aa  88.2  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  31.58 
 
 		 224 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  31.58 
 
 		 224 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  34.12 
 
 		 226 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  33.91 
 
 		 244 aa  88.2  2e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  31.43 
 
 		 211 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  31.91 
 
 		 210 aa  87.4  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  31.18 
 
 		 222 aa  86.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  31.46 
 
 		 223 aa  86.7  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  31.36 
 
 		 256 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  33.7 
 
 		 222 aa  85.9  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  30.06 
 
 		 211 aa  85.9  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  31.07 
 
 		 221 aa  85.9  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  32.76 
 
 		 234 aa  85.9  9e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3013  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000335081  decreased coverage  0.002387 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3291  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 262 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000159884  hitchhiker  0.00000252184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  29.55 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2944  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012288  decreased coverage  0.000000133007 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  30.57 
 
 		 224 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  31.82 
 
 		 220 aa  84.3  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  34.08 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 237 aa  84.3  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  31.49 
 
 		 213 aa  84  0.000000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  35.15 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3311  30S ribosomal protein S3  30.41 
 
 		 265 aa  84  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000058787  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  28.98 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  33.7 
 
 		 221 aa  83.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  33.7 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  29.82 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  32.07 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  31.21 
 
 		 245 aa  82.8  0.000000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3173  30S ribosomal protein S3  29.82 
 
 		 264 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000329373  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  31.25 
 
 		 219 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  31.18 
 
 		 228 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0334  ribosomal protein S3  28.65 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.385043  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  31.03 
 
 		 237 aa  81.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  29.48 
 
 		 286 aa  81.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  27.75 
 
 		 395 aa  81.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  32.37 
 
 		 236 aa  81.3  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  30.99 
 
 		 246 aa  80.5  0.00000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  33.33 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  31.98 
 
 		 210 aa  80.9  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1940  30S ribosomal protein S3  32.74 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  31.82 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  32.62 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  33.33 
 
 		 252 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1388  ribosomal protein S3  32.62 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000147374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1298  ribosomal protein S3  32.62 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000309982  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0500  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0181082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>