More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_1515 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  100 
 
 		 237 aa  478  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  49.12 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  49.28 
 
 		 317 aa  222  4e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  52.31 
 
 		 234 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  51.17 
 
 		 231 aa  220  9.999999999999999e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  53.37 
 
 		 231 aa  219  3e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  49.52 
 
 		 326 aa  219  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  50.23 
 
 		 211 aa  219  3e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  49.32 
 
 		 211 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  49.32 
 
 		 211 aa  215  4e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  50.75 
 
 		 335 aa  215  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  54.87 
 
 		 211 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  52.04 
 
 		 237 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  52.58 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  48.11 
 
 		 312 aa  212  2.9999999999999995e-54  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  49.75 
 
 		 317 aa  208  5e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  51.04 
 
 		 276 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  46.67 
 
 		 304 aa  203  2e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  46.3 
 
 		 311 aa  202  5e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  43.72 
 
 		 229 aa  175  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  48.07 
 
 		 187 aa  160  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  45.45 
 
 		 251 aa  159  5e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  42.86 
 
 		 240 aa  155  4e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  38.36 
 
 		 236 aa  151  8.999999999999999e-36  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  40.89 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  39.41 
 
 		 217 aa  142  6e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  39.9 
 
 		 222 aa  140  9.999999999999999e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  39.41 
 
 		 224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  37.44 
 
 		 231 aa  121  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  40.11 
 
 		 213 aa  112  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  32.73 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  31.71 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  38.74 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  32.34 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  37.7 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0666  30S ribosomal protein S3  38.12 
 
 		 213 aa  102  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00146093  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1178  ribosomal protein S3  36.41 
 
 		 223 aa  102  4e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000314343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  37.57 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  35.38 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  34.42 
 
 		 253 aa  98.6  7e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1861  30S ribosomal protein S3  30.46 
 
 		 248 aa  97.8  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.10507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  33.15 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  33.15 
 
 		 222 aa  97.4  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  35.36 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  31.28 
 
 		 223 aa  96.3  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  35.09 
 
 		 241 aa  95.5  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  33.18 
 
 		 226 aa  95.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  32.37 
 
 		 222 aa  95.1  9e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  35.32 
 
 		 238 aa  94.7  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  35.09 
 
 		 237 aa  94.4  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  35.87 
 
 		 210 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0271  ribosomal protein S3  31.82 
 
 		 231 aa  94  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000386927  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2901  ribosomal protein S3  34.24 
 
 		 250 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4270  ribosomal protein S3  35.48 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000216647  unclonable  0.00000000000359419 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  32.46 
 
 		 211 aa  92.4  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  31.63 
 
 		 221 aa  92  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  34.98 
 
 		 237 aa  91.7  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  32.7 
 
 		 245 aa  91.7  9e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0297  ribosomal protein S3  34.46 
 
 		 229 aa  91.7  9e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.888515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  31.67 
 
 		 226 aa  91.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  34.18 
 
 		 226 aa  90.1  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0282  30S ribosomal protein S3  36.78 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000274054  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2318  30S ribosomal protein S3  34.05 
 
 		 223 aa  90.5  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000695636  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3453  30S ribosomal protein S3  36.78 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000212964  decreased coverage  0.00445176 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  32.02 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0333  30S ribosomal protein S3  36.78 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000255455  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0320  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000941491  decreased coverage  0.00272793 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  35.14 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2753  30S ribosomal protein S3  36.78 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000356119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0273  30S ribosomal protein S3  36.78 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00291944  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  35.14 
 
 		 228 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0354  30S ribosomal protein S3  36.78 
 
 		 266 aa  90.5  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000020511  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  34.85 
 
 		 256 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3638  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 268 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000231617  hitchhiker  0.0000000000213568 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  31.41 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  31.94 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  35.67 
 
 		 286 aa  89.7  3e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  32.67 
 
 		 224 aa  90.1  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  31.41 
 
 		 211 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3013  30S ribosomal protein S3  35.43 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00000335081  decreased coverage  0.002387 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  33.15 
 
 		 222 aa  89.7  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2626  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0741143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  34.21 
 
 		 218 aa  89.7  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3770  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000624926  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3484  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00131963  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2944  30S ribosomal protein S3  35.43 
 
 		 264 aa  89.4  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.012288  decreased coverage  0.000000133007 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3740  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000268518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1930  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000560778  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3163  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000161585  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3798  30S ribosomal protein S3  37.14 
 
 		 266 aa  89.4  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3291  30S ribosomal protein S3  35.43 
 
 		 262 aa  89.4  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.000159884  hitchhiker  0.00000252184 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  34.59 
 
 		 228 aa  89  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0343  ribosomal protein S3  33.65 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000438385  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1848  SSU ribosomal protein S3P  33.65 
 
 		 227 aa  89  6e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00165537  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2834  30S ribosomal protein S3  36.78 
 
 		 264 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000988121  normal  0.306449 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3311  30S ribosomal protein S3  35.43 
 
 		 265 aa  88.6  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000058787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  38.01 
 
 		 212 aa  88.6  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0411  30S ribosomal protein S3  34.16 
 
 		 234 aa  88.6  8e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000407392  normal  0.239149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  35.47 
 
 		 218 aa  88.6  8e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3062  30S ribosomal protein S3  36.57 
 
 		 266 aa  88.6  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000122398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>