More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0297 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_0297  ribosomal protein S3  100 
 
 		 229 aa  466  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.888515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  64.08 
 
 		 223 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0220  ribosomal protein S3  60.58 
 
 		 210 aa  268  4e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 243 aa  267  8.999999999999999e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  55.02 
 
 		 243 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  61.65 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  61.65 
 
 		 236 aa  267  1e-70  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 236 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 235 aa  265  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 237 aa  264  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  58.22 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  58.33 
 
 		 224 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 210 aa  261  4e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  57.78 
 
 		 224 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  57.78 
 
 		 224 aa  261  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  60.19 
 
 		 210 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  62.14 
 
 		 210 aa  259  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  62.62 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  62.62 
 
 		 220 aa  258  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  58.18 
 
 		 218 aa  258  7e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 249 aa  257  1e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  58.6 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  59.43 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  58.6 
 
 		 211 aa  256  2e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0285  30S ribosomal protein S3  54.87 
 
 		 236 aa  256  3e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000103964  hitchhiker  0.0000018675 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 240 aa  256  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 236 aa  254  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  56.54 
 
 		 211 aa  254  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  57.77 
 
 		 256 aa  254  8e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 232 aa  254  8e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0154  30S ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 229 aa  254  9e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000551432  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2129  ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 248 aa  253  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.429997 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3437  30S ribosomal protein S3  57.01 
 
 		 299 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0722902  normal  0.23465 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  56.36 
 
 		 220 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0867  ribosomal protein S3  56.8 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.808876  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  57.59 
 
 		 228 aa  253  2.0000000000000002e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1914  ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 251 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0533377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  56.54 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2446  ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0056  ribosomal protein S3  58.65 
 
 		 271 aa  253  2.0000000000000002e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.000000000000180668  hitchhiker  1.0517300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0773  30S ribosomal protein S3  54.67 
 
 		 286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000686898  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 219 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2168  ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.392518 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2224  ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 248 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  56.28 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  58.22 
 
 		 210 aa  252  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0059  ribosomal protein S3  58.1 
 
 		 275 aa  252  3e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000192317  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  55.6 
 
 		 229 aa  252  3e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3518  ribosomal protein S3  54.22 
 
 		 230 aa  252  3e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000668296  hitchhiker  0.00000107065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  56.71 
 
 		 229 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0347  ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.924426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  54.63 
 
 		 223 aa  251  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  54.26 
 
 		 221 aa  251  5.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  54.08 
 
 		 235 aa  251  5.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0329  ribosomal protein S3  57.49 
 
 		 224 aa  251  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000625588  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  56.28 
 
 		 229 aa  251  6e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2251  30S ribosomal protein S3  59.71 
 
 		 213 aa  251  7e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000614716  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0176  30S ribosomal protein S3  54.74 
 
 		 229 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000179507  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2528  30S ribosomal protein S3  58.74 
 
 		 238 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 241 aa  250  1e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0262  30S ribosomal protein S3  53.39 
 
 		 301 aa  250  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  58.74 
 
 		 234 aa  250  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0282  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000274054  normal  0.0275687 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0367  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  55.5 
 
 		 261 aa  249  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  59.71 
 
 		 225 aa  249  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1722  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 238 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094862  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3453  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000212964  decreased coverage  0.00445176 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  51.04 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  59.71 
 
 		 232 aa  249  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  54.7 
 
 		 231 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2753  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000356119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0273  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00291944  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 244 aa  249  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0574  ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 239 aa  249  2e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0354  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000020511  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0333  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 266 aa  249  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000255455  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1685  ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 252 aa  249  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0000519283  hitchhiker  0.00000302048 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0237  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  54.27 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2059  30S ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00063998  normal  0.0926898 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  57.77 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1255  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 231 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.378037  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  58.25 
 
 		 236 aa  249  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0320  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 268 aa  249  3e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000941491  decreased coverage  0.00272793 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  55.34 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0205  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000415064  unclonable  0.0000000000217557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0200  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00835555  hitchhiker  0.00166911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0205  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000069447  hitchhiker  0.00000000149632 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0209  30S ribosomal protein S3  51.88 
 
 		 295 aa  249  3e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4050  30S ribosomal protein S3  54.35 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000595874  unclonable  0.00000000000714498 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3311  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 265 aa  249  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000058787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0202  30S ribosomal protein S3  54.35 
 
 		 230 aa  248  4e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000360171  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3638  30S ribosomal protein S3  57.14 
 
 		 268 aa  248  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000231617  hitchhiker  0.0000000000213568 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>