268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_82366 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_82366  predicted protein  100 
 
 		 242 aa  481  1e-135  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0437402 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01060  ribosomal protein S3, putative  65.12 
 
 		 252 aa  284  9e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.229597  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04087  hypothetical protein similar to 40s ribosomal protein s3 (Eurofung)  63.16 
 
 		 264 aa  281  4.0000000000000003e-75  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49305  Ribosomal protein S3, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  55.95 
 
 		 231 aa  251  5.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0399938  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33660  predicted protein  59.62 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.83302  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0104  30S ribosomal protein S3P  32.92 
 
 		 311 aa  124  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0216  ribosomal protein S3  32.09 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2224  ribosomal protein S3  32.09 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2443  30S ribosomal protein S3P  32.86 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.881359 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1834  30S ribosomal protein S3P  32.52 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.42538 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2298  30S ribosomal protein S3P  33.01 
 
 		 326 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0007  30S ribosomal protein S3P  30.28 
 
 		 304 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000452289  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0538  30S ribosomal protein S3P  31.65 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.172805  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0174  30S ribosomal protein S3P  31.68 
 
 		 211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000147825  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0649  30S ribosomal protein S3P  31.19 
 
 		 211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000037377  hitchhiker  0.000300079 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1269  30S ribosomal protein S3P  31.19 
 
 		 211 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00000000296825  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1389  30S ribosomal protein S3P  30.39 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0715  30S ribosomal protein S3P  31.84 
 
 		 211 aa  111  8.000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0204211  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0448  30S ribosomal protein S3P  32.72 
 
 		 234 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0404742  normal  0.454808 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0087  30S ribosomal protein S3P  32.2 
 
 		 231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.370765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0570  30S ribosomal protein S3P  28.99 
 
 		 234 aa  109  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2247  30S ribosomal protein S3P  33.17 
 
 		 237 aa  108  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000824007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0488  ribosomal protein S3  35.45 
 
 		 187 aa  108  1e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1722  30S ribosomal protein S3P  32.52 
 
 		 276 aa  104  1e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.0000106793  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1772  ribosomal protein S3  33.82 
 
 		 229 aa  103  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1515  ribosomal protein S3  32.34 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  6.05815e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0553  30S ribosomal protein S3P  31.77 
 
 		 220 aa  92  8e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0097  30S ribosomal protein S3P  35.09 
 
 		 240 aa  92  8e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000179661  unclonable  0.000000500549 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0747  30S ribosomal protein S3P  29.69 
 
 		 224 aa  89.7  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.641836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1729  30S ribosomal protein S3P  30.77 
 
 		 217 aa  88.6  9e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0769  30S ribosomal protein S3P  29.59 
 
 		 222 aa  83.6  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0804  30S ribosomal protein S3  29.73 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5079 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0907  30S ribosomal protein S3P  24.76 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0809  30S ribosomal protein S3  30.77 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.232608  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1568  ribosomal protein S3  30.12 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000461215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  26.77 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  27.75 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0987  ribosomal protein S3  25.63 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.499926  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  25.13 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  26.74 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00736  30S ribosomal protein S3  28.72 
 
 		 232 aa  55.1  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0202  SSU ribosomal protein S3P  25 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0598468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  30.17 
 
 		 233 aa  53.9  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0040  30S ribosomal protein S3  29.48 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0666312  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  27.75 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2163  ribosomal protein S3  26.2 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0196191  normal  0.200155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  25.43 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  27.91 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  28.72 
 
 		 232 aa  53.5  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2075  30S ribosomal protein S3  30.29 
 
 		 233 aa  52.8  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000597186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  30.29 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  26.18 
 
 		 217 aa  52.4  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  27.69 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  25.58 
 
 		 260 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  30.29 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  25.93 
 
 		 241 aa  52.4  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  27.55 
 
 		 232 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  26.7 
 
 		 217 aa  52.4  0.000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0325  30S ribosomal protein S3  26.82 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.85995e-16  unclonable  0.0000000469297 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  26.83 
 
 		 395 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  27.01 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf436  30S ribosomal protein S3  27.22 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  26.59 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  26.18 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0601  SSU ribosomal protein S3P  27.33 
 
 		 267 aa  51.2  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000507952  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  24.34 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0090  30S ribosomal protein S3  26.34 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.157712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2318  ribosomal protein S3  26.2 
 
 		 228 aa  51.2  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00326782  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1759  30S ribosomal protein S3  26.74 
 
 		 212 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.341094  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3661  ribosomal protein S3  25.86 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000178065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0608  ribosomal protein S3  27.57 
 
 		 285 aa  50.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  25.58 
 
 		 226 aa  51.2  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0190  30S ribosomal protein S3  26.59 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000304143  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  25.41 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  27.47 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  25.51 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2168  30S ribosomal protein S3  27.37 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000068862  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 229 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1962  ribosomal protein S3  28.65 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.180974  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  26.86 
 
 		 270 aa  50.1  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  24.12 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  24.12 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  24.87 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  24.87 
 
 		 228 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2366  30S ribosomal protein S3  24 
 
 		 223 aa  49.3  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.77058  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0085  30S ribosomal protein S3  26.32 
 
 		 213 aa  49.3  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0561951 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  26.09 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  26.09 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4311  30S ribosomal protein S3  25.86 
 
 		 229 aa  48.9  0.00007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000643505  unclonable  0.0000000000545426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  27.17 
 
 		 232 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>