More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1191 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1191  30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 265 aa  535  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  72.91 
 
 		 288 aa  380  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  72.51 
 
 		 288 aa  379  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  72.48 
 
 		 279 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  71.43 
 
 		 274 aa  364  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  70.43 
 
 		 275 aa  359  3e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  68.5 
 
 		 268 aa  359  3e-98  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  69.62 
 
 		 278 aa  358  4e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  69.73 
 
 		 287 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  69.73 
 
 		 287 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  69.73 
 
 		 287 aa  358  5e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4501  ribosomal protein S3  65.71 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  70.16 
 
 		 280 aa  356  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  78.92 
 
 		 286 aa  349  2e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  80.39 
 
 		 272 aa  350  2e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  77.94 
 
 		 325 aa  337  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  64.31 
 
 		 282 aa  337  9.999999999999999e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  77.45 
 
 		 315 aa  335  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  77.45 
 
 		 272 aa  332  3e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  72.2 
 
 		 276 aa  328  4e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  75.73 
 
 		 278 aa  328  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  75.98 
 
 		 292 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  73.79 
 
 		 270 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  73.04 
 
 		 268 aa  326  2.0000000000000001e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  74.27 
 
 		 288 aa  326  3e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20810  SSU ribosomal protein S3P  73.45 
 
 		 276 aa  325  5e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  73.53 
 
 		 278 aa  325  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0593  ribosomal protein S3  71.78 
 
 		 271 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.122908  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  68.22 
 
 		 276 aa  323  2e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  73.04 
 
 		 341 aa  322  4e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  70.25 
 
 		 258 aa  321  6e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  67.93 
 
 		 277 aa  321  9.000000000000001e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0633  ribosomal protein S3  70.56 
 
 		 279 aa  319  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17100  SSU ribosomal protein S3P  72.73 
 
 		 272 aa  318  7.999999999999999e-86  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0525637  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23750  SSU ribosomal protein S3P  74.16 
 
 		 280 aa  317  1e-85  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.167158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2653  ribosomal protein S3  72.32 
 
 		 276 aa  315  6e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1713  30S ribosomal protein S3  67.46 
 
 		 267 aa  284  8e-76  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0260  ribosomal protein S3  67.46 
 
 		 272 aa  284  8e-76  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  56.8 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 221 aa  255  5e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  57.67 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  53.42 
 
 		 237 aa  250  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  52.09 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  53.08 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  52.09 
 
 		 224 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  58.57 
 
 		 236 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  53.56 
 
 		 302 aa  246  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  56.8 
 
 		 244 aa  245  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  51.63 
 
 		 224 aa  244  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  52.56 
 
 		 220 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 237 aa  243  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  56.8 
 
 		 218 aa  242  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 214 aa  241  7.999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0707  30S ribosomal protein S3  52.86 
 
 		 210 aa  241  1e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000377493  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  52.43 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 216 aa  240  2e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  52.43 
 
 		 262 aa  239  2e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  51.6 
 
 		 221 aa  239  2e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  50.49 
 
 		 210 aa  240  2e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  53.4 
 
 		 210 aa  239  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  52.29 
 
 		 223 aa  239  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  52.91 
 
 		 211 aa  239  4e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  53.4 
 
 		 211 aa  239  4e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  49.33 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  57.28 
 
 		 249 aa  239  4e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  50.86 
 
 		 230 aa  238  5e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  52.43 
 
 		 211 aa  238  5.999999999999999e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  51.97 
 
 		 231 aa  238  5.999999999999999e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0404  ribosomal protein S3  57.56 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  52.43 
 
 		 211 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0873  30S ribosomal protein S3  52.11 
 
 		 221 aa  238  6.999999999999999e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000095133  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 218 aa  238  8e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 236 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  48.9 
 
 		 228 aa  237  1e-61  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  52.91 
 
 		 210 aa  237  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  54.37 
 
 		 218 aa  238  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 220 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  51.32 
 
 		 236 aa  236  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  49.79 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 236 aa  237  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2149  SSU ribosomal protein S3P  55.25 
 
 		 218 aa  237  2e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0519385  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2708  30S ribosomal protein S3  52.4 
 
 		 222 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2393  30S ribosomal protein S3  52.4 
 
 		 222 aa  237  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  53.88 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 232 aa  236  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  53.4 
 
 		 229 aa  236  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1789  SSU ribosomal protein S3P  49.79 
 
 		 234 aa  236  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.309908  normal  0.124892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  51.33 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 229 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3999  ribosomal protein S3  50.49 
 
 		 223 aa  236  4e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.217214  normal  0.669985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 226 aa  235  5.0000000000000005e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4684  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 229 aa  235  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000205507  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  51.83 
 
 		 232 aa  235  6e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  52.29 
 
 		 231 aa  235  6e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 275 aa  235  6e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  51.69 
 
 		 222 aa  234  8e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>