More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2653 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2653  ribosomal protein S3  100 
 
 		 276 aa  549  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  89.33 
 
 		 276 aa  442  1e-123  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0633  ribosomal protein S3  93.07 
 
 		 279 aa  434  1e-121  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  89.96 
 
 		 258 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0593  ribosomal protein S3  91.29 
 
 		 271 aa  422  1e-117  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.122908  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  77.41 
 
 		 282 aa  417  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  83.61 
 
 		 276 aa  405  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  84.35 
 
 		 277 aa  395  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20810  SSU ribosomal protein S3P  85.84 
 
 		 276 aa  393  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23750  SSU ribosomal protein S3P  80.24 
 
 		 280 aa  389  1e-107  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.167158  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17100  SSU ribosomal protein S3P  83.96 
 
 		 272 aa  373  1e-102  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0525637  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1713  30S ribosomal protein S3  77.58 
 
 		 267 aa  363  2e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0260  ribosomal protein S3  76.68 
 
 		 272 aa  361  9e-99  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4501  ribosomal protein S3  69.31 
 
 		 308 aa  360  2e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  67.25 
 
 		 278 aa  359  2e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  74.09 
 
 		 275 aa  358  4e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  74.8 
 
 		 288 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  80.95 
 
 		 272 aa  353  2e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  76.39 
 
 		 341 aa  353  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  80.66 
 
 		 292 aa  352  4e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  74.39 
 
 		 288 aa  352  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  69.86 
 
 		 279 aa  350  1e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  80.48 
 
 		 270 aa  350  1e-95  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  81.69 
 
 		 272 aa  349  3e-95  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  77.17 
 
 		 325 aa  347  8e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  77.62 
 
 		 268 aa  346  3e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  76.26 
 
 		 315 aa  345  6e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  78.67 
 
 		 278 aa  345  7e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  79.72 
 
 		 286 aa  344  8e-94  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  67.52 
 
 		 278 aa  343  2e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  79.52 
 
 		 288 aa  343  2e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  67.39 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  67.39 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  67.39 
 
 		 287 aa  342  4e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  78.87 
 
 		 268 aa  340  2e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  67.53 
 
 		 274 aa  340  2e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  77.93 
 
 		 280 aa  336  2.9999999999999997e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1191  30S ribosomal protein S3  72.32 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  58.29 
 
 		 221 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 219 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  54.88 
 
 		 243 aa  255  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  54.88 
 
 		 243 aa  255  7e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  57.82 
 
 		 237 aa  254  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 220 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  55.36 
 
 		 220 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  57.35 
 
 		 244 aa  252  6e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 262 aa  251  8.000000000000001e-66  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  54.88 
 
 		 237 aa  251  9.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  51.29 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  51.29 
 
 		 224 aa  250  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  54.79 
 
 		 218 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 260 aa  249  3e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  53.04 
 
 		 302 aa  249  4e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 228 aa  249  5e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 219 aa  248  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 211 aa  248  9e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1620  30S ribosomal protein S3  54.42 
 
 		 249 aa  248  9e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446751  normal  0.331477 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  50.86 
 
 		 224 aa  248  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0427  30S ribosomal protein S3  51.72 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.159032  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0762  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 244 aa  247  1e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00068895  normal  0.0518908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  53.02 
 
 		 210 aa  247  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 395 aa  247  2e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  58.49 
 
 		 222 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04515  30S ribosomal protein S3  49.39 
 
 		 244 aa  246  2e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000471597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  54.88 
 
 		 236 aa  246  3e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 211 aa  246  3e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  53.08 
 
 		 210 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  50.86 
 
 		 228 aa  246  4e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  50.64 
 
 		 224 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  47.72 
 
 		 241 aa  245  6e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  53.49 
 
 		 236 aa  245  6.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1698  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000141955  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1869  30S ribosomal protein S3  52.97 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.437759  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0065  30S ribosomal protein S3  52.12 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00223028  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 210 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0292  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00457089  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 218 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  53.02 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  51.03 
 
 		 239 aa  244  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  53.49 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06310  30S ribosomal protein S3  50.66 
 
 		 228 aa  243  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.91278  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  56.4 
 
 		 219 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0404  ribosomal protein S3  54.2 
 
 		 288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 214 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  55.61 
 
 		 226 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  51.53 
 
 		 228 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  51.53 
 
 		 228 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  53.55 
 
 		 211 aa  243  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  51.53 
 
 		 228 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  51.53 
 
 		 228 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  55.92 
 
 		 219 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>