More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4501 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4501  ribosomal protein S3  100 
 
 		 308 aa  621  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1129  ribosomal protein S3  79.14 
 
 		 279 aa  421  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3917  ribosomal protein S3  76.79 
 
 		 288 aa  415  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.490752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1046  30S ribosomal protein S3  79.46 
 
 		 287 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4309  ribosomal protein S3  80.95 
 
 		 288 aa  411  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395435  hitchhiker  0.00385634 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1019  30S ribosomal protein S3  79.46 
 
 		 287 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1036  30S ribosomal protein S3  79.46 
 
 		 287 aa  412  1e-114  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.261714  normal  0.488282 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10721  30S ribosomal protein S3  80.78 
 
 		 274 aa  412  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.680794  normal  0.235718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5043  30S ribosomal protein S3  80 
 
 		 278 aa  408  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.084323  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6608  ribosomal protein S3  81.42 
 
 		 275 aa  409  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3429  ribosomal protein S3  77.74 
 
 		 268 aa  405  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1311  30S ribosomal protein S3  77.82 
 
 		 280 aa  403  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3752  ribosomal protein S3  81.85 
 
 		 272 aa  399  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6043  30S ribosomal protein S3  82.59 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.136813 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0588  30S ribosomal protein S3  81.78 
 
 		 315 aa  396  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4315  ribosomal protein S3  88.84 
 
 		 272 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04040  SSU ribosomal protein S3P  70 
 
 		 286 aa  393  1e-108  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0568  30S ribosomal protein S3  74.17 
 
 		 278 aa  388  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1092  SSU ribosomal protein S3P  88.57 
 
 		 288 aa  384  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0581638 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0937  30S ribosomal protein S3  83.63 
 
 		 292 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3899  30S ribosomal protein S3  87.62 
 
 		 278 aa  384  1e-106  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0694  ribosomal protein S3  70.93 
 
 		 282 aa  383  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.429613 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5130  ribosomal protein S3  85.92 
 
 		 268 aa  378  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.805435 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2640  30S ribosomal protein S3  87.38 
 
 		 270 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.659159  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0312  30S ribosomal protein S3  70.14 
 
 		 341 aa  380  1e-104  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00243469 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2681  ribosomal protein S3  78.57 
 
 		 276 aa  375  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3137  ribosomal protein S3  78.93 
 
 		 258 aa  374  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29680  SSU ribosomal protein S3P  84.98 
 
 		 276 aa  373  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.778759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2969  SSU ribosomal protein S3P  78.33 
 
 		 277 aa  374  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.530475  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23750  SSU ribosomal protein S3P  76 
 
 		 280 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.167158  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20810  SSU ribosomal protein S3P  80.8 
 
 		 276 aa  370  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0593  ribosomal protein S3  75.49 
 
 		 271 aa  366  1e-100  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.122908  normal  0.632593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0633  ribosomal protein S3  83.1 
 
 		 279 aa  365  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2653  ribosomal protein S3  80.91 
 
 		 276 aa  362  4e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17100  SSU ribosomal protein S3P  81.22 
 
 		 272 aa  361  8e-99  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0525637  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1191  30S ribosomal protein S3  68.65 
 
 		 265 aa  352  5e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.124427 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1713  30S ribosomal protein S3  70.45 
 
 		 267 aa  322  6e-87  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.295513  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0260  ribosomal protein S3  70.89 
 
 		 272 aa  317  2e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2172  ribosomal protein S3  60.73 
 
 		 237 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.686933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23410  SSU ribosomal protein S3P  60.73 
 
 		 244 aa  272  5.000000000000001e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000415625  hitchhiker  0.000000143523 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  58.94 
 
 		 219 aa  265  7e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0221  30S ribosomal protein S3  59.05 
 
 		 221 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000649554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  58.49 
 
 		 219 aa  259  5.0000000000000005e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0404  ribosomal protein S3  62.5 
 
 		 288 aa  258  7e-68  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09940  SSU ribosomal protein S3P  56.16 
 
 		 235 aa  256  4e-67  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.257564  hitchhiker  0.00000258289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4921  ribosomal protein S3  56.62 
 
 		 230 aa  256  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0969238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1179  ribosomal protein S3  51.25 
 
 		 262 aa  256  4e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.484191  normal  0.192694 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0686  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 210 aa  256  4e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.15256  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2851  30S ribosomal protein S3  57.49 
 
 		 211 aa  256  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.588721  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1940  SSU ribosomal protein S3P  54.59 
 
 		 224 aa  256  5e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1155  ribosomal protein S3  57.78 
 
 		 236 aa  255  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000113812  hitchhiker  0.0000354115 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2024  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.145772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0292  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 220 aa  254  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0100891  normal  0.0448261 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0632  30S ribosomal protein S3  57.49 
 
 		 211 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000111736  hitchhiker  0.00000000169292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1939  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 224 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  57.21 
 
 		 214 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  55.12 
 
 		 210 aa  254  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4020  ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 260 aa  254  2.0000000000000002e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.251089  hitchhiker  0.00000649383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0939  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 211 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0016445  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  57.49 
 
 		 395 aa  254  2.0000000000000002e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3322  30S ribosomal protein S3  55.45 
 
 		 211 aa  253  3e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000677184 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1073  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 210 aa  253  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000789266  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  56.48 
 
 		 218 aa  253  3e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  57.55 
 
 		 220 aa  253  4.0000000000000004e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  55.77 
 
 		 243 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  56.28 
 
 		 218 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  54.05 
 
 		 243 aa  252  6e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0714  ribosomal protein S3  57.89 
 
 		 216 aa  252  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1739  ribosomal protein S3  58.88 
 
 		 222 aa  252  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032444  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1917  ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 224 aa  251  1e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.652876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3018  ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 241 aa  251  1e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0195481  hitchhiker  0.00883263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  56.87 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1352  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 210 aa  250  2e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.112713  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 221 aa  249  3e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2742  ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 236 aa  249  5e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0769117  normal  0.282476 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0764  ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 222 aa  248  1e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000320467  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  53.95 
 
 		 218 aa  248  1e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 217 aa  247  2e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 237 aa  247  2e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  55.14 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  55.14 
 
 		 228 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  54.5 
 
 		 275 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  53.14 
 
 		 223 aa  246  4e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 217 aa  246  4.9999999999999997e-64  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1232  SSU ribosomal protein S3P  53.95 
 
 		 223 aa  245  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855016 
 
 
-
 
NC_004310  BR1227  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 236 aa  245  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1190  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 236 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.505829  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2768  30S ribosomal protein S3  54.11 
 
 		 212 aa  244  9e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000286487  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0460  30S ribosomal protein S3  53.1 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  unclonable  0.00000018203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0490  30S ribosomal protein S3  53.1 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.208972  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0493  30S ribosomal protein S3  53.1 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000464846  normal  0.111354 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1962  30S ribosomal protein S3  54.33 
 
 		 236 aa  244  9.999999999999999e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  53.33 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1360  ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 241 aa  244  9.999999999999999e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253201  normal  0.0370461 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2909  SSU ribosomal protein S3P  52.88 
 
 		 226 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3156  30S ribosomal protein S3  54.03 
 
 		 254 aa  244  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  52.34 
 
 		 222 aa  244  9.999999999999999e-64  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  56.25 
 
 		 229 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4743  30S ribosomal protein S3  53.1 
 
 		 228 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0129797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  54.81 
 
 		 231 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>