More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_05745 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_05745  putative 30S ribosomal protein S3  100 
 
 		 236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0959126  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0391  30S ribosomal protein S3  87.78 
 
 		 252 aa  401  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1153  30S ribosomal protein S3  84.35 
 
 		 246 aa  399  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000018962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4349  30S ribosomal protein S3  72.43 
 
 		 275 aa  330  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122787  normal  0.048354 
 
 
-
 
NC_002950  PG1932  30S ribosomal protein S3  70.59 
 
 		 246 aa  329  2e-89  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5781  ribosomal protein S3  70.09 
 
 		 302 aa  323  2e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.336905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3156  30S ribosomal protein S3  69.91 
 
 		 254 aa  319  1.9999999999999998e-86  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.65741 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0608  ribosomal protein S3  71.93 
 
 		 285 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0191  30S ribosomal protein S3  63.55 
 
 		 240 aa  291  7e-78  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.339095 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0848  ribosomal protein S3  63.08 
 
 		 249 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1621  ribosomal protein S3  67.13 
 
 		 266 aa  281  8.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1477  30S ribosomal protein S3  58.48 
 
 		 221 aa  264  8e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000764619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0117  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 218 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00121985  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0113  30S ribosomal protein S3  62.14 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0110  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  5.0000000000000005e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000133483  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1901  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 		 217 aa  258  6e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.563087  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5189  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000094199  unclonable  1.62141e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0116  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000978645  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0116  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000111227  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0112  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.8436400000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0110  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0116  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000165133  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0147  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000084584  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0128  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.11451e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0137  30S ribosomal protein S3  60.68 
 
 		 219 aa  258  7e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0064  30S ribosomal protein S3  58.77 
 
 		 217 aa  257  9e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00697995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0111  30S ribosomal protein S3  61.17 
 
 		 219 aa  257  9e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000062196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2396  30S ribosomal protein S3  59.22 
 
 		 217 aa  254  9e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0132783  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2705  ribosomal protein S3  58.02 
 
 		 226 aa  252  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1518  ribosomal protein S3  55.31 
 
 		 220 aa  250  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0297  30S ribosomal protein S3  56.07 
 
 		 222 aa  249  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.5955900000000001e-28 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3661  30S ribosomal protein S3  51.49 
 
 		 235 aa  248  4e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2682  30S ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 223 aa  246  2e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.631752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0475  30S ribosomal protein S3  54.67 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00134596  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2454  30S ribosomal protein S3  56.67 
 
 		 219 aa  245  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5064  30S ribosomal protein S3  51.05 
 
 		 236 aa  245  4e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.46978 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3442  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0333  ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 228 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.226722  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0503  ribosomal protein S3  56.31 
 
 		 220 aa  245  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.216514  hitchhiker  0.000000000339097 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2312  30S ribosomal protein S3  55.87 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000168649  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2271  30S ribosomal protein S3  55.87 
 
 		 217 aa  244  6e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000428524  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2301  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 232 aa  244  6e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371999  normal  0.117163 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01230  ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 214 aa  244  6.999999999999999e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.845852  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1370  30S ribosomal protein S3  51.3 
 
 		 231 aa  244  8e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0876936  normal  0.564584 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0231  ribosomal protein S3  54.98 
 
 		 218 aa  244  8e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1672  30S ribosomal protein S3  50.21 
 
 		 235 aa  244  9e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.356257  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3178  30S ribosomal protein S3  55.56 
 
 		 232 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1551  30S ribosomal protein S3  51.06 
 
 		 231 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2812  30S ribosomal protein S3  53.74 
 
 		 235 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.102151  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1436  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0795815  normal  0.0645739 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1338  30S ribosomal protein S3  55.07 
 
 		 243 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0464681  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1346  ribosomal protein S3  53.4 
 
 		 395 aa  242  3e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0428  30S ribosomal protein S3  52.53 
 
 		 219 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00750639  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0765  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 240 aa  241  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0970425  normal  0.512197 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1825  30S ribosomal protein S3  54.93 
 
 		 217 aa  241  6e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.652235  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0326  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 232 aa  241  7e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364603  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2972  30S ribosomal protein S3  53.05 
 
 		 225 aa  241  9e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.845651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0200  SSU ribosomal protein S3P  53.88 
 
 		 229 aa  240  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0421793  normal  0.0820646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1347  30S ribosomal protein S3  54.21 
 
 		 231 aa  240  1e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0992  30S ribosomal protein S3  51.53 
 
 		 237 aa  240  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0174099 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0411  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0239377  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3816  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000890302  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3903  30S ribosomal protein S3  54.19 
 
 		 228 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0436883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0255  30S ribosomal protein S3  56.52 
 
 		 239 aa  241  1e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0853  SSU ribosomal protein S3P  53.33 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000111374  hitchhiker  0.000095719 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3995  30S ribosomal protein S3  54.55 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0672  30S ribosomal protein S3  48.52 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000114905  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0632  ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00163492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4542  30S ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0289  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000655466  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5073  30S ribosomal protein S3  56.68 
 
 		 228 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000216562  normal  0.14822 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0301  ribosomal protein S3  53.88 
 
 		 228 aa  240  2e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00276484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0966  30S ribosomal protein S3  56.94 
 
 		 224 aa  240  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0153824  hitchhiker  0.00000134918 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0288  30S ribosomal protein S3  56.04 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0590  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336971  normal  0.465615 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0065  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 235 aa  239  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0358705  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0329  30S ribosomal protein S3  54.07 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000157005  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3332  30S ribosomal protein S3  50.85 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000390716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3909  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 232 aa  239  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000178804  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0704  30S ribosomal protein S3  48.52 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000220755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0219  30S ribosomal protein S3  51.72 
 
 		 230 aa  239  2e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000284252  unclonable  0.00000795871 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0164  30S ribosomal protein S3  54.59 
 
 		 229 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000022982  decreased coverage  0.0000484078 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001736  SSU ribosomal protein S3p (S3e)  50.43 
 
 		 232 aa  239  2.9999999999999997e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000123717  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03165  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00374176  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0399  ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000257024  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3745  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000025032  hitchhiker  0.00113301 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4637  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00278022  normal  0.0942567 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3699  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000153229  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3703  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00180602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03116  hypothetical protein  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00261004  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0843  30S ribosomal protein S3  55.96 
 
 		 228 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.401464  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3630  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000937087  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3801  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0443981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3797  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000046077  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3630  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0724577  normal  0.691725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3738  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.338082  normal  0.0279522 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08910  30S ribosomal protein S3  55.96 
 
 		 228 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0180544 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0399  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000141068  hitchhiker  0.0000729403 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3508  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000538349  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3609  30S ribosomal protein S3  53.59 
 
 		 233 aa  239  4e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000291269  normal  0.0112128 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>