More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1142 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1142  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 362 aa  746    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00531718  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1187  hypothetical protein  51.38 
 
 		 387 aa  379  1e-104  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.289256  normal  0.0319746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3441  Fe-S oxidoreductase of MoeA/NarA subfamily  37.88 
 
 		 357 aa  273  3e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0447995 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1646  radical SAM family protein  40.69 
 
 		 368 aa  259  6e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0694  Radical SAM domain protein  42.63 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2185  Radical SAM domain protein  38.43 
 
 		 465 aa  206  7e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000136766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1095  Radical SAM domain protein  36.33 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1786  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 461 aa  196  6e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00175459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1293  radical SAM domain-containing protein  34.65 
 
 		 446 aa  193  5e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000719157  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1545  Radical SAM domain protein  36.3 
 
 		 466 aa  191  1e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00659199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1725  radical SAM domain-containing protein  31.76 
 
 		 460 aa  188  1e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04410  Radical SAM domain protein  35 
 
 		 450 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0231  radical SAM family protein  35.23 
 
 		 479 aa  184  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.721774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16100  Radical SAM domain protein  36.65 
 
 		 462 aa  182  1e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0244  radical SAM domain-containing protein  31.49 
 
 		 458 aa  179  4.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0555  Radical SAM domain protein  33.1 
 
 		 451 aa  176  5e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000580773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  31.17 
 
 		 465 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0970  Radical SAM domain protein  31.2 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0606739  normal  0.0894682 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1687  radical SAM family protein  30.84 
 
 		 460 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00336089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0177  hypothetical protein  30.89 
 
 		 471 aa  171  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00580  predicted Fe-S oxidoreductase  31.56 
 
 		 477 aa  169  5e-41  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2208  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 460 aa  166  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0601  Radical SAM domain protein  33.45 
 
 		 486 aa  166  4e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.772105 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0103  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 482 aa  159  8e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1725  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000123553  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0102  radical SAM domain-containing protein  31.83 
 
 		 482 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0073  radical SAM family Fe-S protein  33.21 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0170  radical SAM family Fe-S protein  33.21 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1163  radical SAM domain-containing protein  31.19 
 
 		 482 aa  153  5e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00933286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0183  radical SAM domain-containing protein  32.7 
 
 		 481 aa  153  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0165  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2841  Radical SAM domain protein  25.57 
 
 		 410 aa  102  8e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4009  radical SAM domain-containing protein  27.04 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.91 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 		 380 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  25.25 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 		 418 aa  75.9  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 407 aa  75.1  0.000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.519712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  24.78 
 
 		 479 aa  73.9  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0259  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 1005 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.285156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.55 
 
 		 501 aa  73.6  0.000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2362  Radical SAM domain protein  27.04 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000000979641  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  27.41 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  26.83 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  25.99 
 
 		 410 aa  68.9  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  26.01 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  30.73 
 
 		 565 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  26.69 
 
 		 389 aa  68.9  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.06 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0533  radical SAM family protein  27.68 
 
 		 510 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  25.63 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.33 
 
 		 496 aa  68.2  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  26.73 
 
 		 393 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.25 
 
 		 381 aa  67.4  0.0000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  24.91 
 
 		 375 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  25.83 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  25.94 
 
 		 330 aa  67  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  24.28 
 
 		 349 aa  67  0.0000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.08 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  24.52 
 
 		 347 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3154  radical SAM family protein  25.55 
 
 		 367 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04330  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 336 aa  66.2  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.46 
 
 		 325 aa  66.2  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2198  radical SAM domain-containing protein  25.1 
 
 		 373 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0314345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  27.08 
 
 		 387 aa  66.2  0.0000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2081  Radical SAM domain protein  27.16 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.214481  normal  0.184464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  28.48 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  24.65 
 
 		 367 aa  65.9  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.49 
 
 		 407 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  26.9 
 
 		 397 aa  65.9  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  27.13 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  27.32 
 
 		 395 aa  65.5  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  29.44 
 
 		 378 aa  65.1  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.81 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.41 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0689  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.54 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.62446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  25.39 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  25.93 
 
 		 373 aa  65.1  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.4 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  23.51 
 
 		 359 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  28.3 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0955  radical SAM domain-containing protein  21.97 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 		 377 aa  63.5  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2761  radical SAM domain-containing protein  30.23 
 
 		 348 aa  63.5  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0874334  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  23.68 
 
 		 335 aa  63.5  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  22.68 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 384 aa  63.2  0.000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  23.17 
 
 		 480 aa  63.2  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1706  radical SAM domain-containing protein  27.1 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.971724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.66 
 
 		 327 aa  62.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8972  Radical SAM domain protein  25 
 
 		 364 aa  62.4  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2359  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.15 
 
 		 378 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.75 
 
 		 323 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  27.06 
 
 		 418 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>