123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3986 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4442  glycyl aminopeptidase  49.6 
 
 
682 aa  636    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0105  peptidase M61 domain-containing protein  54.19 
 
 
642 aa  694    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.953091  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3986  peptidase M61 domain-containing protein  100 
 
 
644 aa  1318    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00005  PDZ domain family protein  54.84 
 
 
626 aa  674    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1128  peptidase M61 domain protein  53.01 
 
 
627 aa  643    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.144459  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0685  peptidase M61 domain protein  54.09 
 
 
660 aa  701    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00148081 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2716  peptidase M61  49.69 
 
 
693 aa  627  1e-178  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.944293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4782  peptidase M61 domain-containing protein  50.25 
 
 
635 aa  627  1e-178  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.300179 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0290  glycyl aminopeptidase  48.1 
 
 
650 aa  619  1e-176  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2029  peptidase M61 domain protein  50.75 
 
 
632 aa  603  1.0000000000000001e-171  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1119  peptidase M61 domain-containing protein  49.17 
 
 
640 aa  571  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0159239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2252  peptidase M61 domain protein  35.23 
 
 
623 aa  359  9e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.205983  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2163  peptidase M61 domain protein  35.14 
 
 
623 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1693  glycyl aminopeptidase  35.48 
 
 
622 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.887266  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4827  peptidase M61 domain-containing protein  26.02 
 
 
585 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1394  PDZ/DHR/GLGF  25.6 
 
 
587 aa  112  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.54966  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3762  peptidase M61 domain-containing protein  24.19 
 
 
594 aa  112  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0112026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1433  peptidase M61 domain protein  24.83 
 
 
591 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0309  peptidase M61 domain protein  24.6 
 
 
585 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.829558  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3082  peptidase M61 domain-containing protein  23.47 
 
 
600 aa  102  2e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.201317  hitchhiker  0.00967911 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3184  peptidase M61 domain-containing protein  22.96 
 
 
601 aa  100  6e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.152326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0145  peptidase M61  23.7 
 
 
594 aa  100  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3456  peptidase M61 domain-containing protein  23.62 
 
 
601 aa  99.8  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.243509  decreased coverage  0.0000586563 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2554  peptidase M61  25.65 
 
 
616 aa  99.8  2e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000699097  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1038  peptidase M61  23.5 
 
 
600 aa  99.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2766  peptidase M61 domain protein  29.36 
 
 
623 aa  98.2  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.612907 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2890  hypothetical protein  25.69 
 
 
621 aa  97.4  8e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.633242  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3132  peptidase M61 domain protein  24.53 
 
 
623 aa  96.7  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.831871 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3734  peptidase M61 domain protein  26.61 
 
 
596 aa  95.1  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.393831  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3033  PDZ/DHR/GLGF:peptidase M61  25.36 
 
 
612 aa  94.4  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2772  peptidase M61 domain-containing protein  23.49 
 
 
608 aa  93.6  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.919239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3307  peptidase M61 domain-containing protein  25.28 
 
 
598 aa  92.8  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0838775  hitchhiker  0.0000441235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2037  peptidase M61 domain protein  22.41 
 
 
618 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129512 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3188  peptidase M61  31.77 
 
 
604 aa  91.7  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0264  peptidase M61 domain-containing protein  23.9 
 
 
578 aa  90.5  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.023247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2882  peptidase M61 domain-containing protein  23.83 
 
 
603 aa  89.7  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0208094  hitchhiker  0.0000100576 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2416  peptidase M61  21.67 
 
 
624 aa  89  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.353738  normal  0.453663 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2972  peptidase M61 domain-containing protein  23.54 
 
 
601 aa  88.6  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0085127  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3503  peptidase M61 domain protein  25.42 
 
 
596 aa  87.4  8e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.835737  hitchhiker  0.00306179 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3297  peptidase M61 domain protein  23.71 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.910751  normal  0.542391 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2803  peptidase M61 domain protein  23.71 
 
 
601 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2780  peptidase M61 domain-containing protein  23.16 
 
 
603 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.226266  hitchhiker  0.00190153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2301  peptidase M61 domain protein  24.09 
 
 
615 aa  85.9  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.9294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1447  protease, putative  23.68 
 
 
587 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.747842  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4799  peptidase M61 domain protein  25.41 
 
 
590 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1882  peptidase M61  25.41 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.347661  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0306  peptidase M61 domain protein  24.09 
 
 
602 aa  84.7  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.152867  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0454  metalloprotease, zinc binding  28.49 
 
 
596 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.573755 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2867  peptidase M61 domain-containing protein  26.23 
 
 
600 aa  84.7  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  0.558935 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2984  peptidase M61 domain protein  22.91 
 
 
605 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.536763  hitchhiker  0.000251259 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3614  peptidase M61  26.97 
 
 
599 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.900559 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1217  peptidase M61  23.31 
 
 
601 aa  83.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0353821  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1653  peptidase M61 domain-containing protein  25 
 
 
592 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.283043  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0499  peptidase M61 domain-containing protein  27.27 
 
 
599 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2578  peptidase M61  27.27 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2712  peptidase M61 domain-containing protein  22.98 
 
 
603 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529287  hitchhiker  0.00000288485 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0527  peptidase M61 domain-containing protein  27.27 
 
 
599 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0883  peptidase M61 domain-containing protein  23.08 
 
 
597 aa  82  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.374463  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2752  peptidase M61 domain-containing protein  21.35 
 
 
598 aa  82  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.733625  hitchhiker  0.000408122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0594  peptidase  24.11 
 
 
571 aa  81.6  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.154307  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0456  peptidase M61 domain-containing protein  26.97 
 
 
599 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0474083 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3368  peptidase M61 domain-containing protein  24.15 
 
 
600 aa  81.3  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.428064  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2724  protease, putative  23.81 
 
 
588 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0432  peptidase M61 domain-containing protein  27.88 
 
 
622 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2916  PDZ domain-containing protein  27.76 
 
 
590 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1493  peptidase M61  26 
 
 
604 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.333369  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2508  peptidase M61 domain-containing protein  24.4 
 
 
588 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000376919 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1530  peptidase M61 domain-containing protein  23.49 
 
 
641 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.265264 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3323  peptidase M61 domain protein  23.58 
 
 
689 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0788147  decreased coverage  0.00902527 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2090  peptidase M61 domain-containing protein  24.16 
 
 
631 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.716392  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1361  peptidase M61 domain-containing protein  22.72 
 
 
605 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.223478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2705  peptidase M61 domain-containing protein  28.85 
 
 
597 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.754502  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2315  peptidase M61 domain-containing protein  24.11 
 
 
588 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.261974  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1400  peptidase M61 domain-containing protein  22.72 
 
 
605 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0529885  decreased coverage  0.00282724 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3582  peptidase  26.03 
 
 
612 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.955515  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3346  peptidase M61 domain-containing protein  26.79 
 
 
585 aa  77.8  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1293  peptidase M61 domain-containing protein  21.48 
 
 
603 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00192271  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3590  PDZ domain-containing protein  25.47 
 
 
609 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2932  peptidase M61 domain protein  22.61 
 
 
593 aa  77  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.500697  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2385  peptidase M61 domain-containing protein  23.87 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3563  PDZ domain-containing protein  25.47 
 
 
609 aa  77  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1789  peptidase M61 domain-containing protein  24.17 
 
 
588 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.119703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1833  peptidase M61 domain-containing protein  24.17 
 
 
588 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.180566  normal  0.794619 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2489  peptidase M61 domain protein  24.35 
 
 
588 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3534  M61 family peptidase  24.11 
 
 
610 aa  75.9  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0526  PDZ domain-containing protein  25.16 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0651  PDZ domain-containing protein  25.16 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0947  PDZ domain-containing protein  25.16 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1375  peptidase M61 domain-containing protein  22.7 
 
 
605 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0830083  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1917  PDZ domain-containing protein  25.16 
 
 
609 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4157  peptidase M61 domain protein  23.15 
 
 
497 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3622  peptidase M61 domain-containing protein  22.58 
 
 
593 aa  75.1  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1797  peptidase M61 domain-containing protein  22.46 
 
 
588 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0284  protease  26.89 
 
 
661 aa  74.3  0.000000000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3407  peptidase M61 domain protein  25.65 
 
 
584 aa  73.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2138  PDZ domain protein  23.9 
 
 
617 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0462  peptidase M61 domain-containing protein  21.95 
 
 
592 aa  73.2  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1797  peptidase M61 domain protein  23.9 
 
 
607 aa  72.4  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2389  peptidase M61  22.62 
 
 
616 aa  72.4  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3288  peptidase M61  27.34 
 
 
585 aa  70.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>