More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3930 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3930  RND family efflux transporter MFP subunit  100 
 
 		 352 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.185185 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1536  RND family efflux transporter MFP subunit  37.14 
 
 		 367 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6009  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.3 
 
 		 356 aa  150  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359632  normal  0.895367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3982  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.45 
 
 		 356 aa  143  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.870184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1001  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.23 
 
 		 347 aa  136  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.612781  normal  0.0455845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0508  RND family efflux transporter MFP subunit  33.33 
 
 		 363 aa  125  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5033  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 		 340 aa  119  9.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4327  HlyD family secretion protein  28.98 
 
 		 372 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3340  efflux transporter, RND family, MFP subunit  33.54 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0372  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 372 aa  105  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1067  secretion protein HlyD  28.61 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.133207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3410  secretion protein HlyD  30.53 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.795724  normal  0.633009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0166  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.59 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.64 
 
 		 356 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.38 
 
 		 376 aa  99.8  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3002  membrane-fusion protein, component of multidrug efflux system  30.22 
 
 		 367 aa  99.4  8e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01875  hypothetical protein  25.66 
 
 		 343 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2040  RND family mulitdrug efflux protein  30.31 
 
 		 358 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.428821  normal  0.886334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2781  RND family efflux transporter MFP subunit  27.41 
 
 		 372 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00032103  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0466  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 372 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.808341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0609  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.06 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.593708  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3268  HlyD family secretion protein  28 
 
 		 372 aa  95.1  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2027  secretion protein HlyD  32.97 
 
 		 390 aa  95.9  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.423658  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1048  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.15 
 
 		 367 aa  95.5  1e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0768467 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2243  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 376 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  29.46 
 
 		 369 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3351  RND family efflux transporter MFP subunit  29.7 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4207  RND family efflux transporter MFP subunit  30.21 
 
 		 366 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.647045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1122  RND family efflux transporter MFP subunit  30.65 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1516  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.21 
 
 		 366 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1653  putative transport/efflux transmembrane protein  30.84 
 
 		 402 aa  92.8  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.493931 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3758  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 		 379 aa  92.8  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003811  membrane-fusion protein  26.39 
 
 		 343 aa  92.4  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.07 
 
 		 377 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5381  RND family efflux transporter MFP subunit  30 
 
 		 364 aa  92  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.996751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0235  RND efflux membrane fusion protein precursor  29.64 
 
 		 356 aa  92  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0090  putative multidrug transporter, HlyD family  26.36 
 
 		 368 aa  91.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3707  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.87 
 
 		 354 aa  91.7  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1676  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.9 
 
 		 367 aa  91.7  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1660  RND family efflux transporter MFP subunit  28.69 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  25.78 
 
 		 354 aa  90.9  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 405 aa  90.9  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.5 
 
 		 358 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  26.78 
 
 		 354 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2171  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.79 
 
 		 357 aa  89.7  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.434682  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1177  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 		 417 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5274  RND family efflux transporter MFP subunit  29.25 
 
 		 377 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0726879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  29.38 
 
 		 410 aa  89  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1462  RND family efflux transporter MFP subunit  31.3 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  25.15 
 
 		 354 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3470  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.85 
 
 		 379 aa  88.6  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3539  RND family efflux transporter MFP subunit  30.11 
 
 		 392 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1943  secretion protein HlyD  29.53 
 
 		 523 aa  89  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.354822  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1520  RND family efflux transporter MFP subunit  27.3 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.289277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1079  secretion protein HlyD  27.3 
 
 		 366 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.984606 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.91 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5035  HlyD family secretion protein  27.65 
 
 		 396 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.611497 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2289  RND family efflux transporter MFP subunit  28.41 
 
 		 371 aa  88.2  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.412391  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.37 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4149  RND family efflux transporter MFP subunit  24.7 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.815582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3483  HlyD family secretion protein  25.75 
 
 		 369 aa  87.4  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2553  hypothetical protein  29.22 
 
 		 368 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2234  RND family efflux transporter MFP subunit  26.42 
 
 		 407 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.282252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  26.91 
 
 		 354 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2038  secretion protein HlyD  30.81 
 
 		 357 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.213803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1281  RND family efflux transporter MFP subunit  30.68 
 
 		 386 aa  87.4  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1044  RND family efflux transporter MFP subunit  27.7 
 
 		 361 aa  87  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0011899  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1125  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.18 
 
 		 417 aa  86.7  6e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0255605  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1462  RND efflux membrane fusion protein precursor  31.34 
 
 		 367 aa  86.3  7e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6340  secretion protein HlyD  27.56 
 
 		 369 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  25.29 
 
 		 405 aa  86.3  7e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2103  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 		 403 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0796794  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1739  RND family efflux transporter MFP subunit  27.56 
 
 		 369 aa  86.3  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.357806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.93 
 
 		 370 aa  86.3  7e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.143794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  26.63 
 
 		 354 aa  86.3  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1870  secretion protein HlyD  26.58 
 
 		 427 aa  85.9  9e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2282  secretion protein HlyD  27.66 
 
 		 467 aa  85.9  9e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1893  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.227434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1564  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.82 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.18238  normal  0.253617 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0954  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.31 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2786  RND family efflux transporter MFP subunit  24.26 
 
 		 372 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000125206  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2162  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  28.02 
 
 		 383 aa  85.5  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3475  secretion protein HlyD-like protein  25.07 
 
 		 373 aa  85.9  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.555415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1309  efflux protein  27.38 
 
 		 364 aa  85.5  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2295  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 371 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  25.72 
 
 		 376 aa  85.5  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001980  probable RND efflux membrane fusion protein  24.85 
 
 		 367 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.979341  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1084  RND family efflux transporter MFP subunit  24.57 
 
 		 370 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0120074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2615  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.76 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2115  RND family efflux transporter MFP subunit  27.06 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.243289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16800  putative efflux transmembrane protein  31.04 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0868415  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44050  multidrug efflux pump membrane fusion protein  30.53 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  30.6 
 
 		 370 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1280  putative multidrug resistance protein  26.33 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4143  RND family efflux transporter MFP subunit  25.07 
 
 		 343 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.478516 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>