204 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2969 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2969  electron transport protein SCO1/SenC  100 
 
 
241 aa  484  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000412315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0931  electron transport protein SCO1/SenC  44.7 
 
 
248 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1572  electron transport protein SCO1/SenC  47.03 
 
 
250 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.304694  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5990  electron transport protein SCO1/SenC  31.86 
 
 
240 aa  84.7  0.000000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1801  electron transport protein SCO1/SenC  33.95 
 
 
291 aa  82.8  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.53156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2459  SCO1/SenC family protein  35.95 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1663  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 
228 aa  79.7  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3487  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108073  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2284  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2450  electron transport protein SCO1/SenC  35.29 
 
 
221 aa  78.6  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0486605  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0650  electron transport protein SCO1/SenC  38.32 
 
 
340 aa  77.4  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3890  electron transport protein SCO1/SenC  36.42 
 
 
228 aa  77  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1172  electron transport protein SCO1/SenC  34.01 
 
 
283 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0048  electron transport protein SCO1/SenC  35.14 
 
 
208 aa  76.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5677  electron transport protein SCO1/SenC  31.54 
 
 
236 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0663  electron transport protein SCO1/SenC  28.49 
 
 
197 aa  73.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2865  electron transport protein SCO1/SenC  30.48 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0177907 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2002  electron transport protein SCO1/SenC  35.45 
 
 
363 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.446377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0070  hypothetical protein  32.7 
 
 
198 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0216  protein of unknown function DUF420  27.78 
 
 
444 aa  67.4  0.0000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.614446  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2200  hypothetical protein  25.66 
 
 
223 aa  67  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.911586  normal  0.909176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1479  electron transport protein SCO1/SenC  29.93 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0851  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.34 
 
 
206 aa  66.2  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3047  electron transport protein SCO1/SenC  28.76 
 
 
282 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1978  hypothetical protein  32.24 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.572357 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2583  electron transport protein SCO1/SenC  25.49 
 
 
190 aa  64.7  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5207  electron transport protein SCO1/SenC  26.47 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.723595  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1125  electron transport protein SCO1/SenC  33.14 
 
 
247 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.195458  normal  0.850064 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2666  electron transport protein SCO1/SenC  30.84 
 
 
327 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.239586  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2077  electron transport protein SCO1/SenC  31.47 
 
 
296 aa  63.2  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0831544  normal  0.489667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1063  electron transport protein SCO1/SenC  42.86 
 
 
198 aa  63.2  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0524387 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3183  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.106344  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2533  electron transport protein SCO1/SenC  26.06 
 
 
327 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5562  electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
210 aa  62  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6095  electron transport protein SCO1/SenC  25.35 
 
 
213 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1650  electron transport protein SCO1/SenC  24.86 
 
 
194 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000270735  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1728  hypothetical protein  30.72 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  hitchhiker  0.00827926  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1400  electron transport protein SCO1/SenC  26.17 
 
 
231 aa  59.7  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.951377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2072  electron transport protein SCO1/SenC  24.74 
 
 
195 aa  59.3  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0311949  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2231  SCO1/SenC family lipoprotein  25 
 
 
195 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00820303  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1225  electron transport protein SCO1/SenC  31.17 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0960  electron transport protein SCO1/SenC  21.23 
 
 
221 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3093  SCO1/SenC family lipoprotein  25 
 
 
195 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000903349  decreased coverage  9.893850000000001e-24 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2093  lipoprotein  25.13 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0265968  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2033  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.13 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000016443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2031  cytochrome c oxidase Cu(A) center assembly protein  25.13 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0152904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2249  lipoprotein  25.13 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00171522  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2665  electron transport protein SCO1/SenC  28.06 
 
 
204 aa  57.8  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00000706149  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3492  electron transport protein SCO1/SenC  34.43 
 
 
211 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.1904 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2274  SCO1/SenC family lipoprotein  25.13 
 
 
195 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.19701e-47 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2278  lipoprotein  25.39 
 
 
195 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000821147  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2359  SCO1/SenC family lipoprotein  25.53 
 
 
195 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000369081  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0514  electron transport protein SCO1/SenC  29.81 
 
 
219 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00930  Electron transport protein SCO1/SenC  28.57 
 
 
211 aa  56.6  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.330102  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1588  electron transport protein SCO1/SenC  21.57 
 
 
188 aa  56.6  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000473469  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0532  electron transport protein SCO1/SenC  24.14 
 
 
210 aa  55.8  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3935  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.7944  normal  0.089928 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0564  SCO1/SenC family protein  29.24 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0793  electron transport protein SCO1/SenC  28.48 
 
 
223 aa  55.5  0.0000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2445  SCO1/SenC family protein  29.24 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2836  SCO1/SenC family protein  29.24 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.683043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2758  SCO1/SenC family protein  29.24 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2128  hypothetical protein  31.25 
 
 
227 aa  55.5  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0544921  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2817  SCO1/SenC family protein  29.24 
 
 
219 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.172118  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1768  SCO1/SenC family protein  29.24 
 
 
232 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4303  electron transport protein SCO1/SenC  41.56 
 
 
206 aa  55.5  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.82674  normal  0.0643257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01150  YpmQ  25.35 
 
 
243 aa  54.3  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2627  electron transport protein SCO1/SenC  30.43 
 
 
425 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0229  electron transport protein SCO1/SenC  30.99 
 
 
203 aa  54.3  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1521  electron transport protein SCO1/SenC  28.79 
 
 
202 aa  54.3  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3891  electron transport protein SCO1/SenC  37.04 
 
 
222 aa  54.3  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2979  electron transport protein SCO1/SenC  30.2 
 
 
215 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.565267  normal  0.0354023 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0071  electron transport protein SCO1/SenC  25.84 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.420398  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1948  electron transport protein SCO1/SenC  28.89 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1301  electron transport protein SCO1/SenC  25.34 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2512  electron transport protein SCO1/SenC  26.26 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0248  electron transport protein SCO1/SenC  30.28 
 
 
203 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0520152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1264  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0373  lipoprotein  30.99 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2918  electron transport protein SCO1/SenC  30.87 
 
 
213 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00907715  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1256  hypothetical protein  28.97 
 
 
207 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04842  copper-binding protein of the mitochondrial inner membrane (Eurofung)  26.12 
 
 
287 aa  51.6  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4298  electron transport protein SCO1/SenC  28.81 
 
 
356 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576554  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_003296  RS02320  hypothetical protein  29.17 
 
 
227 aa  50.8  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.361144  normal  0.123772 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1751  SCO1/SenC family protein  28.07 
 
 
218 aa  51.2  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.132366  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2710  electron transport protein SCO1/SenC  28.3 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2820  electron transport protein SCO1/SenC  27.95 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.439098  normal  0.0955603 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5935  electron transport protein SCO1/SenC  38.46 
 
 
215 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2688  electron transport protein SCO1/SenC  31.5 
 
 
211 aa  50.1  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2495  electron transport protein SCO1/SenC  26.42 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.115315 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7627  electron transport protein  23.84 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.160482  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0301  electron transport protein SCO1/SenC  23.77 
 
 
235 aa  49.7  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000148363 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3622  electron transport protein SCO1/SenC  30.63 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.847452  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3423  electron transport protein SCO1/SenC  30.22 
 
 
198 aa  49.7  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.118762 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3960  electron transport protein SCO1/SenC  30.63 
 
 
200 aa  49.7  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.105512  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0787  putative electron transport protein  31.63 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305145 
 
 
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NC_007406  Nwi_0144  electron transport protein SCO1/SenC  30.19 
 
 
197 aa  49.3  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.962644  normal  0.838775 
 
 
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NC_007651  BTH_I0436  SCO1/SenC family protein  32.39 
 
 
181 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.465063  n/a   
 
 
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NC_009901  Spea_4007  electron transport protein SCO1/SenC  34.18 
 
 
209 aa  48.9  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612084  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_0997  electron transport protein SCO1/SenC  32.47 
 
 
199 aa  49.3  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.995366  normal  0.775153 
 
 
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