80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5301 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5301  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 897 aa  1723    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3267  tetratricopeptide TPR_4  41.57 
 
 		 890 aa  484  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.318718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3041  tetratricopeptide TPR_4  41.91 
 
 		 890 aa  478  1e-133  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1412  tetratricopeptide TPR_4  41.8 
 
 		 874 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5411  Tetratricopeptide TPR_4  39.72 
 
 		 873 aa  391  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.710354  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5321  TPR repeat-containing protein  39.21 
 
 		 902 aa  382  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1632  Tetratricopeptide TPR_4  40.21 
 
 		 848 aa  324  4e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6030  TPR repeat-containing protein  32.61 
 
 		 880 aa  276  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4669  TPR repeat-containing protein  33.09 
 
 		 811 aa  224  6e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1586  hypothetical protein  33.33 
 
 		 595 aa  219  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7063  hypothetical protein  40 
 
 		 811 aa  200  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2670  tetratricopeptide TPR_4  32.05 
 
 		 905 aa  177  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2965  hypothetical protein  29.84 
 
 		 883 aa  143  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.139515  normal  0.0187889 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2123  hypothetical protein  31.1 
 
 		 751 aa  142  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2379  tetratricopeptide domain-containing protein  35.65 
 
 		 814 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.159989 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0790  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 916 aa  121  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.601667 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0617  Tetratricopeptide TPR_4  31.34 
 
 		 861 aa  107  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3295  Tetratricopeptide TPR_4  34.17 
 
 		 689 aa  103  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.78 
 
 		 2741 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.57 
 
 		 2741 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0502  Tetratricopeptide domain protein  31.89 
 
 		 717 aa  79.3  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1707  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 846 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0057  hypothetical protein  33.69 
 
 		 827 aa  67.4  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2552  hypothetical protein  38.03 
 
 		 1104 aa  67.4  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1984  hypothetical protein  27.78 
 
 		 959 aa  66.6  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3265  hypothetical protein  25.72 
 
 		 845 aa  65.1  0.000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.463161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0864  TPR repeat-containing protein  23.45 
 
 		 1060 aa  64.7  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4095  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 		 729 aa  63.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000736734 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3262  tetratricopeptide TPR_2  25.91 
 
 		 919 aa  63.2  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.857288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2752  Tetratricopeptide TPR_4  27.84 
 
 		 893 aa  62.4  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2763  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 1711 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0158  hypothetical protein  39.23 
 
 		 1142 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0857  hypothetical protein  23.16 
 
 		 532 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0698719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2373  tetratricopeptide TPR_3  26.18 
 
 		 918 aa  58.9  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2728  hypothetical protein  33.88 
 
 		 1096 aa  58.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5663  hypothetical protein  40 
 
 		 960 aa  57.8  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.937261  normal  0.177848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  26.07 
 
 		 1007 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1534  TPR repeat-containing protein  29.44 
 
 		 868 aa  57.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1402  hypothetical protein  30.92 
 
 		 1228 aa  57  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1271  hypothetical protein  19.59 
 
 		 884 aa  56.6  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3488  tetratricopeptide region  25.47 
 
 		 840 aa  56.6  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0863  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.87 
 
 		 991 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3903  tetratricopeptide TPR_2  28.05 
 
 		 809 aa  55.5  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3497  peptidase-like  23.72 
 
 		 1328 aa  55.5  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0283  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 854 aa  54.7  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0380  hypothetical protein  30.07 
 
 		 371 aa  54.7  0.000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0054  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.69 
 
 		 968 aa  54.3  0.000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.317983  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1685  Tetratricopeptide domain protein  23.89 
 
 		 891 aa  54.3  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.131427 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0292  hypothetical protein  27.38 
 
 		 903 aa  52.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  22.26 
 
 		 828 aa  52  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0007  TPR repeat-containing protein  29.09 
 
 		 822 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.286469  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7004  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1051 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.244252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0528  TPR repeat-containing protein  25.22 
 
 		 1409 aa  50.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.987709  decreased coverage  0.00608589 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0977  TPR repeat-containing protein  24.18 
 
 		 1215 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.153699  normal  0.773463 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3223  hypothetical protein  31.62 
 
 		 447 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.758214  normal  0.108052 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2461  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 905 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3648  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 905 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1562  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 1162 aa  49.7  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.17 
 
 		 1162 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.206624 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4460  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 1247 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0317978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1164  hypothetical protein  32.24 
 
 		 643 aa  49.3  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.145735  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0380  tetratricopeptide region  25.1 
 
 		 960 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0542  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 994 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.397005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3535  tetratricopeptide TPR_4  29.66 
 
 		 934 aa  48.1  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.155601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4825  tetratricopeptide TPR_3  27.4 
 
 		 1009 aa  47.8  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1756  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.93 
 
 		 854 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  22.61 
 
 		 1276 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2780  hypothetical protein  35.16 
 
 		 1147 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2808  TPR repeat-containing protein  27.71 
 
 		 883 aa  46.2  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0914392  normal  0.245716 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5804  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 796 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0848  Tetratricopeptide domain protein  31.06 
 
 		 992 aa  45.4  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0302645  normal  0.423245 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3141  hypothetical protein  28.17 
 
 		 192 aa  45.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3057  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.04 
 
 		 904 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.249484 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  30.6 
 
 		 1022 aa  45.1  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2575  hypothetical protein  36 
 
 		 1241 aa  45.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.633416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3307  Tetratricopeptide domain protein  23.13 
 
 		 909 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.106188 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4183  tetratricopeptide TPR_4  28.79 
 
 		 944 aa  45.1  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166941 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4462  hypothetical protein  27.35 
 
 		 853 aa  44.7  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.60042  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3775  TPR repeat-containing protein  27.2 
 
 		 937 aa  44.3  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2706  TPR repeat-containing protein  26.78 
 
 		 928 aa  44.3  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.332396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>