72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0569 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_0569  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 575 aa  1168    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0593446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1112  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.95 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2696  hypothetical protein  26.61 
 
 		 460 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2413  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 593 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2414  TPR repeat-containing protein  21.46 
 
 		 589 aa  105  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2626  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 587 aa  104  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1321  TPR repeat-containing protein  24.42 
 
 		 638 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.002861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2470  TPR repeat-containing protein  24.25 
 
 		 581 aa  91.7  4e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2933  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.68 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  22.74 
 
 		 762 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0588  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 613 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2000  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 		 776 aa  88.2  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.597232  normal  0.450618 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3602  TPR repeat-containing protein  22.68 
 
 		 556 aa  87.4  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0222501 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2415  TPR repeat-containing protein  23.4 
 
 		 686 aa  87.4  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2298  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 570 aa  87  9e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2508  TPR domain-containing protein  22.76 
 
 		 559 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.849467  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  21.92 
 
 		 605 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3198  TPR repeat-containing protein  24.95 
 
 		 645 aa  82.4  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2471  TPR repeat-containing protein  22.95 
 
 		 643 aa  79  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0622  hypothetical protein  24.69 
 
 		 499 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.130503  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  22.72 
 
 		 827 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3222  TPR repeat-containing protein  23.21 
 
 		 544 aa  75.9  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123328 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1840  TPR repeat-containing protein  22.45 
 
 		 657 aa  73.9  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.829292 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3244  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.11 
 
 		 699 aa  72.8  0.00000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1658  hypothetical protein  24.34 
 
 		 579 aa  72.8  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000685853  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  24.27 
 
 		 795 aa  71.2  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2585  hypothetical protein  22.62 
 
 		 575 aa  70.1  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1411  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 		 708 aa  69.7  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000178962  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1542  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 		 534 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00030715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1404  hypothetical protein  23.5 
 
 		 571 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.35845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3018  hypothetical protein  27.58 
 
 		 540 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00759929  hitchhiker  0.000000786199 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1641  hypothetical protein  29.19 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1451  TPR repeat-containing protein  19.62 
 
 		 585 aa  67.4  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1220  TPR repeat-containing protein  24.34 
 
 		 609 aa  67  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00113386  hitchhiker  0.00622178 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4471  tetratricopeptide TPR_4  22.17 
 
 		 598 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.623043 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  22.83 
 
 		 792 aa  63.9  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3173  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 697 aa  63.9  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0407738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6633  hypothetical protein  20 
 
 		 613 aa  63.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0642176 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2655  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.89 
 
 		 610 aa  62  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0656  TPR repeat-containing protein  23.74 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.329411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3794  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 657 aa  59.3  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3174  hypothetical protein  25.13 
 
 		 634 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.676773  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1498  hypothetical protein  20.34 
 
 		 582 aa  58.2  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.579024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0943  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.25 
 
 		 653 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000395442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2893  hypothetical protein  23.51 
 
 		 497 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0588266 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2749  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.71 
 
 		 610 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.49 
 
 		 654 aa  55.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5160  hypothetical protein  23.65 
 
 		 639 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.666513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1114  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  19.89 
 
 		 641 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0632  tetratricopeptide protein)  21.35 
 
 		 566 aa  54.7  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2094  hypothetical protein  31.03 
 
 		 640 aa  54.3  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140167  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6647  hypothetical protein  21.13 
 
 		 437 aa  53.9  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0599  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 748 aa  53.9  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.709055 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3157  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 744 aa  51.2  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.513945  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0666  Tetratricopeptide TPR_4  22.49 
 
 		 566 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3428  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 250 aa  50.1  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4326  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 		 790 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1408  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 759 aa  48.9  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  21.83 
 
 		 766 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0666  Tetratricopeptide TPR_4  22.44 
 
 		 575 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0125  TPR repeat-containing protein  26.62 
 
 		 812 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.298389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1870  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 686 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  24.16 
 
 		 878 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2067  TPR repeat-containing protein  22.7 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0230242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1274  TPR repeat-containing protein  28.39 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  25.33 
 
 		 818 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0584  hypothetical protein  23.08 
 
 		 546 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2410  TPR repeat-containing protein  22.09 
 
 		 648 aa  45.1  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.81 
 
 		 784 aa  44.7  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2024  hypothetical protein  33.33 
 
 		 373 aa  43.9  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32557  predicted protein  26.67 
 
 		 614 aa  43.5  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3076  TPR repeat-containing protein  20.76 
 
 		 697 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>