98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0392 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0392  ATP-binding protein  100 
 
 
257 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.511226  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1242  protein TonB  57.26 
 
 
283 aa  145  5e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.510655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2219  TonB family protein  29.1 
 
 
290 aa  86.3  4e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.479729  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1651  protein TonB  44.33 
 
 
241 aa  73.9  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.350866  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1621  TonB-dependent receptor, putative, authentic frameshift  31.84 
 
 
227 aa  68.9  0.00000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.614853  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0559  TonB family protein  37.62 
 
 
220 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.334223 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1537  TonB family protein  37.93 
 
 
261 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4168  TonB family protein  30.7 
 
 
268 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4259  TonB family protein  41.67 
 
 
241 aa  65.5  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0689  TonB protein  41.25 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0675786  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0773  TonB family protein  31.31 
 
 
251 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  28.57 
 
 
292 aa  63.5  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0849  TonB, putative  27.63 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00146132  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1944  TonB family protein  35.5 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2301  TonB family protein  35.5 
 
 
242 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4240  TonB family protein  31 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3308  TonB family protein  27.17 
 
 
239 aa  62  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2276  TonB family protein  27.91 
 
 
336 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000987559  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0716  TonB family protein  31.1 
 
 
212 aa  60.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1566  TonB family protein  37.5 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0271  TonB-like protein  32.16 
 
 
233 aa  58.5  0.00000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  29.41 
 
 
277 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0284  TonB family protein  35.56 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4374  TonB family protein  28.77 
 
 
268 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3668  TonB family protein  24.12 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1544  TonB-like  32.18 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1512  hypothetical protein  48.19 
 
 
1261 aa  56.2  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2065  TonB family protein  37.5 
 
 
201 aa  55.8  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0441  TonB family protein  30 
 
 
305 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0624564  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1004  TonB-like  33.71 
 
 
239 aa  55.5  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0067  tonB protein  34.92 
 
 
248 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2216  TonB-like protein  25.32 
 
 
235 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0845  TonB  34.72 
 
 
227 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.301208  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2153  TonB-like  34.44 
 
 
276 aa  53.1  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.897555  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2391  TonB family protein  30 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.533007 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  27.51 
 
 
273 aa  52.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0713  periplasmic protein TonB  34.62 
 
 
280 aa  52.4  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.015626 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0060  surface layer protein  52.63 
 
 
484 aa  52  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000340805  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3765  TonB family protein  28.5 
 
 
288 aa  52.4  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1564  TonB family protein  32.35 
 
 
219 aa  52  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4047  TonB family protein  43.75 
 
 
245 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.866851 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1262  protein TonB  34.72 
 
 
235 aa  51.6  0.00001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1054  TonB protein  38.18 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1512  TonB family protein  37.97 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4622  TonB family protein  34.18 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.273599  hitchhiker  0.0000876595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0134  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3890  TonB domain-containing protein  30.77 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.544733 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4082  TonB family protein  30.77 
 
 
267 aa  51.2  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0815  TonB family protein  40.38 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0106  surface layer domain protein  40.74 
 
 
444 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000000230469  hitchhiker  0.00000000000214595 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1467  TonB family protein  32.98 
 
 
265 aa  50.4  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.132532  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0373  TonB family protein  29.89 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0233  TonB family protein  35.94 
 
 
269 aa  49.7  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0995  TonB family protein  32.53 
 
 
208 aa  49.3  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1047  putative TonB-dependent colicin receptor protein  33.91 
 
 
279 aa  48.9  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.710809  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0644  TonB-like  33.33 
 
 
233 aa  48.9  0.00007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0165  TonB family protein  32.86 
 
 
244 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0079  surface layer protein  53.25 
 
 
489 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0466  TonB domain protein  32.86 
 
 
217 aa  48.9  0.00009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3311  TonB family protein  36.36 
 
 
232 aa  48.5  0.00009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2568  TonB family protein  30.3 
 
 
256 aa  48.5  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.127416  hitchhiker  0.00103277 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2389  TonB-dependent receptor, putative  33.33 
 
 
245 aa  48.5  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2024  TonB protein, putative  36.84 
 
 
244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.561423  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2335  TonB family protein  31.3 
 
 
308 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2101  TonB family protein  30.65 
 
 
171 aa  48.1  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.483665  normal  0.582725 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0470  TonB family protein  27.56 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578108  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4621  alpha beta-propellor repeat-containing integrin  29.66 
 
 
830 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.184337  normal  0.0506116 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1850  putative tonB protein  30.68 
 
 
217 aa  47  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.473086  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2909  TonB family protein  35.87 
 
 
292 aa  46.6  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0401  TonB family protein  25.82 
 
 
298 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  51.19 
 
 
537 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  35.06 
 
 
259 aa  45.8  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01882  TonB family C-terminal domain protein  40.38 
 
 
271 aa  45.8  0.0008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  46 
 
 
277 aa  45.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4086  TonB family protein  32.97 
 
 
295 aa  45.4  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0148952  normal  0.766616 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1434  TonB family protein  27.27 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214443  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4002  TonB-like  26.92 
 
 
292 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2306  TonB-like protein  34.44 
 
 
246 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0143972 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0401  TonB family protein  25.12 
 
 
274 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.236004  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3051  TonB-like  42 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3468  TonB family protein  30.23 
 
 
266 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0938  TonB-like  30.32 
 
 
286 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0183  TonB family protein  30.86 
 
 
251 aa  43.5  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.144886  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2053  TonB like protein  26.56 
 
 
256 aa  43.5  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3518  TonB family protein  37.74 
 
 
253 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.631261  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2039  ribonuclease E  52.63 
 
 
926 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375144  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  34.38 
 
 
274 aa  43.9  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0146  TonB family protein  30.19 
 
 
287 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0352  TonB-like  25.91 
 
 
304 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2067  TonB family protein  28.57 
 
 
324 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.207889  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0116  TonB family C-terminal domain protein  35.71 
 
 
258 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2541  periplasmic protein TonB  30.3 
 
 
272 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  4.70786e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2063  pathogenicity protein, putative  51.32 
 
 
630 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3328  TonB family protein  32 
 
 
252 aa  42.4  0.007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.379143  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0737  TonB family protein  31.03 
 
 
251 aa  42  0.009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4331  TonB family protein  28.3 
 
 
288 aa  42  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.141316  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3670  TonB1 protein  33.33 
 
 
274 aa  42  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2981  TonB-dependent receptor, putative  30.12 
 
 
289 aa  42  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>