More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_06185 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  100 
 
 		 144 aa  294  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 152 aa  194  3e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3592  MarR family transcriptional regulator  42.75 
 
 		 146 aa  125  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4426  transcriptional regulator, MarR family  43.8 
 
 		 156 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.610198 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3525  transcriptional regulator, MarR family  44 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.681503 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3725  regulatory protein MarR  44.85 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0803  transcriptional regulator, MarR family protein  22.13 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1719  MarR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1306  MarR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335381  normal  0.344824 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0129  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5405  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.955747 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5560  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 170 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.813118  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0886  MarR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3291  MarR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.570613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 141 aa  52.8  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  25.19 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4137  transcriptional regulator, MarR family  29.7 
 
 		 153 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1893  regulatory protein, MarR  26.87 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.447554  normal  0.734981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3423  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 		 151 aa  51.2  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118628 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5662  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 153 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.49927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3611  MarR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000472192 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04763  hypothetical protein  24.26 
 
 		 143 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0830  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 151 aa  50.8  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3146  MarR family protein  33.9 
 
 		 162 aa  50.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0129718  normal  0.0536373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  29.07 
 
 		 177 aa  50.4  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1608  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 151 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.457422  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 159 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0579  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.14462  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1640  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1675  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4873  MarR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.846475  normal  0.145685 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1732  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2144  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2928  MarR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.442252 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0317  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 146 aa  50.4  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2128  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.318768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1612  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.35 
 
 		 144 aa  50.4  0.000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0232  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 152 aa  50.4  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0926  transcriptional regulator, MarR family  23.66 
 
 		 158 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.493079  normal  0.487426 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1328  transcriptional regulator, MarR family  24.39 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  39.68 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1631  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 151 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.813551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05520  multidrug resistance operon repressor MexR  24.55 
 
 		 147 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4271  MarR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 156 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0653897  normal  0.661065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0799  MarR family transcriptional regulator  21.54 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01489  DNA-binding transcriptional repressor of multiple antibiotic resistance  27.35 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0776568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2116  transcriptional regulator, MarR family  27.35 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000643944  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0952  transcriptional regulator, MarR family  27.61 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00612871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2325  transcriptional regulator, MarR family  23.02 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0434242 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01500  hypothetical protein  27.35 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.101748  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2483  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 156 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.758038  normal  0.560924 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1325  MarR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 168 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  27.91 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0573  MarR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.256198  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2025  MarR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.165588 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1216  transcriptional regulator, MarR family  22.9 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3597  MarR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 153 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2127  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1808  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 159 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001045  organic hydroperoxide resistance transcriptional regulator  24.06 
 
 		 152 aa  49.7  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3956  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210234 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0401  transcriptional regulator, MarR family  24.24 
 
 		 156 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0524  multidrug resistance operon repressor MexR  24.77 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.084309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0519  transcriptional regulator, MarR family  23.76 
 
 		 157 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1219  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.318492  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1125  transcriptional regulator, MarR family  22.73 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.416342 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0815  MarR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 165 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000550088 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0813  transcriptional regulator, MarR family  24.58 
 
 		 159 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.800363  normal  0.25148 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1671  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 151 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.787972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1698  MarR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 151 aa  48.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.547698  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0131  transcriptional regulator, MarR family  30.34 
 
 		 156 aa  48.9  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000555257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0000000993982  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  26.53 
 
 		 173 aa  48.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3105  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0272572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3363  transcriptional regulator, MarR family  28.71 
 
 		 154 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.7144  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3108  transcriptional regulator, MarR family  25.87 
 
 		 151 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159127 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3564  MarR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 155 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.7607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  28.42 
 
 		 149 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  31.19 
 
 		 157 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0630  MarR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4407  transcriptional regulator, MarR family  27.68 
 
 		 163 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.102927  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1344  MarR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  27.16 
 
 		 167 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1494  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 160 aa  47.8  0.00006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.386446  hitchhiker  0.00719492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3570  MarR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 171 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 160 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0269  MarR family transcriptional regulator  19.85 
 
 		 138 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1547  MarR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 148 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.187738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3097  transcriptional regulator, MarR family  24.04 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3444  transcriptional regulator, MarR family  24.04 
 
 		 153 aa  47.4  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2251  MarR family transcriptional regulator  21.15 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.344689  normal  0.255238 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0613  MarR family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.31364  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0300  transcriptional regulator MarR family  31.17 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1998  DNA-binding transcriptional repressor MarR  27.12 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2137  transcriptional regulator, MarR family  23.13 
 
 		 154 aa  47  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.727084 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1642  transcriptional regulator, MarR family  27.72 
 
 		 150 aa  47  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3178  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137994  normal  0.81725 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2167  transcriptional regulator, MarR family  33.78 
 
 		 161 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>