106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2451 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  100 
 
 		 382 aa  785    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  46.46 
 
 		 379 aa  330  4e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  29.15 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  29.69 
 
 		 425 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  30.54 
 
 		 362 aa  100  4e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  26.39 
 
 		 428 aa  100  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.48 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3119  integrase family protein  26.39 
 
 		 427 aa  90.5  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  23.36 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2898  phage-related integrase  46.75 
 
 		 90 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  26.67 
 
 		 334 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4350  integrase family protein  24.77 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4272  integrase family protein  32.26 
 
 		 283 aa  65.5  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0641822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  25.44 
 
 		 372 aa  63.2  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  23.06 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 379 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 367 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  22.63 
 
 		 397 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  26.69 
 
 		 275 aa  58.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  25.41 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  30.06 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  24.79 
 
 		 376 aa  55.8  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.52 
 
 		 381 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  24.79 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0037  integrase-recombinase protein  30 
 
 		 285 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.491877  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  24.24 
 
 		 415 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.79 
 
 		 376 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 387 aa  55.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  27.67 
 
 		 302 aa  55.1  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  24.79 
 
 		 376 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  23.42 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  23.06 
 
 		 353 aa  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  24.65 
 
 		 341 aa  51.6  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  25.17 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1846  integrase family protein  28 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000018136  normal  0.604263 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  33.33 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  28.69 
 
 		 338 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.67 
 
 		 397 aa  50.1  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  25.22 
 
 		 293 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.58 
 
 		 292 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  25 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2927  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 391 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229972  normal  0.344123 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  30.54 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  26.72 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.13 
 
 		 305 aa  48.9  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  27.04 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  27.04 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2981  integrase family protein  23.84 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  21.45 
 
 		 381 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  28.51 
 
 		 285 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0189  Phage integrase  26.32 
 
 		 343 aa  47.8  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0938  Phage integrase  21.07 
 
 		 393 aa  47.8  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.992929  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  24.43 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  23.2 
 
 		 409 aa  47.8  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  22.73 
 
 		 390 aa  47  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0479  phage integrase  24.14 
 
 		 357 aa  47  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00687154  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  28 
 
 		 305 aa  47  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  24.19 
 
 		 278 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  23.33 
 
 		 294 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  24.78 
 
 		 293 aa  46.2  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 386 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.47 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 300 aa  46.2  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  25.64 
 
 		 336 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  25.65 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.37 
 
 		 313 aa  45.4  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0142  Phage integrase  28.57 
 
 		 343 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1023  integrase family protein  28.17 
 
 		 297 aa  45.1  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0854512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  29.73 
 
 		 293 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0981  phage integrase family site specific recombinase  24.77 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.896677  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  22.78 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  24.08 
 
 		 327 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.06 
 
 		 312 aa  44.3  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.42 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 452 aa  44.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.37 
 
 		 313 aa  44.7  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1360  integrase/recombinase  23.48 
 
 		 306 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6099899999999998e-31 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  25 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  25.11 
 
 		 395 aa  43.9  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  36.67 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  25.64 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  25.64 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  24.39 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1316  integrase/recombinase  25.38 
 
 		 306 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.718184  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2244  phage integrase family protein  21.61 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.16735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1127  phage integrase  26.09 
 
 		 301 aa  43.9  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  23.68 
 
 		 276 aa  43.9  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  24.68 
 
 		 317 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  24.6 
 
 		 294 aa  43.5  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  25.28 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2345  putative site-specific recombinase, phage integrase family protein  43.18 
 
 		 395 aa  43.5  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  19.76 
 
 		 337 aa  43.5  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  23.45 
 
 		 387 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  24.43 
 
 		 368 aa  43.5  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0272  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0295  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0905  phage integrase family site specific recombinase  27.14 
 
 		 319 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3884  phage integrase family site specific recombinase  25.31 
 
 		 310 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>