79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5027 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_1299  Eco57I restriction endonuclease  36.9 
 
 		 1144 aa  719    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0387167  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0295  type II restriction enzyme  59.88 
 
 		 1167 aa  1376    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1677  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1171 aa  686    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0339  putative restriction enzyme  45.02 
 
 		 1205 aa  978    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00710778  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5027  type II restriction enzyme  100 
 
 		 1180 aa  2436    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.776061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1608  hypothetical protein  34.66 
 
 		 1182 aa  661    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.102768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0561  hypothetical protein  35.02 
 
 		 1162 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2288  type II restriction enzyme  50.5 
 
 		 1160 aa  1132    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2493  type IIS restriction enzyme  39.62 
 
 		 1183 aa  828    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3731  hypothetical protein  35.81 
 
 		 1174 aa  630  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02940  hypothetical protein  34.49 
 
 		 1140 aa  613  9.999999999999999e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.45552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02930  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1131 aa  565  1.0000000000000001e-159  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.264298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4847  putative restriction enzyme  30.83 
 
 		 1219 aa  526  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000521229  normal  0.767237 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1895  type IIS restriction enzyme  40.2 
 
 		 612 aa  411  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.4814  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2107  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1270 aa  312  2e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1273  hypothetical protein  26.92 
 
 		 1125 aa  268  5e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2208  hypothetical protein  30.29 
 
 		 1218 aa  263  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00220427  normal  0.956264 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1156  hypothetical protein  26.09 
 
 		 1324 aa  262  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1916  hypothetical protein  24.14 
 
 		 1430 aa  239  2e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3080  hypothetical protein  24.23 
 
 		 1425 aa  232  4e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2038  hypothetical protein  24.64 
 
 		 1241 aa  230  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.769996  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_260  hypothetical protein  23.31 
 
 		 1359 aa  230  1e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0601  hypothetical protein  25.64 
 
 		 1497 aa  203  1.9999999999999998e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.548482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1235  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1484 aa  196  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2207  hypothetical protein  34.72 
 
 		 332 aa  181  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000153099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2756  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1162 aa  174  1e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.206504  normal  0.110579 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1326  hypothetical protein  27.71 
 
 		 1141 aa  162  4e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.770705  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1124  hypothetical protein  24.88 
 
 		 1326 aa  158  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1709  hypothetical protein  28.82 
 
 		 1154 aa  157  1e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.18586  normal  0.0585819 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1819  hypothetical protein  24.54 
 
 		 1154 aa  157  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0470618 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1081  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1107 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.202194  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3233  hypothetical protein  23.09 
 
 		 1129 aa  132  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1132  hypothetical protein  27.21 
 
 		 1174 aa  131  6e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00035988 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2241  hypothetical protein  25.63 
 
 		 731 aa  127  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0974985 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0997  hypothetical protein  25.08 
 
 		 706 aa  115  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0583  hypothetical protein  24.37 
 
 		 882 aa  100  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2491  hypothetical protein  43.56 
 
 		 106 aa  82.8  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0994  hypothetical protein  24.62 
 
 		 309 aa  76.6  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3191  hypothetical protein  26.01 
 
 		 288 aa  77  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1423  hypothetical protein  24.51 
 
 		 1177 aa  75.5  0.000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1333  protein of unknown function DUF450  22.36 
 
 		 995 aa  73.9  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.126844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1159  hypothetical protein  21.98 
 
 		 1036 aa  72  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1534  hypothetical protein  25.7 
 
 		 1120 aa  71.6  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0991  hypothetical protein  26.23 
 
 		 300 aa  70.1  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2506  type II restriction enzyme  47.89 
 
 		 72 aa  67.8  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2547  type IIS restriction endonuclease, putative  21.16 
 
 		 1076 aa  60.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00176401  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0114  hypothetical protein  26.33 
 
 		 1231 aa  57.4  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0410  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1147 aa  57.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.301766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1669  hypothetical protein  22.15 
 
 		 1209 aa  57.4  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4598  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like  42.86 
 
 		 416 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2731  putative type II DNA modification enzyme  34.55 
 
 		 1338 aa  54.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2397  hypothetical protein  23.11 
 
 		 792 aa  54.3  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1892  protein of unknown function DUF450  24.33 
 
 		 1058 aa  53.5  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1902  hypothetical protein  21.2 
 
 		 404 aa  53.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000664391  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1202  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1282 aa  53.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.394642  hitchhiker  0.00171633 
 
 
-
 
NC_002950  PG0862  type IIS restriction endonuclease, putative  23.74 
 
 		 1132 aa  53.1  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00475816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2238  hypothetical protein  25.82 
 
 		 389 aa  53.1  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0102712 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0491  hypothetical protein  20.36 
 
 		 1178 aa  52.4  0.00005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1501  protein of unknown function DUF450  26.75 
 
 		 974 aa  51.6  0.00008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000140584  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3315  type II restriction enzyme, methylase subunit  35.35 
 
 		 929 aa  51.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0441  hypothetical protein  23.37 
 
 		 1426 aa  50.8  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.141765 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3055  protein of unknown function DUF450  28.57 
 
 		 950 aa  50.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04295  Type II restriction enzyme, methylase subunit  22.22 
 
 		 1020 aa  50.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1897  hypothetical protein  29.21 
 
 		 410 aa  50.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000502601  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3043  hypothetical protein  39.13 
 
 		 871 aa  49.7  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.743399  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1603  Eco57I restriction endonuclease  21.18 
 
 		 1170 aa  49.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.741912  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  28.09 
 
 		 1612 aa  48.1  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3412  Eco57I restriction endonuclease  25.68 
 
 		 1159 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904901 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0228  hypothetical protein  30.77 
 
 		 652 aa  47.4  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1239  putative type II DNA modification enzyme  31 
 
 		 1336 aa  47.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0932763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1958  hypothetical protein  28.07 
 
 		 1333 aa  45.8  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2530  putative DNA methylase  41.79 
 
 		 928 aa  45.8  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0253553  hitchhiker  0.000494571 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3285  putative restriction/modification enzyme  27.96 
 
 		 1432 aa  46.2  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0478  hypothetical protein  32.81 
 
 		 908 aa  46.2  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1962  type II restriction enzyme, methylase subunit  40.3 
 
 		 918 aa  45.8  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0531091  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7831  putative type II DNA modification enzyme  33.64 
 
 		 1358 aa  45.8  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15580  Type II restriction enzyme, methylase subunit  42.03 
 
 		 926 aa  45.4  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000708191  unclonable  6.0148299999999996e-21 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1457  type IIS restriction/modification enzyme  25.45 
 
 		 1256 aa  45.1  0.009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4877  hypothetical protein  30.77 
 
 		 481 aa  45.1  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>