More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_2537 on replicon NC_010084
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3940  D-amino-acid dehydrogenase  89.61 
 
 
414 aa  745    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401149  hitchhiker  0.00412438 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0822  FAD dependent oxidoreductase  90.34 
 
 
414 aa  736    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.193909  normal  0.0469773 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0367  D-amino-acid dehydrogenase  90.58 
 
 
414 aa  736    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2537  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
414 aa  827    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654937  normal  0.300039 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0725  D-amino-acid dehydrogenase  89.37 
 
 
414 aa  747    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0605876  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0850  D-amino-acid dehydrogenase  90.58 
 
 
414 aa  736    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.173092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0742  FAD dependent oxidoreductase  89.37 
 
 
414 aa  748    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0018802 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3433  FAD dependent oxidoreductase  73.43 
 
 
414 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2070  FAD dependent oxidoreductase  72.64 
 
 
413 aa  596  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0259945 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3604  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 
413 aa  524  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1840  D-amino acid dehydrogenase, small subunit, putative  67.15 
 
 
435 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.815218  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4442  D-amino-acid dehydrogenase  63.77 
 
 
413 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000997757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4962  FAD dependent oxidoreductase  63.77 
 
 
413 aa  514  1e-144  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0181745  normal  0.52476 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0629  FAD dependent oxidoreductase  64.73 
 
 
440 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3334  D-amino-acid dehydrogenase  65.22 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.281822  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5251  FAD dependent oxidoreductase  65.22 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5033  D-amino-acid dehydrogenase  65.22 
 
 
413 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.548496 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0770  FAD-dependent oxidoreductase  67.63 
 
 
507 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2137  D-amino-acid dehydrogenase  67.63 
 
 
483 aa  501  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0860  FAD-dependent oxidoreductase  67.63 
 
 
414 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2176  FAD dependent oxidoreductase  56.25 
 
 
414 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0832957  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2811  FAD dependent oxidoreductase  55.64 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630542  normal  0.814601 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3596  FAD dependent oxidoreductase  56.01 
 
 
414 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.953552  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3709  FAD dependent oxidoreductase  54.85 
 
 
416 aa  437  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189981  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2320  FAD dependent oxidoreductase  55.53 
 
 
414 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.63288  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0844  D-amino acid dehydrogenase small subunit  53.14 
 
 
415 aa  431  1e-120  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0630  amino acid dehydrogenase, putative  55.69 
 
 
416 aa  423  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5465  FAD dependent oxidoreductase  54.35 
 
 
410 aa  421  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0375458 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0592  putative amino acid dehydrogenase  55.21 
 
 
416 aa  417  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1652  D-amino-acid dehydrogenase  54.59 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.205537  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2282  FAD dependent oxidoreductase  53.4 
 
 
417 aa  414  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.877617  normal  0.634031 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2698  D-amino-acid dehydrogenase  54 
 
 
433 aa  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0799  D-amino-acid dehydrogenase  54.83 
 
 
410 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.491257 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4480  FAD dependent oxidoreductase  55.07 
 
 
414 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0064  FAD dependent oxidoreductase  53.62 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.711671  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0342  FAD dependent oxidoreductase  51.92 
 
 
417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.413406  normal  0.188233 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3648  D-amino-acid dehydrogenase  52.54 
 
 
417 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1816  D-amino-acid dehydrogenase  52.78 
 
 
417 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.230934  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4295  FAD dependent oxidoreductase  53.27 
 
 
417 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000269255  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0428  FAD dependent oxidoreductase  51.08 
 
 
415 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.163324 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4901  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0396  FAD dependent oxidoreductase  50.36 
 
 
415 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.128604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3824  FAD dependent oxidoreductase  52.17 
 
 
416 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1655  D-amino-acid dehydrogenase  50.36 
 
 
414 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0719166  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1724  FAD dependent oxidoreductase  50.72 
 
 
414 aa  380  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0720  FAD-dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
416 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0868  FAD dependent oxidoreductase  47.57 
 
 
446 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.585687  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0474  FAD dependent oxidoreductase  40.28 
 
 
421 aa  338  8e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4795  putative D-amino-acid dehydrogenase  45.73 
 
 
412 aa  338  9e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0900  FAD dependent oxidoreductase  40.24 
 
 
417 aa  327  3e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1018  FAD dependent oxidoreductase  38.94 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0864419  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1346  D-amino acid oxidase  38.22 
 
 
415 aa  306  4.0000000000000004e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0584052  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3891  FAD dependent oxidoreductase  40.25 
 
 
410 aa  298  9e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4628  D-amino-acid dehydrogenase  43.55 
 
 
412 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.732848  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5589  D-amino-acid dehydrogenase  41.87 
 
 
418 aa  270  2.9999999999999997e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0932448  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2064  FAD dependent oxidoreductase  37.72 
 
 
414 aa  258  2e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.691956  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5562  FAD dependent oxidoreductase  38.4 
 
 
425 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2880  FAD dependent oxidoreductase  35.15 
 
 
412 aa  201  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.402173  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0507  amino acid dehydrogenase transmembrane protein  36.04 
 
 
423 aa  190  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4364  FAD dependent oxidoreductase  32.94 
 
 
431 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1843  FAD dependent oxidoreductase  33.65 
 
 
420 aa  186  7e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4261  FAD dependent oxidoreductase  34.05 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1410  D-amino-acid dehydrogenase  32.52 
 
 
415 aa  182  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.320893  normal  0.0817919 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0240  FAD dependent oxidoreductase  32.3 
 
 
425 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0383  FAD dependent oxidoreductase  33.57 
 
 
427 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0398  FAD dependent oxidoreductase  33.96 
 
 
427 aa  179  5.999999999999999e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1613  FAD dependent oxidoreductase  33.17 
 
 
414 aa  178  2e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4843  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 
416 aa  176  5e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570392  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6265  FAD dependent oxidoreductase  32.15 
 
 
413 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00674063  normal  0.363363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0355  D-amino-acid dehydrogenase  30.51 
 
 
415 aa  172  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1447  putative D-amino acid dehydrogenase, small subunit  29.38 
 
 
427 aa  171  2e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272098  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0395  D-amino acid dehydrogenase small subunit  33.25 
 
 
421 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2820  FAD dependent oxidoreductase  29.31 
 
 
432 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00368627  normal  0.483121 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0990  D-amino-acid dehydrogenase  31.5 
 
 
413 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1706  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 
420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.612598  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0203  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
430 aa  164  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2316  D-amino acid dehydrogenase  31.25 
 
 
413 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.944178  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003672  D-amino acid dehydrogenase family protein in hydroxy-L-proline catabolic cluster  30.41 
 
 
405 aa  159  8e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1764  D-amino-acid dehydrogenase  28.98 
 
 
422 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.124563  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1259  putative D-amino-acid dehydrogenase, FAD dependent  31.41 
 
 
435 aa  158  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00889371 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2360  D-amino-acid dehydrogenase  28.71 
 
 
446 aa  157  4e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0223413  normal  0.51106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2746  oxidoreductase, FAD-dependent  27.21 
 
 
416 aa  156  5.0000000000000005e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.381224  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3864  D-amino-acid dehydrogenase  31.34 
 
 
413 aa  155  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1533  D-amino-acid dehydrogenase  29.01 
 
 
428 aa  155  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000097225  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4074  FAD dependent oxidoreductase  27.9 
 
 
419 aa  152  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1866  FAD dependent oxidoreductase  32.11 
 
 
434 aa  152  8e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.619946  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3464  FAD dependent oxidoreductase  31.91 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.135026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3847  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 
411 aa  146  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01910  D-amino acid dehydrogenase subunit  31.03 
 
 
416 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.492063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3970  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 
411 aa  145  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2708  D-amino-acid dehydrogenase  32.43 
 
 
440 aa  144  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4860  D-amino-acid dehydrogenase  32.51 
 
 
406 aa  143  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.643864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0116  D-amino-acid dehydrogenase  29.98 
 
 
416 aa  143  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.658269  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0813  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
441 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3545  D-amino acid dehydrogenase  24.66 
 
 
462 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5199  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.494361 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5338  FAD dependent oxidoreductase  29.16 
 
 
409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.18927  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3200  D-amino acid dehydrogenase small subunit  29.83 
 
 
428 aa  140  4.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0905906  normal  0.889782 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1110  D-amino-acid dehydrogenase  29.52 
 
 
420 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2305  D-amino-acid dehydrogenase  32.32 
 
 
420 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.467185  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>