More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1825 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1825  Rhs family protein  100 
 
 		 190 aa  394  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.337988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  74.65 
 
 		 1429 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  68.57 
 
 		 1981 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  63.49 
 
 		 1348 aa  94.4  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  62.69 
 
 		 1626 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  61.54 
 
 		 1609 aa  93.2  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  62.5 
 
 		 1586 aa  93.6  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  60.26 
 
 		 927 aa  92  4e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  45.54 
 
 		 1402 aa  91.7  5e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  66.67 
 
 		 1377 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  66.67 
 
 		 1377 aa  91.7  6e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  61.54 
 
 		 1620 aa  90.5  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6958  YD repeat protein  51.85 
 
 		 1495 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0165328  normal  0.66981 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1283  YD repeat-containing protein  39.1 
 
 		 1531 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.950777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  50.54 
 
 		 690 aa  89.7  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  42.59 
 
 		 1677 aa  90.1  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  62.3 
 
 		 1359 aa  89.4  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  71.67 
 
 		 290 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4992  YD repeat-containing protein  54.93 
 
 		 451 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  58.46 
 
 		 1573 aa  89  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  71.67 
 
 		 290 aa  89.4  3e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2355  YD repeat-containing protein  65.08 
 
 		 1494 aa  89.4  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  58.9 
 
 		 1583 aa  89.7  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  51.22 
 
 		 1554 aa  89.4  3e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  62.69 
 
 		 1397 aa  89  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  62.69 
 
 		 1397 aa  89  4e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  62.69 
 
 		 1397 aa  89  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  62.69 
 
 		 1397 aa  89  4e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43100  putative Rhs family protein  63.08 
 
 		 1614 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0535223  normal  0.616257 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  69.35 
 
 		 1405 aa  89  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  62.69 
 
 		 554 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  58.67 
 
 		 1308 aa  88.6  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  63.64 
 
 		 1410 aa  88.6  5e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2563  YD repeat-containing protein  61.54 
 
 		 1611 aa  88.6  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  61.76 
 
 		 1362 aa  88.6  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2042  Rhs family protein  56.94 
 
 		 1576 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.901099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  64.62 
 
 		 1411 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1751  Rhs family protein  58.82 
 
 		 1595 aa  87.8  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  61.54 
 
 		 1525 aa  87.8  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  64.62 
 
 		 1411 aa  87.8  8e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  64.62 
 
 		 1411 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  64.62 
 
 		 1411 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1676  Rhs family protein  58.82 
 
 		 1586 aa  87.8  9e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143254 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0648  Rhs family protein  42.98 
 
 		 1446 aa  87.8  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000723582  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  64.62 
 
 		 1411 aa  87.8  9e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4988  YD repeat-containing protein  49.38 
 
 		 480 aa  87  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  64.62 
 
 		 1365 aa  87  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0350  RHS protein  58.33 
 
 		 307 aa  87  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  52.5 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  60 
 
 		 1520 aa  87.4  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0410  YD repeat-containing protein  62.5 
 
 		 1189 aa  87  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  58.46 
 
 		 1770 aa  87.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  64.62 
 
 		 1411 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  45.71 
 
 		 1418 aa  86.3  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  64.62 
 
 		 312 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  64.62 
 
 		 1394 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  64.62 
 
 		 713 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  58.21 
 
 		 1415 aa  86.3  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3794  Rhs family protein  54.17 
 
 		 357 aa  87  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279283  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  58.21 
 
 		 1791 aa  86.7  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  58.73 
 
 		 1390 aa  85.9  3e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  57.53 
 
 		 1398 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4995  RHS protein  53.52 
 
 		 171 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2613  YD repeat-containing protein  61.19 
 
 		 866 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.315185 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  64.62 
 
 		 314 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  64.62 
 
 		 314 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  63.93 
 
 		 1492 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  57.53 
 
 		 236 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  62.69 
 
 		 1399 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  55 
 
 		 1379 aa  85.9  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  64.62 
 
 		 314 aa  85.5  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  63.93 
 
 		 1466 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3478  YD repeat-containing protein  59.38 
 
 		 553 aa  85.9  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3884  RHS protein  55.38 
 
 		 231 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  57.53 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  62.69 
 
 		 477 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  62.69 
 
 		 477 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  57.53 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  62.69 
 
 		 477 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  62.69 
 
 		 477 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  62.69 
 
 		 477 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  57.53 
 
 		 236 aa  85.5  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  64.62 
 
 		 1388 aa  85.5  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0772  RHS protein  60.87 
 
 		 327 aa  85.5  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.728642  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  64.62 
 
 		 1409 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  62.69 
 
 		 477 aa  85.1  5e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  59.38 
 
 		 598 aa  85.1  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0770  YD repeat-containing protein  63.93 
 
 		 693 aa  85.1  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.163533  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  60.29 
 
 		 1426 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  60.29 
 
 		 1426 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  60.29 
 
 		 1429 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  63.79 
 
 		 1421 aa  85.1  6e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  45.71 
 
 		 1388 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  64.62 
 
 		 233 aa  85.1  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  57.14 
 
 		 1568 aa  85.1  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  60.29 
 
 		 1426 aa  84.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0341  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  64.52 
 
 		 1527 aa  85.1  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2525  YD repeat-containing protein  54.55 
 
 		 561 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.949888 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0317  Rhs family protein  57.81 
 
 		 924 aa  84.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.325486  normal  0.374096 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2838  YD repeat-containing protein  53.33 
 
 		 1654 aa  84.3  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0573188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>