More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0701 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  91.1 
 
 
652 aa  1147    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  91.26 
 
 
652 aa  1148    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
652 aa  1303    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  91.1 
 
 
652 aa  1147    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.13 
 
 
878 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.18 
 
 
810 aa  134  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  26.74 
 
 
576 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 
565 aa  105  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.75 
 
 
1276 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  24.36 
 
 
1694 aa  99.4  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.08 
 
 
543 aa  99.8  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  20.95 
 
 
927 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.38 
 
 
4079 aa  95.9  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  23.5 
 
 
562 aa  94  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.44 
 
 
632 aa  93.6  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.66 
 
 
1737 aa  90.9  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  23.22 
 
 
1979 aa  90.5  9e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  25.2 
 
 
366 aa  90.5  9e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.96 
 
 
1056 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  22.96 
 
 
1049 aa  88.2  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2951  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.88 
 
 
784 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.78 
 
 
572 aa  87.8  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2491  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.11 
 
 
689 aa  86.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 
827 aa  87  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.46 
 
 
572 aa  87  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1770  TPR repeat-containing protein  23.18 
 
 
393 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.452955  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  23.84 
 
 
730 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.38 
 
 
1022 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.15 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  25.71 
 
 
1676 aa  83.6  0.000000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  21.86 
 
 
573 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  26.03 
 
 
465 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  21.52 
 
 
602 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  21.5 
 
 
573 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 
486 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.9 
 
 
988 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0133  TPR repeat-containing protein  21.61 
 
 
393 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.310931  normal  0.0473724 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.48 
 
 
2240 aa  80.9  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 
1297 aa  79.7  0.0000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0321  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 
162 aa  78.6  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
634 aa  77.8  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.78 
 
 
3145 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  22.25 
 
 
1138 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  21.13 
 
 
436 aa  75.5  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 
968 aa  75.5  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  20.98 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 
586 aa  75.1  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2431  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.73 
 
 
818 aa  74.7  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  21.54 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.46 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.14 
 
 
784 aa  74.3  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  20.52 
 
 
887 aa  74.3  0.000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  21.33 
 
 
395 aa  73.9  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  29.32 
 
 
267 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  29.44 
 
 
623 aa  73.6  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  18.65 
 
 
833 aa  73.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
2262 aa  73.6  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 
3172 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2947  tetratricopeptide TPR_2  20.19 
 
 
321 aa  73.2  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.708581 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  19.55 
 
 
676 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 
792 aa  72.8  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
614 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.27 
 
 
594 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  32.14 
 
 
626 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  25.83 
 
 
934 aa  72.4  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  22.91 
 
 
1094 aa  72  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 
614 aa  72  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  20.96 
 
 
725 aa  72.4  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  22.26 
 
 
1067 aa  72  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  21.84 
 
 
3301 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  25.35 
 
 
762 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2478  TPR repeat-containing protein  22.08 
 
 
884 aa  71.6  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.599046  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  21.55 
 
 
573 aa  71.6  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1811  TPR repeat-containing protein  22.87 
 
 
523 aa  71.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0564  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 
202 aa  72  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.151741 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 
522 aa  71.6  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 
909 aa  70.9  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  26.06 
 
 
1069 aa  70.9  0.00000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  23.65 
 
 
245 aa  70.9  0.00000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  23.96 
 
 
1192 aa  70.9  0.00000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  22.9 
 
 
398 aa  70.5  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  20.97 
 
 
589 aa  70.5  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.54 
 
 
1007 aa  70.5  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 
522 aa  70.1  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.99 
 
 
626 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24191  hypothetical protein  24.62 
 
 
545 aa  70.1  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  26.6 
 
 
745 aa  70.1  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.26 
 
 
836 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4312  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.89 
 
 
554 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1451  TPR repeat-containing protein  26.94 
 
 
244 aa  69.3  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.346129  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  29.12 
 
 
407 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23981  hypothetical protein  24.02 
 
 
587 aa  69.7  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.167552 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  27.03 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  24.33 
 
 
566 aa  68.6  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1518  TPR repeat-containing protein  19.94 
 
 
375 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.946116  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0840  TPR repeat-containing protein  20.39 
 
 
1371 aa  68.2  0.0000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  27.15 
 
 
824 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2167  tetratricopeptide TPR_2  23.44 
 
 
1014 aa  68.6  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.796808 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 
614 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>