More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3396 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  100 
 
 		 338 aa  676    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3140  putative serine protease protein  38.73 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3072  putative serine protease protein  37.29 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3418  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.29 
 
 		 306 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0017  tetratricopeptide TPR_3  28.18 
 
 		 407 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  35.86 
 
 		 482 aa  89  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3298  peptidase S1C, Do  36 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0266  trypsin domain-containing protein  31.32 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.16 
 
 		 417 aa  70.5  0.00000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3391  tetratricopeptide TPR_2  26.02 
 
 		 652 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4976  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 652 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.128988  normal  0.368322 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1924  endopeptidase  30.22 
 
 		 395 aa  69.7  0.00000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4353  serine endoprotease  34.76 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.139323  hitchhiker  0.00320689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5311  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 652 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.118581 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1454  2-alkenal reductase  31.38 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00925037  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  33.94 
 
 		 513 aa  68.9  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  32.74 
 
 		 464 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1014  protease Do  30.25 
 
 		 465 aa  67.8  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.370386  normal  0.451123 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.82 
 
 		 450 aa  67.4  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  30.86 
 
 		 451 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.81 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  32.48 
 
 		 399 aa  67.4  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3006  periplasmic serine protease  28.69 
 
 		 472 aa  67  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.337572  normal  0.40182 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.16 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.97 
 
 		 321 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23630  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  28.31 
 
 		 577 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0701  TPR repeat-containing protein  26.25 
 
 		 652 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  31.48 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  31.48 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  35.43 
 
 		 393 aa  66.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  31.48 
 
 		 468 aa  65.9  0.0000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  29.22 
 
 		 459 aa  65.9  0.0000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 		 379 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  35.15 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  34.97 
 
 		 485 aa  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  33.95 
 
 		 386 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  30.29 
 
 		 451 aa  65.1  0.000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  32.14 
 
 		 464 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 402 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  32.92 
 
 		 525 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0347  2-alkenal reductase  31.28 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000181204  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  31.48 
 
 		 472 aa  65.1  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  33.95 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3890  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.82 
 
 		 317 aa  65.1  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1244  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.93 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0987  serine endoprotease  34.57 
 
 		 481 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0018316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.14 
 
 		 366 aa  65.1  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  31.95 
 
 		 455 aa  65.1  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  34.91 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  34.91 
 
 		 511 aa  64.3  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3323  serine endoprotease  34.57 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00403874  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  32.3 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3452  serine endoprotease  34.57 
 
 		 481 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342049  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  33.75 
 
 		 386 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  31.48 
 
 		 467 aa  63.5  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2700  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.38 
 
 		 387 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  hitchhiker  0.000142466 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  34.3 
 
 		 516 aa  63.2  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  34.12 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2979  protease Do  33.33 
 
 		 511 aa  63.2  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.037466  normal  0.016499 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.87 
 
 		 371 aa  63.2  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.46 
 
 		 385 aa  63.2  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  31.06 
 
 		 461 aa  62.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  33.73 
 
 		 511 aa  63.2  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4346  serine protease DegP  32.1 
 
 		 459 aa  62.8  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0589016  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  35.71 
 
 		 385 aa  62.8  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.14 
 
 		 408 aa  62.8  0.000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  32.92 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  30.77 
 
 		 461 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  34.97 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  36.59 
 
 		 464 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  33.73 
 
 		 497 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4226  periplasmic serine protease DegS  32.93 
 
 		 361 aa  62.4  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  hitchhiker  0.000290444 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  32.92 
 
 		 463 aa  62  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  35.45 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  29.71 
 
 		 462 aa  62.4  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  32.92 
 
 		 457 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  33.14 
 
 		 528 aa  62.4  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  34.04 
 
 		 500 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  35.58 
 
 		 467 aa  62.4  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  32.16 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  34.53 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  33.12 
 
 		 386 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  31.29 
 
 		 496 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0503  peptidase S1C, DegS  33.33 
 
 		 358 aa  61.6  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0125396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3297  periplasmic serine protease DegS  32.35 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00219281  normal  0.0321513 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  35.4 
 
 		 446 aa  61.6  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  33.54 
 
 		 375 aa  61.6  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2149  2-alkenal reductase  34.51 
 
 		 412 aa  61.2  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0134489  hitchhiker  0.00552688 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  31.29 
 
 		 474 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2880  periplasmic serine protease DegS  34.75 
 
 		 368 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0120636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5537  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  31.61 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3244  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  33.33 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>