More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3244 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_3244  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 321 aa  640    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3890  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  76.76 
 
 		 317 aa  458  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.283543 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1244  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  61.05 
 
 		 330 aa  368  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1064  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  67.36 
 
 		 321 aa  316  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.235615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2314  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.88 
 
 		 293 aa  281  9e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4479  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  47.52 
 
 		 307 aa  237  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  48.15 
 
 		 513 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  45.71 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.55 
 
 		 450 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  45.14 
 
 		 379 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.17 
 
 		 366 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0424  2-alkenal reductase  43.79 
 
 		 444 aa  135  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.943038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  47.27 
 
 		 450 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0742  protease Do  44.44 
 
 		 451 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0204105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3362  protease Do  46.67 
 
 		 449 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0172053  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  46.34 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  46.34 
 
 		 404 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0721  protease Do  46.67 
 
 		 450 aa  132  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000974746  hitchhiker  0.002505 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3654  protease Do  46.67 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000180809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0700  protease Do  46.67 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00468675  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0730  protease Do  46.67 
 
 		 450 aa  132  9e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0286508  normal  0.0133644 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3731  protease DO  44.44 
 
 		 476 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.233243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  44.13 
 
 		 398 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  46.67 
 
 		 450 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  46.67 
 
 		 450 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  41.11 
 
 		 407 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  43.98 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1305  2-alkenal reductase  45.29 
 
 		 389 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  46.67 
 
 		 450 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  45.45 
 
 		 674 aa  131  1.0000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0580  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  38.67 
 
 		 361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  41.05 
 
 		 374 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  45.45 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3800  protease Do  38.78 
 
 		 456 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00053297  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  44.63 
 
 		 383 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5199  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.04 
 
 		 640 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.219359  normal  0.800514 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0890  2-alkenal reductase  42.77 
 
 		 480 aa  130  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.2841  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  43.02 
 
 		 383 aa  130  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6645  HtrA2 peptidase  39.29 
 
 		 469 aa  130  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239269 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.11 
 
 		 380 aa  130  3e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1396  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.37 
 
 		 372 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0139255  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3776  PDZ/DHR/GLGF  43.86 
 
 		 483 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0520  protease Do  46.63 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0469168  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0456  protease DegQ  46.63 
 
 		 457 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000901384  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.27 
 
 		 385 aa  130  4.0000000000000003e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1137  protease  46.63 
 
 		 463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0382173  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  45.12 
 
 		 403 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1243  HtrA2 peptidase  38.94 
 
 		 453 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  43.58 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0289  protease Do  43.65 
 
 		 456 aa  129  6e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0319386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  40.56 
 
 		 407 aa  129  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0100  protease DO  44.85 
 
 		 456 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000901293  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  43.98 
 
 		 545 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  43.53 
 
 		 465 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00160  serine endoprotease (protease Do), membrane-associated  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3441  protease Do  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0173  serine endoprotease  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  42.54 
 
 		 388 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  42.54 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4352  protease Do  39.57 
 
 		 456 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208163  decreased coverage  0.00128029 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0166  serine endoprotease  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3498  serine endoprotease  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0165  serine endoprotease  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  42.54 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0171  serine endoprotease  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1052  serine protease  42.42 
 
 		 471 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.72618  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6224  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  41.33 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.837533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  42.54 
 
 		 402 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0154  serine endoprotease  44.51 
 
 		 474 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0701  serine endoprotease  45.12 
 
 		 496 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  44.85 
 
 		 455 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  41.11 
 
 		 403 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0476  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  39.42 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.236131  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1797  protease Do  37.61 
 
 		 452 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.9 
 
 		 396 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2121  2-alkenal reductase  41.9 
 
 		 525 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3073  serine protease  46.99 
 
 		 449 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0102381  normal  0.200966 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  41.86 
 
 		 464 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24150  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  43.58 
 
 		 515 aa  127  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  39.17 
 
 		 511 aa  127  3e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1007  protease Do  45.35 
 
 		 453 aa  127  3e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000215082  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  44.77 
 
 		 392 aa  126  4.0000000000000003e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  41.99 
 
 		 387 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  41.71 
 
 		 386 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2259  protease Do  39.88 
 
 		 492 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.661037  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  41.86 
 
 		 375 aa  126  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  41.99 
 
 		 402 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  41.99 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  38.33 
 
 		 511 aa  126  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  38.33 
 
 		 511 aa  126  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0248  serine endoprotease  44.51 
 
 		 478 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0230  serine endoprotease  44.51 
 
 		 478 aa  126  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.02 
 
 		 442 aa  126  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  46.15 
 
 		 500 aa  126  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  40.91 
 
 		 458 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  44.24 
 
 		 450 aa  126  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0246  serine endoprotease  44.51 
 
 		 475 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.561258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0232  serine endoprotease  44.51 
 
 		 475 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0586414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0229  serine endoprotease  44.51 
 
 		 475 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0816  periplasmic serine protease  43.45 
 
 		 462 aa  125  6e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0094905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>