More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3072 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3072  putative serine protease protein  100 
 
 		 306 aa  622  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3418  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  98.69 
 
 		 306 aa  614  1e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3140  putative serine protease protein  73.88 
 
 		 305 aa  424  1e-117  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0843  Sel1 repeat-containing protein  43.09 
 
 		 482 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.502416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3396  trypsin-like serine protease  36.45 
 
 		 338 aa  110  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0221978 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0266  trypsin domain-containing protein  38.5 
 
 		 395 aa  108  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1924  endopeptidase  37.97 
 
 		 395 aa  106  4e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  29.71 
 
 		 772 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2673  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.18 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.314842 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  35.88 
 
 		 467 aa  100  3e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  30.84 
 
 		 472 aa  95.1  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0671  protease Do  39.75 
 
 		 473 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0470073  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  34.5 
 
 		 468 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  36.25 
 
 		 472 aa  92.4  8e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  32.37 
 
 		 471 aa  91.7  1e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.13 
 
 		 481 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.13 
 
 		 484 aa  91.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.63 
 
 		 483 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0497  protease DO  33.73 
 
 		 472 aa  89.7  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0231688  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2507  protease Do  34.43 
 
 		 461 aa  89.4  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0254484  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  33.73 
 
 		 472 aa  89  8e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1242  protease DO  33.73 
 
 		 472 aa  89.4  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000225025  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3676  peptidase S1C, Do  35.37 
 
 		 503 aa  89  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.769411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  34.94 
 
 		 513 aa  88.6  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  35.76 
 
 		 504 aa  88.2  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  33.53 
 
 		 471 aa  87.4  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0112  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.33 
 
 		 450 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.542288  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0769  endopeptidase  38.32 
 
 		 451 aa  86.3  6e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  33.53 
 
 		 466 aa  86.3  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  39.24 
 
 		 845 aa  85.9  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  33.13 
 
 		 484 aa  85.9  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1966  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  31.66 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000431561  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  33.91 
 
 		 476 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1396  serine protease, DO/DeqQ family  35.19 
 
 		 479 aa  85.1  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.333333  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  34.67 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  35.22 
 
 		 396 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1196  protease Do  37.72 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  34.55 
 
 		 464 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1117  protease Do  35.19 
 
 		 491 aa  85.1  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0590546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1371  protease Do  33.54 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.909738  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1440  periplasmic protease  33.54 
 
 		 514 aa  84.7  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.511031  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3736  2-alkenal reductase  34.98 
 
 		 399 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1292  serine protease HtrA, putative  33.71 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2317  protease Do  33.33 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  33.94 
 
 		 464 aa  84  0.000000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  33.33 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  33.74 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0175  trypsin-like serine protease  37.95 
 
 		 347 aa  83.6  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0707716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  33.13 
 
 		 459 aa  83.6  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.76 
 
 		 355 aa  83.6  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1742  serine protease  33.33 
 
 		 461 aa  83.2  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.378867  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0388  protease Do  33.33 
 
 		 461 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0675  serine protease  36.31 
 
 		 495 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2247  peptidase S1C, Do  38.04 
 
 		 497 aa  82.8  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2536  protease Do  32.56 
 
 		 494 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.483569  normal  0.898326 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  35.58 
 
 		 467 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2663  protease Do  32.56 
 
 		 494 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.94 
 
 		 417 aa  82.4  0.000000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1529  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.36 
 
 		 378 aa  82.4  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.456691  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0605  serine protease  36.77 
 
 		 483 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2439  serine protease  36.77 
 
 		 483 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0559  PDZ/DHR/GLGF domain protein  33.67 
 
 		 487 aa  82.4  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0053  serine protease  36.77 
 
 		 483 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  33.33 
 
 		 490 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3198  protease Do  32.82 
 
 		 474 aa  82.4  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0310  serine protease  36.77 
 
 		 495 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.636573  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1012  serine protease  36.77 
 
 		 495 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0848  serine protease  36.77 
 
 		 495 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.580249  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.8 
 
 		 408 aa  82.4  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0853  serine protease  36.77 
 
 		 495 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  34.57 
 
 		 496 aa  82  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1365  peptidase S1C, Do  32.1 
 
 		 482 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0859447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  34.33 
 
 		 375 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5947  peptidase S1C, Do  31.78 
 
 		 494 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2098  peptidase S1C, Do  33.94 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1471  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.76 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.284694  hitchhiker  0.000211937 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2645  protease Do  31.9 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1594  protease Do  34.44 
 
 		 520 aa  82  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2877  2-alkenal reductase  36.13 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  35.19 
 
 		 464 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2006  peptidase S1C, Do  32.21 
 
 		 493 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3219  HtrA2 peptidase  36.13 
 
 		 402 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228684  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2347  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  35.67 
 
 		 669 aa  81.6  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.253081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2616  protease Do  31.9 
 
 		 493 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2849  serine protease, DO/DeqQ family  33.54 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.489599  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  33.77 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  35.96 
 
 		 411 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2470  protease Do  33.54 
 
 		 506 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.769337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0682  protease Do  31.9 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.160737  normal  0.370456 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  30.99 
 
 		 472 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  37.04 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  33.88 
 
 		 348 aa  81.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  33.73 
 
 		 461 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1761  2-alkenal reductase  36.81 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000380843  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  33.77 
 
 		 492 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  28.02 
 
 		 457 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0471  protease Do  35.67 
 
 		 500 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0438945 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5059  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.59 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  34.15 
 
 		 485 aa  80.5  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  38.79 
 
 		 389 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>