More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2772 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2772  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 
355 aa  725    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643545  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  38.86 
 
 
500 aa  124  2e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  39.88 
 
 
397 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2815  protease Do  42.46 
 
 
485 aa  122  7e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.351815  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  42.11 
 
 
458 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  43.33 
 
 
501 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  43.48 
 
 
459 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0415  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 
483 aa  120  3.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0386  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 
484 aa  119  6e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0414  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.35 
 
 
481 aa  119  7e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  44.63 
 
 
516 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  43.65 
 
 
500 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  41.52 
 
 
457 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.8 
 
 
375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1086  protease Do  42.86 
 
 
501 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0760064 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1014  peptidase S1C, Do  41.38 
 
 
476 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3437  peptidase S1C, Do  38.8 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  42.86 
 
 
511 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  41.48 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0837  protease Do  41.57 
 
 
476 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0977  protease do  40.7 
 
 
471 aa  117  3e-25  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  42.39 
 
 
442 aa  117  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0197  HtrA2 peptidase  40.56 
 
 
369 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  43.2 
 
 
466 aa  116  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0764  peptidase S1C, Do  38.98 
 
 
471 aa  116  6e-25  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000251476  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  39.8 
 
 
411 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1160  protease Do  40.43 
 
 
498 aa  115  8.999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000336016  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  41.76 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  36.99 
 
 
475 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  41.76 
 
 
511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  40.91 
 
 
464 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.62 
 
 
405 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2746  2-alkenal reductase  40.48 
 
 
391 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  44.24 
 
 
462 aa  114  3e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  38.73 
 
 
485 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0080  protease degQ  40 
 
 
471 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  40.7 
 
 
468 aa  113  4.0000000000000004e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  41.38 
 
 
483 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  34.45 
 
 
482 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  41.38 
 
 
483 aa  113  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1169  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.64 
 
 
384 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0620  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  36.67 
 
 
674 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.5236  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0718  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  38.22 
 
 
424 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1528  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.05 
 
 
311 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0810  2-alkenal reductase  36.54 
 
 
487 aa  112  8.000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.810469 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5142  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  35.85 
 
 
614 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.309432  normal  0.441282 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0879  protease Do  39.39 
 
 
476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000781376  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0641  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.85 
 
 
381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  41.71 
 
 
499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  44.24 
 
 
493 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1771  peptidase S1C, Do  41.01 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0217208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2161  protease Do  41.01 
 
 
524 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2069  protease Do  41.01 
 
 
523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719287  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3922  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.16 
 
 
423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.155869  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  39.11 
 
 
379 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04311  trypsin-like serine protease  41.42 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1673  2-alkenal reductase  40.57 
 
 
381 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  40.85 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0031  protease Do  38.12 
 
 
453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00831551  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  44.91 
 
 
499 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  43.11 
 
 
372 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2895  2-alkenal reductase  39.04 
 
 
389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.253415  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1561  2-alkenal reductase  40.48 
 
 
402 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  44.24 
 
 
506 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  41.01 
 
 
400 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  44.24 
 
 
493 aa  110  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0986  HtrA2 peptidase  39.55 
 
 
382 aa  110  3e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00462206 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  40.8 
 
 
483 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1064  protease DO  40.12 
 
 
467 aa  110  4.0000000000000004e-23  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0185007  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0324  HtrA2 peptidase  34.21 
 
 
413 aa  110  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  34.69 
 
 
329 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  38.32 
 
 
487 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3737  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.78 
 
 
399 aa  109  6e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1119  protease Do  40.24 
 
 
503 aa  109  6e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  40.91 
 
 
464 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  37.57 
 
 
386 aa  109  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0676  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.19 
 
 
426 aa  109  7.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.146995  normal  0.128944 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0999  protease Do  38.42 
 
 
461 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0308  protease Do  35.65 
 
 
481 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.582048 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  42.6 
 
 
395 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2342  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.88 
 
 
367 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2130  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.17 
 
 
368 aa  109  8.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  35.71 
 
 
418 aa  109  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16941  trypsin-like serine protease  39.11 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16811  trypsin-like serine protease  39.11 
 
 
376 aa  109  9.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2209  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  40.2 
 
 
343 aa  109  9.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.30245 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3394  protease Do  36.69 
 
 
476 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0792545  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0935  hypothetical protein  37.99 
 
 
363 aa  108  1e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3457  protease Do  36.69 
 
 
476 aa  108  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2948  serine endoprotease  37.43 
 
 
478 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3672  2-alkenal reductase  38.1 
 
 
424 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1101  PDZ/DHR/GLGF  35.39 
 
 
385 aa  108  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.280141 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5469  2-alkenal reductase  36.36 
 
 
396 aa  108  1e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  hitchhiker  0.001726 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2461  protease Do  41.52 
 
 
487 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.282198 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1175  2-alkenal reductase  40.46 
 
 
397 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.561238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1243  2-alkenal reductase  40.46 
 
 
397 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.904095  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  39.53 
 
 
472 aa  108  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  38.95 
 
 
472 aa  108  2e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  40.46 
 
 
334 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0015  2-alkenal reductase  37.08 
 
 
411 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>