242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2778 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2778  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  399  9.999999999999999e-111  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0630256 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  32.83 
 
 		 205 aa  83.2  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1550  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.147371  normal  0.894594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7911  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0417125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 218 aa  56.2  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03754  transcription regulator protein  48.33 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.727658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1869  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 211 aa  52  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3490  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.20919 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4562  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.602927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  30.62 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1443  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.79888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  36.05 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2402  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.584484 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1584  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 225 aa  48.9  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 197 aa  48.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  22.09 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 220 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4675  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4681  transcriptional regulator  29.53 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.28 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 228 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 208 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3295  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53410  transcriptional regulator  28.86 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.733487  normal  0.037637 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0120  transcription regulator protein  40.74 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 232 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1560  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 207 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 226 aa  45.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 215 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 287 aa  45.8  0.0005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0312  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000380117  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0952  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 210 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0602788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 194 aa  45.4  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24090  transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10335  hypothetical protein  39.29 
 
 		 246 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.902876 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  39.34 
 
 		 226 aa  45.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>