167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_1779 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_1779  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  227  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0350078  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1769  hypothetical protein  97.27 
 
 		 1111 aa  226  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1610  Rhs element Vgr protein  97.27 
 
 		 1111 aa  226  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2697  Rhs element Vgr protein, putative  96.36 
 
 		 1111 aa  225  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1585  Rhs element Vgr protein  95.45 
 
 		 1111 aa  222  1e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2209  type VI secretion system Vgr family protein  85.45 
 
 		 895 aa  200  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7612  Rhs element Vgr protein  80.91 
 
 		 1114 aa  188  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2182  Rhs element Vgr protein  48.62 
 
 		 911 aa  105  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.368954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04256  hypothetical protein  47.62 
 
 		 328 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02040  Rhs element Vgr protein  42.59 
 
 		 847 aa  89  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406402  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01970  putative VGR-related protein  39.25 
 
 		 898 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.298061 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00004  Rhs element Vgr protein, putative  38.46 
 
 		 748 aa  70.5  0.000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00270  Rhs element Vgr protein  36.28 
 
 		 920 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00502  Rhs element Vgr protein  36.28 
 
 		 920 aa  65.5  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01958  putative VGR-related protein  34.51 
 
 		 918 aa  64.3  0.0000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.917398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02060  Rhs element Vgr protein  36.36 
 
 		 221 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4080  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 		 853 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2212  type VI secretion system Vgr family protein  33.96 
 
 		 981 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7615  Rhs element Vgr protein  31.78 
 
 		 984 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.874813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3043  type VI secretion system Vgr family protein  33.96 
 
 		 611 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.313865  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2693  Rhs element Vgr protein, putative  31.19 
 
 		 942 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2254  Rhs element Vgr protein  33.02 
 
 		 875 aa  56.6  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2206  type VI secretion system Vgr family protein  32.73 
 
 		 927 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1615  Rhs element Vgr protein  31.19 
 
 		 946 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0855  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1766  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1771  Rhs element Vgr protein  31.19 
 
 		 946 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.156841  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0169  hypothetical protein  29.52 
 
 		 741 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1377  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.369821  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0498  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1580  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0659  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1606  Rhs element Vgr protein  32.69 
 
 		 935 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29390  hypothetical protein  29.09 
 
 		 689 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1057  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.517121  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1269  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0412192  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4983  Rhs element Vgr protein  27.36 
 
 		 614 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0391  Rhs element Vgr protein  34.26 
 
 		 1094 aa  54.7  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.437245 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2044  Rhs element Vgr protein  33.65 
 
 		 680 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.909849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2705  Rhs element Vgr protein  31.73 
 
 		 932 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4617  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 		 850 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.761294  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3746  Rhs element Vgr protein  33.98 
 
 		 850 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0271118 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0240  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0511  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3777  type VI secretion system Vgr family protein  33.98 
 
 		 850 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.028091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5436  Rhs element Vgr protein  34.04 
 
 		 680 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2568  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2274  Rhs element Vgr protein  32.08 
 
 		 871 aa  54.7  0.0000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01160  hypothetical protein  29.52 
 
 		 741 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.73633  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1320  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.249702  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1401  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764688  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7609  Rhs element Vgr protein  32.73 
 
 		 947 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.823228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0204  Rhs element Vgr protein  31.13 
 
 		 869 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2744  type VI secretion system Vgr family protein  33.64 
 
 		 851 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1436  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 661 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.064161  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2357  type VI secretion system Vgr family protein  28.97 
 
 		 619 aa  53.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.116837 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43080  hypothetical protein  33.33 
 
 		 680 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000176027  normal  0.282542 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69550  hypothetical protein  33.33 
 
 		 680 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.256731  normal  0.401785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3778  type VI secretion system Vgr family protein  29.81 
 
 		 796 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.938556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2517  type VI secretion system Vgr family protein  28 
 
 		 616 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1590  Rhs element Vgr protein  30.28 
 
 		 946 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2538  Rhs element Vgr protein  31.73 
 
 		 680 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02464  Rhs element Vgr protein  32.26 
 
 		 906 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2631  Rhs element Vgr protein  32.35 
 
 		 684 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03644  Rhs element Vgr protein  32.26 
 
 		 906 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04700  Rhs element Vgr protein  36.45 
 
 		 979 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0006  type VI secretion system Vgr family protein  31.48 
 
 		 852 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0359048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0019  type VI secretion system Vgr family protein  30.19 
 
 		 730 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03020  putative VGR-related protein  31.63 
 
 		 885 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.318268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2169  Rhs element Vgr protein  30.85 
 
 		 933 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21450  hypothetical protein  36.27 
 
 		 688 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67230  hypothetical protein  35.24 
 
 		 790 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1944  putative VGR-related protein  31.96 
 
 		 865 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.463314 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3327  type VI secretion system Vgr family protein  32.32 
 
 		 850 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.702291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0820  Rhs element Vgr protein  36.47 
 
 		 694 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.476122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1191  Rhs element Vgr protein  28.44 
 
 		 703 aa  50.8  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18985  hypothetical protein  36.27 
 
 		 808 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000261066  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0201  type VI secretion system Vgr family protein  28.85 
 
 		 777 aa  50.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3960  hypothetical protein  28.18 
 
 		 689 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3222  putative VGR-related protein  32.32 
 
 		 547 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000721759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26600  Rhs element Vgr protein  32.35 
 
 		 687 aa  50.1  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.417964  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5730  type VI secretion system Vgr family protein  31.63 
 
 		 868 aa  49.7  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0627617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4488  Rhs element Vgr protein  33.01 
 
 		 702 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0107  Rhs element Vgr protein  31.37 
 
 		 693 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0958  putative VGR-related protein  32.53 
 
 		 907 aa  49.3  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.677133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4974  Rhs element Vgr protein  28.71 
 
 		 958 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0383  type VI secretion system Vgr family protein  30.84 
 
 		 1057 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2648  Rhs element Vgr protein  30.48 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01110  hypothetical protein  26.36 
 
 		 643 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0459  Rhs element Vgr protein  30.48 
 
 		 1063 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.139035  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0163  hypothetical protein  27.1 
 
 		 646 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.766784  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3106  hypothetical protein  28.3 
 
 		 618 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.166384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02029  Rhs element Vgr protein  35.51 
 
 		 928 aa  48.1  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5574  Rhs element Vgr protein  33.71 
 
 		 741 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0497  Rhs element Vgr protein  28.43 
 
 		 841 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3549  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 1074 aa  47.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.321828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2760  type VI secretion system Vgr family protein  27.1 
 
 		 613 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.68949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0367  Rhs element Vgr protein  30.84 
 
 		 1057 aa  47  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0434  type VI secretion system Vgr family protein  29.91 
 
 		 1063 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000011014 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2329  Rhs element Vgr protein  29.52 
 
 		 968 aa  47  0.00009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>