124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_1216 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA1902  major facilitator superfamily protein  98.1 
 
 		 415 aa  694    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1367  major facilitator superfamily protein  100 
 
 		 372 aa  725    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5646  major facilitator transporter  87.11 
 
 		 419 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0994  major facilitator superfamily protein  98.1 
 
 		 420 aa  808    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2953  major facilitator transporter  84.43 
 
 		 417 aa  636    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1692  major facilitator transporter  87.86 
 
 		 419 aa  657    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2343  major facilitator transporter  86.19 
 
 		 419 aa  652    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2304  major facilitator transporter  87.86 
 
 		 419 aa  657    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1054  major facilitator transporter  98.1 
 
 		 415 aa  694    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0814  major facilitator transporter  98.1 
 
 		 415 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1208  major facilitator transporter  97.63 
 
 		 422 aa  697    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1216  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  826    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0301654  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0337  major facilitator transporter  98.1 
 
 		 415 aa  694    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0974  major facilitator transporter  87.59 
 
 		 420 aa  658    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2327  major facilitator transporter  87.86 
 
 		 419 aa  657    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0588452  normal  0.321822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2223  major facilitator transporter  85.95 
 
 		 419 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1823  major facilitator transporter  86.7 
 
 		 419 aa  647    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0410288 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1521  major facilitator superfamily MFS_1  84.18 
 
 		 417 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.584523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3213  major facilitator transporter  53.1 
 
 		 426 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3123  major facilitator transporter  49.49 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.554502 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3444  major facilitator superfamily MFS_1  49.49 
 
 		 451 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3320  major facilitator superfamily MFS_1  48.28 
 
 		 453 aa  364  2e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.290278  normal  0.330714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0420  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 416 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2785  major facilitator superfamily permease  50.76 
 
 		 439 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.140286 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3527  major facilitator transporter  49.38 
 
 		 451 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6619  major facilitator transporter  48.75 
 
 		 446 aa  339  4e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0215095  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1276  major facilitator superfamily MFS_1  51.04 
 
 		 452 aa  339  4e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.234019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1145  major facilitator transporter  50.92 
 
 		 386 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.044656 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7368  major facilitator superfamily MFS_1  47.47 
 
 		 453 aa  327  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00609058  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2232  major facilitator transporter  36.97 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2467  major facilitator family transporter  36.8 
 
 		 417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3004  major facilitator transporter  34.83 
 
 		 423 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3356  major facilitator transporter  36.04 
 
 		 420 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.515977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4332  major facilitator transporter  36.8 
 
 		 424 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0947643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3425  major facilitator transporter  36.64 
 
 		 439 aa  217  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.246848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0516  major facilitator superfamily MFS_1  36.55 
 
 		 411 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4227  major facilitator transporter  34.9 
 
 		 425 aa  216  5.9999999999999996e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0992586  normal  0.574471 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12481  integral membrane transport protein  35.05 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4910  major facilitator transporter  35.7 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.300482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6055  major facilitator superfamily MFS_1  36.66 
 
 		 436 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921375  normal  0.153234 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2491  major facilitator transporter  32.85 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.6286 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2714  major facilitator superfamily MFS_1  32.85 
 
 		 439 aa  205  1e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.413206  normal  0.668996 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1990  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 434 aa  203  4e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.803027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1056  major facilitator superfamily MFS_1  35.52 
 
 		 428 aa  203  5e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1628  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 420 aa  202  8e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2389  major facilitator superfamily MFS_1  35.81 
 
 		 420 aa  202  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2331  major facilitator superfamily MFS_1  35.7 
 
 		 442 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0283  major facilitator transporter  36.89 
 
 		 433 aa  196  9e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.156067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2419  major facilitator superfamily MFS_1  33.41 
 
 		 438 aa  192  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5003  major facilitator superfamily MFS_1  36 
 
 		 421 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.408823  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2054  major facilitator transporter  32.34 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4401  major facilitator transporter  34.07 
 
 		 419 aa  169  9e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.897754  normal  0.140113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03962  MFS transporter  35.83 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3541  MFS permease  28.36 
 
 		 431 aa  167  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.72043  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1558  major facilitator transporter  30.55 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6392  major facilitator transporter  30.6 
 
 		 452 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.948234 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1837  major facilitator superfamily MFS_1  29.74 
 
 		 417 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.380991  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3710  major facilitator transporter  29.32 
 
 		 410 aa  156  8e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.13632 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0276  major facilitator superfamily MFS_1  30.29 
 
 		 411 aa  156  8e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1492  major facilitator transporter  29.26 
 
 		 426 aa  153  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1683  major facilitator superfamily MFS_1  29.92 
 
 		 417 aa  151  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.231948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6319  major facilitator transporter  31.37 
 
 		 421 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.248436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4446  major facilitator superfamily MFS_1  32.88 
 
 		 428 aa  146  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118945  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6496  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237094  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6731  major facilitator transporter  31.13 
 
 		 421 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.947065 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3247  major facilitator transporter  31.34 
 
 		 449 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.116449 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0169  major facilitator superfamily transporter  29.74 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  hitchhiker  0.00140228 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47253  predicted protein  25.49 
 
 		 473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0136621  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0571  major facilitator superfamily MFS_1  21.69 
 
 		 388 aa  61.2  0.00000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3934  major facilitator transporter  34.48 
 
 		 426 aa  58.5  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.243406 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0973  major facilitator transporter  28.99 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0924739  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1262  major facilitator transporter  32.26 
 
 		 421 aa  56.2  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0631224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2281  major facilitator superfamily MFS_1  25.57 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.976851  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2968  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277943 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2709  major facilitator superfamily MFS_1  30.14 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3032  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4594  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3519  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 437 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4724  tetracycline resistance protein, class B  30 
 
 		 401 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.357008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1865  General substrate transporter  25.37 
 
 		 463 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  29.61 
 
 		 392 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1682  major facilitator transporter  33.85 
 
 		 412 aa  48.9  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.707903  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0526  major facilitator transporter  23.8 
 
 		 384 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2646  galactoside permease  20.51 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1482  major facilitator superfamily MFS_1  26.16 
 
 		 403 aa  48.5  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000899768  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0422  major facilitator transporter  33.08 
 
 		 397 aa  47.8  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.186179  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0954  major facilitator superfamily MFS_1  31.88 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08760  MFS transporter, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13880)  29.41 
 
 		 542 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.194765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1620  major facilitator superfamily MFS_1  20.72 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00719862  normal  0.0630669 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1318  major facilitator transporter  19.27 
 
 		 406 aa  46.6  0.0007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0342  major facilitator superfamily permease  31.54 
 
 		 396 aa  46.6  0.0009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3535  major facilitator superfamily MFS_1  27.01 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.156699  normal  0.255134 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  30.97 
 
 		 416 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1928  major facilitator transporter  30.28 
 
 		 539 aa  45.8  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00178599  normal  0.278275 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0229  major facilitator family transporter  22.27 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.421152  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1149  drug resistance protein, putative  31.54 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.488645  normal  0.633567 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0244  major facilitator family transporter  22.27 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0256  major facilitator family transporter  22.27 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1006  major facilitator superfamily MFS_1  26.71 
 
 		 407 aa  45.1  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4254  major facilitator transporter  27.84 
 
 		 428 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.189853  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>