184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2100 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2100  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 252 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1842  ABC-2 type transporter  83.2 
 
 		 269 aa  341  5.999999999999999e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000710597 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2343  ABC-2 type transporter  55.24 
 
 		 304 aa  232  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.299179 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1990  putative integral membrane transport protein  50.41 
 
 		 261 aa  203  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13310  ABC-type multidrug transport system, permease component  54.39 
 
 		 245 aa  200  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.455926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14580  ABC-type multidrug transport system, permease component  49.18 
 
 		 264 aa  200  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1667  ABC-2 type transporter  52.96 
 
 		 262 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0830718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21990  ABC-type multidrug transport system, permease component  50.21 
 
 		 266 aa  199  3e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.164668  normal  0.979168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11460  ABC transporter efflux protein, DrrB family  60.92 
 
 		 258 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160921  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2219  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 		 261 aa  187  1e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000229601  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1137  ABC-2 type transporter  46.77 
 
 		 257 aa  185  7e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2544  ABC-2 type transporter  47.35 
 
 		 265 aa  184  9e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.408574  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  46.77 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5992  hypothetical protein  50.93 
 
 		 255 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal  0.149158 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1354  ABC-2 type transporter  52.7 
 
 		 257 aa  169  6e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.888329  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2966  ABC-2 type transporter  47.56 
 
 		 279 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2269  ABC-2 type transporter  45.49 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00770079  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2513  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  45.3 
 
 		 261 aa  166  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2079  ABC-2 type transporter  46.4 
 
 		 269 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.524343  normal  0.682712 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1975  ABC transporter protein  48.57 
 
 		 263 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.481432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2379  ABC drug efflux pump, inner membrane subunit, DrrB family  43.36 
 
 		 274 aa  156  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.866827  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2399  ABC-2 type transporter  41.32 
 
 		 241 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000992199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5163  ABC-2 type transporter  47.28 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.759639  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2729  multidrug ABC transporter inner membrane protein  46.31 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.11293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2250  ABC-2 type transporter  42.8 
 
 		 275 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000130225 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16090  ABC-type multidrug transport system, permease component  45.16 
 
 		 268 aa  148  9e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.696284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2920  ABC-2 type transporter  50.83 
 
 		 263 aa  143  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11485  antibiotic ABC transporter membrane protein  42.74 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.574168  normal  0.62449 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3681  multidrug ABC transporter inner membrane protein  41.56 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.332995  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2432  ABC transporter, DrrB efflux protein  43.44 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2477  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.44 
 
 		 258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2468  multidrug ABC transporter inner membrane protein  43.03 
 
 		 258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0192  ABC-2 type transporter  40.41 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7344  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  26.78 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2549  hypothetical protein  29 
 
 		 246 aa  71.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  25.94 
 
 		 339 aa  70.9  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1686  hypothetical protein  28.23 
 
 		 280 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0285  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.44 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1206  ABC-2 type transporter  33.54 
 
 		 243 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.1 
 
 		 360 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1548  ABC-2 type transporter  29.33 
 
 		 366 aa  66.2  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.299648  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0014  ABC transporter permease  30.85 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.189407  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  24.52 
 
 		 244 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4560  ABC-2 type transporter  28.5 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4396  ABC-2 type transporter  29.18 
 
 		 272 aa  62  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.368093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3873  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.249696  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5152  ABC-2 type transporter  24.52 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  29.76 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  34.98 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5533  putative ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  27.51 
 
 		 261 aa  60.1  0.00000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4256  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 249 aa  59.7  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5202  ABC transporter permease  23.56 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5599  ABC transporter permease  23.56 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4005  ABC-2 type transporter  24.9 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101832  hitchhiker  0.000201414 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0014  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 251 aa  59.7  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153169  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 244 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1936  ABC-2 type transporter  30.91 
 
 		 286 aa  58.5  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0909  ABC transporter protein  27.31 
 
 		 276 aa  58.5  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.982909  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.08 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.08 
 
 		 244 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  29.22 
 
 		 250 aa  58.2  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2587  ABC multidrug efflux transporter, inner membrane subunit  31.52 
 
 		 286 aa  58.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  25.11 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0608  ABC-2 type transporter  26.73 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1245  ABC-2 type transporter  31.52 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0464218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5446  putative ABC transporter, permease protein  23.08 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0674  ABC-2 type transporter  26.94 
 
 		 272 aa  57  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.890968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  28.21 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2004  ABC-2 type transporter  26.63 
 
 		 257 aa  56.6  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.49989  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0013  ABC-2 type transporter  29.34 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  29.96 
 
 		 267 aa  55.1  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3455  ABC transporter permease  29.59 
 
 		 239 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  24.39 
 
 		 249 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3623  ABC-2 type transporter  25.37 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3931  ABC-2 type transporter  29.44 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.284935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3695  ABC-2 type transporter  27.94 
 
 		 250 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.869493  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2681  ABC-2 type transporter  24.3 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.75118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0375  ABC-2 type transporter  28.11 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.133292  hitchhiker  0.00534901 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0703  ABC-2 type transporter  24.24 
 
 		 363 aa  53.1  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.422501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0825  ABC-type multidrug transport system permease component-like protein  28.69 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0249  hypothetical protein  28.57 
 
 		 281 aa  52  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.112673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0010  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 280 aa  52  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4761  ABC-2 type transporter  24.5 
 
 		 261 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000109025  hitchhiker  0.000621886 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1264  ABC-2 type transporter  25.73 
 
 		 244 aa  51.2  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.351658  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  25.48 
 
 		 375 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  27.18 
 
 		 260 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29920  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.67 
 
 		 285 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.207401  normal  0.6858 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1722  ABC transporter protein  29.81 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611167  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  31.3 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0030  ABC-2 type transporter  28.57 
 
 		 272 aa  50.1  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  31.79 
 
 		 264 aa  50.4  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  29.17 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0723  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 		 272 aa  49.7  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756908 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5840  ABC-2 type transporter  22.42 
 
 		 367 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.564028 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  27.27 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2148  putative ABC transporter, permease protein  29.29 
 
 		 327 aa  49.3  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.249033  normal  0.497773 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  26.46 
 
 		 267 aa  48.9  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>