285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0853 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  100 
 
 
159 aa  317  3e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0969  transcriptional regulator, MarR family  66.01 
 
 
165 aa  204  4e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
174 aa  70.5  0.000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  37.62 
 
 
172 aa  64.7  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  31.11 
 
 
178 aa  63.9  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 
154 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1037  transcriptional regulator, MarR family  38.1 
 
 
174 aa  63.5  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  38.54 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  33.1 
 
 
157 aa  61.2  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  37.36 
 
 
172 aa  60.8  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  40.62 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4863  MarR family transcriptional regulator  41.24 
 
 
157 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.238839  normal  0.273246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  36.26 
 
 
146 aa  57  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  35.51 
 
 
156 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  35.46 
 
 
201 aa  55.8  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2733  MarR family transcriptional regulator  40.48 
 
 
147 aa  56.2  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
170 aa  55.1  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0877  MarR family transcriptional regulator  27.21 
 
 
159 aa  54.3  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.600163  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3524  transcriptional regulator, MarR family  28.32 
 
 
158 aa  54.3  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000157721  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 
149 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  29.93 
 
 
170 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2827  MarR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170863  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2799  MarR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2762  MarR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
142 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3330  transcription repressor  33.33 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0423629  normal  0.0632269 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3041  MarR family transcriptional regulator  22.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.726471  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3032  transcriptional regulator, MarR family  22.97 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 
161 aa  53.1  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7677  hypothetical protein  35.11 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00437604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  33.96 
 
 
165 aa  53.1  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  50.91 
 
 
171 aa  52.4  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
139 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  42.19 
 
 
149 aa  52.4  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  32 
 
 
158 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
151 aa  52  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2765  MarR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
167 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0576767  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2729  MarR family transcriptional regulator  35.9 
 
 
146 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.784506 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4752  MarR family transcriptional regulator  36.78 
 
 
152 aa  51.6  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0630735  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  29.21 
 
 
160 aa  51.6  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  41.33 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3045  transcriptional regulator, MarR family  22.3 
 
 
142 aa  51.2  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2325  transcription regulator protein  36.59 
 
 
165 aa  50.8  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.23825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3076  MarR family transcriptional regulator  22.3 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0371862  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2205  transcriptional regulator, MarR family  22.3 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00450336  hitchhiker  0.0000000000000144268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
173 aa  50.8  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3071  transcriptional regulator, MarR family  22.97 
 
 
142 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.611663  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3807  MarR family transcriptional regulator  34.18 
 
 
143 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.211999  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2753  MarR family transcriptional regulator  34.83 
 
 
299 aa  50.8  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0669 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0113  MarR family transcriptional regulator  35.79 
 
 
141 aa  50.8  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.51786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  41.76 
 
 
149 aa  50.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06185  transcriptional regulator, marR family protein  27.08 
 
 
144 aa  50.4  0.000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2828  MarR family transcriptional regulator  26.45 
 
 
142 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.940435  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  40 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 
164 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2677  MarR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
153 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  33.72 
 
 
161 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1859  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 
157 aa  50.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.89352  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  39.77 
 
 
151 aa  49.7  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0763  MarR family transcriptional regulator  30.43 
 
 
156 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.124951  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3626  MarR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
160 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00335375  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3221  MarR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
153 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 
192 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  39.09 
 
 
156 aa  49.3  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2759  regulatory protein, MarR  34.69 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196833  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  27.78 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  50.94 
 
 
164 aa  49.7  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4203  transcriptional regulator, MarR family  40.45 
 
 
161 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7850  transcriptional regulator, MarR family  43.04 
 
 
143 aa  49.7  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.172522  normal  0.477187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  40.85 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5248  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.282441  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2226  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  31.25 
 
 
291 aa  48.9  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.326568  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  30.3 
 
 
157 aa  48.9  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5336  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.293186 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  40.66 
 
 
138 aa  48.9  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2004  transcriptional regulator, MarR family  39.39 
 
 
167 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.781258  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5627  MarR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
151 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.281141  normal  0.686349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  36.26 
 
 
159 aa  48.9  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  32.48 
 
 
149 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  37.35 
 
 
150 aa  48.5  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  31.65 
 
 
155 aa  48.5  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  27.07 
 
 
188 aa  48.1  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  50.94 
 
 
160 aa  48.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2302  transcriptional regulator, MarR family  37.04 
 
 
127 aa  48.1  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.448203  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  38.46 
 
 
145 aa  48.1  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
142 aa  47.8  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1940  transcriptional regulator, MarR family  43.55 
 
 
159 aa  47.4  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  28.46 
 
 
175 aa  47.8  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0758  transcriptional regulator  45.45 
 
 
162 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.379408 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0135  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
157 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0405255  normal  0.71696 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0856  MarR family transcriptional regulator  34.4 
 
 
146 aa  47.4  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.859075  normal  0.01483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2529  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  30.36 
 
 
291 aa  47.4  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2752  MarR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
159 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0417987  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4024  MarR family transcriptional regulator  31.19 
 
 
145 aa  47  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
150 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3062  transcriptional regulator, MarR family  28.44 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.455637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0022  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
142 aa  47  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1280  transcriptional regulator, MarR family  48.21 
 
 
153 aa  47  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0756045  normal  0.498552 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>