More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_1042 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  62.91 
 
 		 608 aa  743    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  100 
 
 		 599 aa  1238    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  68.3 
 
 		 596 aa  786    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  54.22 
 
 		 580 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  52.86 
 
 		 609 aa  587  1e-166  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  49.46 
 
 		 589 aa  566  1e-160  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  47.33 
 
 		 597 aa  556  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.4 
 
 		 581 aa  555  1e-156  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  43.83 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  43.83 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  43.14 
 
 		 619 aa  472  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.09 
 
 		 580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  42.5 
 
 		 593 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  41.55 
 
 		 595 aa  445  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.51 
 
 		 583 aa  436  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  37.23 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  37.23 
 
 		 587 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.47 
 
 		 1091 aa  405  1e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.57 
 
 		 576 aa  398  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.03 
 
 		 592 aa  373  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.2 
 
 		 597 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.07 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.56 
 
 		 604 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.68 
 
 		 583 aa  355  1e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  37.25 
 
 		 593 aa  346  6e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  37.57 
 
 		 606 aa  343  4e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 590 aa  342  8e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  38.89 
 
 		 598 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.07 
 
 		 627 aa  336  7e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 599 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.37 
 
 		 584 aa  335  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.88 
 
 		 1194 aa  334  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  36.18 
 
 		 596 aa  332  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 		 618 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  31.26 
 
 		 602 aa  329  9e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.19 
 
 		 618 aa  327  5e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.54 
 
 		 579 aa  324  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  35.94 
 
 		 677 aa  321  3e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  36.1 
 
 		 611 aa  319  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  32.47 
 
 		 588 aa  313  5.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.68 
 
 		 576 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.82 
 
 		 577 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.03 
 
 		 590 aa  310  6.999999999999999e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.55 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  32.03 
 
 		 590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.52 
 
 		 573 aa  307  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.86 
 
 		 609 aa  306  9.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.02 
 
 		 1228 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.5 
 
 		 588 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.95 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  33.61 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.52 
 
 		 581 aa  300  4e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.25 
 
 		 578 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.21 
 
 		 592 aa  296  7e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.13 
 
 		 579 aa  296  8e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.35 
 
 		 600 aa  296  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  33.7 
 
 		 574 aa  293  4e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.24 
 
 		 581 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.78 
 
 		 1138 aa  293  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.95 
 
 		 603 aa  293  8e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  37.02 
 
 		 596 aa  291  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.86 
 
 		 577 aa  290  6e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  35.64 
 
 		 593 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 		 572 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 575 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  32.68 
 
 		 603 aa  287  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  32.66 
 
 		 596 aa  286  5e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 		 612 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 		 574 aa  286  8e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.78 
 
 		 588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  33.06 
 
 		 587 aa  283  5.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.33 
 
 		 568 aa  283  7.000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  32.59 
 
 		 596 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.5 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.5 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  34.62 
 
 		 603 aa  281  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  32.94 
 
 		 588 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.02 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  29.9 
 
 		 578 aa  280  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  29.9 
 
 		 578 aa  280  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  32.5 
 
 		 606 aa  280  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.6 
 
 		 578 aa  279  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  30.26 
 
 		 597 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  32.88 
 
 		 579 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.55 
 
 		 573 aa  277  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.71 
 
 		 605 aa  276  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  32.46 
 
 		 600 aa  276  5e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  34.38 
 
 		 624 aa  276  6e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 581 aa  275  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.09 
 
 		 582 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.31 
 
 		 579 aa  275  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  35.31 
 
 		 619 aa  274  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  32.8 
 
 		 598 aa  274  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.58 
 
 		 586 aa  272  1e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  31.21 
 
 		 584 aa  272  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  33.53 
 
 		 581 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  31.34 
 
 		 589 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.71 
 
 		 607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.08 
 
 		 580 aa  270  5.9999999999999995e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>