More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2750 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2750  rhomboid family protein  100 
 
 		 369 aa  684    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.717687 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2888  Rhomboid family protein  48.81 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0497694  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2980  Rhomboid family protein  47.81 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0252324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2794  rhomboid-like protein  46.93 
 
 		 360 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.89322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2772  Rhomboid family protein  35.78 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0134259  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3861  putative intramembrane serine protease  40.3 
 
 		 554 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0021  Rhomboid family protein  37.13 
 
 		 303 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0711  Rhomboid family protein  33.93 
 
 		 515 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.535917 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1860  Rhomboid family protein  32.98 
 
 		 519 aa  91.7  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000892671  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1071  rhomboid family protein  42.7 
 
 		 279 aa  90.5  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254711 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0069  Rhomboid family protein  44.52 
 
 		 292 aa  89.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0209  rhomboid family protein  32.13 
 
 		 226 aa  88.6  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.292506  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3394  Rhomboid family protein  32.32 
 
 		 198 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2719  Rhomboid family protein  32.32 
 
 		 198 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.581136  normal  0.114622 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0909  rhomboid family protein  36.11 
 
 		 523 aa  87.4  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.710652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1048  rhomboid family protein  37.5 
 
 		 511 aa  87.4  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2381  Rhomboid family protein  34.34 
 
 		 389 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1114  rhomboid family protein  26.48 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0993  rhomboid family protein  35.76 
 
 		 541 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31680  predicted protein  37.7 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0246535  normal  0.737397 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1842  rhomboid-like protein  33.09 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000517898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1881  rhomboid-like protein  33.45 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0191  Rhomboid family protein  34.25 
 
 		 386 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0674  membrane-associated serine protease  30.21 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.263581  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5753  rhomboid family protein  38.54 
 
 		 290 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0172846 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1705  rhomboid family protein  33.77 
 
 		 342 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.745116  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02120  uncharacterized membrane protein  37.59 
 
 		 305 aa  82.8  0.000000000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.457704  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2385  rhomboid-like protein  31.83 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2462  rhomboid-like protein  42.57 
 
 		 371 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2850  Rhomboid family protein  38.3 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04802  hypothetical protein  38.54 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.113999 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1438  rhomboid family protein  33.12 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0736  hypothetical protein  33.01 
 
 		 362 aa  79  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2492  Rhomboid family protein  31.02 
 
 		 579 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0058  rhomboid family protein  34.62 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3385  rhomboid family protein  44.33 
 
 		 541 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3276  Rhomboid family protein  32.51 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5529  rhomboid family protein  35.68 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.360648 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0958  rhomboid family protein  44.33 
 
 		 547 aa  76.6  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00140  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0543  rhomboid family protein  31.1 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0774  rhomboid family protein  34.47 
 
 		 360 aa  76.3  0.0000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3513  rhomboid family protein  31.91 
 
 		 286 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5148  rhomboid-like protein  35.68 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5237  rhomboid family protein  35.68 
 
 		 289 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00959103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10111  integral membrane protein  35.86 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000358908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0334  rhomboid family protein  37.82 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.589878  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0014  Rhomboid family protein  34.03 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000779401 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0352  rhomboid family protein  37.82 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1641  rhomboid family protein  28.49 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.423795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0106  rhomboid-like protein  33.5 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1607  rhomboid family protein  28.49 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0693268  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4044  Rhomboid family protein  32.31 
 
 		 513 aa  73.6  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.887377 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3255  rhomboid-like protein  32.06 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.709043  normal  0.549561 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2298  Rhomboid family protein  41.79 
 
 		 230 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2194  rhomboid family protein  40 
 
 		 489 aa  72.4  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.456574 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0020  Rhomboid family protein  32.58 
 
 		 315 aa  71.2  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1384  membrane-associated serine protease  35.05 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000348789  hitchhiker  4.81213e-16 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1449  Rhomboid family protein  36 
 
 		 263 aa  71.2  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.6312  normal  0.568925 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2989  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  35.33 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00624  conserved hypothetical protein  35.33 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3784  rhomboid family protein  35.8 
 
 		 283 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00614  hypothetical protein  35.33 
 
 		 625 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21960  uncharacterized membrane protein  31.58 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00559972  decreased coverage  0.002494 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0014  Rhomboid family protein  46.67 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4995  rhomboid family protein  40.4 
 
 		 303 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  decreased coverage  0.00000450745 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1200  rhomboid family protein  35.18 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.302256  normal  0.536903 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1000  rhomboid family protein  38.58 
 
 		 528 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0012  Rhomboid family protein  35.07 
 
 		 282 aa  69.7  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0125  rhomboid family protein  34.66 
 
 		 381 aa  69.7  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2160  rhomboid family protein  33.65 
 
 		 243 aa  69.7  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.251589  normal  0.196437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7801  hypothetical protein  35.86 
 
 		 245 aa  69.7  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.990932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3291  rhomboid family protein  37.4 
 
 		 525 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3068  rhomboid family protein  36.99 
 
 		 298 aa  69.3  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000231601  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1663  integral membrane protein  31.07 
 
 		 220 aa  69.3  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.771185  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0829  rhomboid family protein  38.17 
 
 		 520 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.186643  normal  0.166239 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4481  rhomboid family protein  38.41 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.46562  normal  0.0126709 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0228  Rhomboid family protein  33.64 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  0.611688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0685  S54 family peptidase  34.48 
 
 		 625 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.085166  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2553  rhomboid family protein  31.19 
 
 		 229 aa  68.6  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05680  peptidase, S54 (rhomboid) family, putative  32.56 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.811656  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1890  rhomboid-like protein  31.09 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.56685  normal  0.043367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6787  Rhomboid family protein  42.39 
 
 		 280 aa  68.2  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132625 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1609  rhomboid family protein  30.58 
 
 		 220 aa  68.2  0.0000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0056  Rhomboid family protein  28.91 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0013  rhomboid family protein  35.66 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.000112499  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0019  Rhomboid family protein  46.81 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3194  rhomboid family protein  37.4 
 
 		 520 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1514  rhomboid family protein  34.08 
 
 		 639 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0042  rhomboid family protein  30.26 
 
 		 396 aa  67.4  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1811  membrane-associated serine protease  32.57 
 
 		 224 aa  67  0.0000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1812  Rhomboid family protein  33.33 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00264176  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2879  Rhomboid family protein  35.9 
 
 		 224 aa  65.5  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00720  uncharacterized membrane protein  33.33 
 
 		 313 aa  65.5  0.000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1655  rhomboid family protein  29.95 
 
 		 376 aa  65.1  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.51113  normal  0.445143 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2942  rhomboid family protein  32.5 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00611341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2486  Rhomboid family protein  32.37 
 
 		 240 aa  65.5  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.19288  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3495  rhomboid family protein  34.42 
 
 		 297 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.335831 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0919  membrane-associated serine protease  28.81 
 
 		 236 aa  65.1  0.000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.473127  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0980  rhomboid family protein  30.53 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>