83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_1730 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_1730  hypothetical protein  100 
 
 
230 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.399565  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0333  hypothetical protein  69.49 
 
 
259 aa  267  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.274044  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0322  hypothetical protein  67.61 
 
 
258 aa  267  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.631089  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0311  hypothetical protein  68.7 
 
 
256 aa  252  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6689  hypothetical protein  50.89 
 
 
226 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0339432  normal  0.323888 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5786  hypothetical protein  50.45 
 
 
226 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0642937 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3084  hypothetical protein  50.22 
 
 
223 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.160191  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0416  hypothetical protein  44.59 
 
 
226 aa  188  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3158  hypothetical protein  46.43 
 
 
229 aa  184  7e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3479  putative spermidine synthase  50.74 
 
 
228 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.744085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2873  hypothetical protein  50.22 
 
 
223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.478117  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4395  hypothetical protein  50.21 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.167222  normal  0.681676 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2427  hypothetical protein  49.55 
 
 
223 aa  177  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.152431  decreased coverage  0.00356275 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2709  hypothetical protein  48.43 
 
 
223 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.388652  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1836  hypothetical protein  51.79 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5586  hypothetical protein  49.11 
 
 
224 aa  173  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196693  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6276  hypothetical protein  51.36 
 
 
226 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3004  hypothetical protein  47.32 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.723508  normal  0.126296 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2777  hypothetical protein  47.77 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.565366  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2900  hypothetical protein  49.77 
 
 
241 aa  170  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.537403  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1945  hypothetical protein  51.34 
 
 
222 aa  170  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.677507 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2221  hypothetical protein  51.34 
 
 
222 aa  169  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.724367 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6395  hypothetical protein  48.23 
 
 
229 aa  167  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1380  hypothetical protein  47.75 
 
 
224 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.147375 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2514  hypothetical protein  48.33 
 
 
235 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2952  parallel beta-helix repeat-containing protein  42.29 
 
 
225 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.366073 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1008  hypothetical protein  42.65 
 
 
225 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000136186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1942  hypothetical protein  46.51 
 
 
223 aa  163  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1397  hypothetical protein  47 
 
 
228 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2978  hypothetical protein  52.04 
 
 
234 aa  157  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.140741  normal  0.0506844 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3078  hypothetical protein  43.67 
 
 
254 aa  154  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1949  spermidine synthase-like protein  46.3 
 
 
224 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4725  hypothetical protein  48.13 
 
 
241 aa  145  5e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal  0.100383 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3145  spermidine synthase-like protein  42.34 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2508  hypothetical protein  39.73 
 
 
243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1116  spermidine synthase-like protein  42.34 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2847  spermidine synthase-like protein  41.52 
 
 
232 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00416232  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2076  hypothetical protein  42.6 
 
 
225 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2635  putative spermidine synthase  39.91 
 
 
222 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00206926  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0173  hypothetical protein  41.87 
 
 
238 aa  123  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0542  spermidine synthase-like protein  39.78 
 
 
233 aa  112  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.654056  hitchhiker  0.00189431 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2397  hypothetical protein  37.24 
 
 
230 aa  107  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.0000000000263434  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5385  Spermine synthase  38.73 
 
 
244 aa  106  2e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1060  hypothetical protein  46.56 
 
 
227 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1965  Spermine synthase  29.83 
 
 
227 aa  101  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000563558  normal  0.560071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0451  spermidine synthase-like protein  40 
 
 
233 aa  101  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1530  hypothetical protein  37.5 
 
 
238 aa  76.3  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.577651  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1877  hypothetical protein  28.03 
 
 
240 aa  73.2  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0693  hypothetical protein  33.19 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1091  hypothetical protein  28.16 
 
 
248 aa  59.3  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.88322 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1936  hypothetical protein  37.41 
 
 
278 aa  53.1  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.31207  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  31.44 
 
 
520 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  31.96 
 
 
520 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  31.96 
 
 
520 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  33.15 
 
 
349 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  33.7 
 
 
375 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  30.61 
 
 
305 aa  51.2  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0951  spermine synthase  32.37 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18222  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2353  spermidine synthase  31.79 
 
 
307 aa  49.3  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0729  hypothetical protein  31.37 
 
 
278 aa  49.3  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  30 
 
 
523 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2661  Spermine synthase  35 
 
 
1078 aa  48.5  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.530948  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2756  Spermine synthase  35 
 
 
1078 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1209  hypothetical protein  35 
 
 
1079 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.494717  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  35.43 
 
 
538 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0746  spermidine synthase  34.95 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  22.63 
 
 
283 aa  47.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0714  spermidine synthase  34.95 
 
 
320 aa  47.4  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  30.97 
 
 
312 aa  47  0.0003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4694  spermidine synthase  32.52 
 
 
522 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  27.94 
 
 
310 aa  46.2  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3503  Spermine synthase  36.96 
 
 
520 aa  45.4  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.389459  normal  0.637875 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2066  hypothetical protein  30.99 
 
 
275 aa  45.4  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  28.3 
 
 
314 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  21.9 
 
 
283 aa  44.7  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1879  Spermine synthase  35.64 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1569  spermidine synthase  24.71 
 
 
508 aa  43.9  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2111  spermidine synthase  33.81 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0111  spermidine synthase  25.57 
 
 
498 aa  43.5  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.5367  normal  0.241238 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  31.16 
 
 
286 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  31.54 
 
 
286 aa  42  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0336  spermine synthase  25.77 
 
 
235 aa  41.6  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1235  spermidine synthase  28 
 
 
267 aa  41.6  0.01  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.265162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>