237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0336 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0336  spermine synthase  100 
 
 		 235 aa  478  1e-134  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0951  spermine synthase  62.78 
 
 		 228 aa  280  2e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18222  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0772  spermine synthase / spermidine synthase  36.67 
 
 		 289 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0239  spermine synthase  33.33 
 
 		 291 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.435342 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0284  spermine synthase  33.33 
 
 		 289 aa  118  7e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.774661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1460  Spermine synthase  34.6 
 
 		 304 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1732  spermidine synthase  32.58 
 
 		 291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4001  spermidine synthase  35.29 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1016  spermidine synthase  35.09 
 
 		 287 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1312  spermine synthase  31.25 
 
 		 291 aa  112  5e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.690465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1864  spermidine synthase  33.78 
 
 		 286 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0174037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0886  spermidine synthase  33.03 
 
 		 310 aa  111  8.000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.176516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0536  spermidine synthase  36.36 
 
 		 289 aa  110  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.326149  normal  0.292064 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2055  spermidine synthase  32.88 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42690  spermidine synthase  34.09 
 
 		 286 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3482  spermidine synthase  34.07 
 
 		 296 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00378102  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3354  spermidine synthase  34.07 
 
 		 296 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000276507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1023  spermidine synthase  34.07 
 
 		 296 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2191  spermidine synthase  35.41 
 
 		 287 aa  107  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0930161  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2253  spermine synthase / spermidine synthase  31.72 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.158612 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3129  spermidine synthase  33.78 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00120  spermidine synthase  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00387054  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3481  spermidine synthase  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013489  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3538  spermidine synthase  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00580941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0128  spermidine synthase  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000545109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0123  spermidine synthase  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.705101  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0131  spermidine synthase  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.316229  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00119  hypothetical protein  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00179737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0125  spermidine synthase  33.79 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000567912  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3584  spermidine synthase  33.18 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.641371  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0114  spermidine synthase  33.33 
 
 		 288 aa  104  1e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000001847  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0181  spermidine synthase  33.79 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2020  Spermine synthase  30.59 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0190  spermidine synthase  33.79 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.241142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0185  spermidine synthase  33.79 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0198  spermidine synthase  33.79 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0182  spermidine synthase  33.79 
 
 		 286 aa  103  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2046  Spermine synthase  30.59 
 
 		 308 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.839676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0669  spermidine synthase  33.33 
 
 		 289 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000146027  normal  0.395519 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23820  spermidine synthase  32.73 
 
 		 286 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2836  spermidine synthase  33.79 
 
 		 287 aa  102  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00687  SPEE_NEUCR Spermidine synthase (Putrescine aminopropyltransferase) (SPDSY)Spermidine synthase ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96UK1]  34.29 
 
 		 292 aa  100  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0245042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1691  spermidine synthase  32.38 
 
 		 283 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1858  Spermine synthase  30.18 
 
 		 314 aa  99.4  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63120  hypothetical protein  30.97 
 
 		 349 aa  99  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00932566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1565  Spermine synthase  31.84 
 
 		 312 aa  98.6  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.673187  normal  0.0572452 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1382  spermine synthase  28.9 
 
 		 305 aa  97.8  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00501465  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5495  hypothetical protein  31.72 
 
 		 375 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1627  spermidine synthase  31.75 
 
 		 290 aa  93.6  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0722  spermidine synthase  33.9 
 
 		 308 aa  93.6  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.145284  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0155  spermidine synthase  31.8 
 
 		 276 aa  92  7e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.164944  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4961  Spermine synthase  32.26 
 
 		 313 aa  92  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.787243 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2229  spermidine synthase  31.72 
 
 		 279 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0529  spermidine synthase  29.63 
 
 		 283 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0515  spermidine synthase  29.63 
 
 		 283 aa  90.9  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40897  Spermidine synthase  29.55 
 
 		 328 aa  91.3  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.862336 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0488  spermidine synthase  29.68 
 
 		 277 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000641505  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2546  spermidine synthase  31.28 
 
 		 291 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18761  spermidine synthase  30.45 
 
 		 283 aa  89.7  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.443872  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1107  spermidine synthase  30.28 
 
 		 326 aa  89.7  4e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84352  predicted protein  33.78 
 
 		 300 aa  89.7  4e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0060  spermidine synthase  39.13 
 
 		 281 aa  89.4  5e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1979  spermidine synthase  38.36 
 
 		 275 aa  89  6e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000450983  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1778  spermidine synthase  29.55 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.251916  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18951  spermidine synthase  27.4 
 
 		 283 aa  89  7e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.454611  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2884  spermidine synthase  29.02 
 
 		 292 aa  87.8  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2590  spermidine synthase  29.96 
 
 		 280 aa  87  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.138188 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0694  spermidine synthase  28.64 
 
 		 275 aa  86.7  3e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.251821  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12620  spermidine synthase  33.03 
 
 		 523 aa  85.5  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.737758 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0383  spermine synthase  27.78 
 
 		 291 aa  85.5  6e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1964  spermidine synthase  31.28 
 
 		 291 aa  85.9  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.569543  normal  0.368438 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2169  spermidine synthase  31.32 
 
 		 296 aa  85.5  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0628  spermidine synthase  31.96 
 
 		 286 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.414724  normal  0.905176 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_55177  spermine/spermidine synthase  31.43 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0120  spermidine synthase  26.85 
 
 		 304 aa  84.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.14036  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1882  spermidine synthase  34.2 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.710411  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1928  spermidine synthase  34.2 
 
 		 520 aa  83.6  0.000000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13386  spermine/spermidine synthase  34.36 
 
 		 275 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1075  spermidine synthase  27.31 
 
 		 289 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000310388  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1862  spermidine synthase  34.63 
 
 		 520 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  0.111222 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0206  spermidine synthase  30.41 
 
 		 277 aa  83.6  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1580  spermidine synthase  28.44 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29501  spermidine synthase  31.79 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1417  spermidine synthase  29.94 
 
 		 288 aa  83.2  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3054  spermidine synthase  34.31 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2794  spermidine synthase  26.7 
 
 		 286 aa  82  0.000000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0275  spermidine synthase  33.93 
 
 		 293 aa  82  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0154876  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1389  spermidine synthase  32.52 
 
 		 284 aa  82  0.000000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.625706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0277  spermidine synthase  33.93 
 
 		 296 aa  81.3  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.173175  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0182  spermidine synthase  28.57 
 
 		 284 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000125359  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0668  spermidine synthase  33.79 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.672197  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0309  spermidine synthase  30.14 
 
 		 271 aa  81.3  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3392  spermidine synthase  30.33 
 
 		 290 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00712121  hitchhiker  0.00406842 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1395  Spermine synthase  23.83 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4705  spermidine synthase  31.31 
 
 		 283 aa  80.5  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.725574 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0602  spermidine synthase  32.85 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1156  Spermine synthase  44.07 
 
 		 538 aa  80.1  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  32.55 
 
 		 748 aa  79.3  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0156  spermidine synthase  36.3 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.870744  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1812  Spermine synthase  27.6 
 
 		 301 aa  79.3  0.00000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>