More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5049 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  46.55 
 
 		 1042 aa  781    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  46.97 
 
 		 1042 aa  765    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  100 
 
 		 1031 aa  2021    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  46.49 
 
 		 1059 aa  787    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  47 
 
 		 1040 aa  772    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  37.56 
 
 		 1005 aa  618  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  35.53 
 
 		 1014 aa  508  9.999999999999999e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  35.73 
 
 		 1010 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  23.83 
 
 		 1084 aa  198  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  26.82 
 
 		 1138 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  23.72 
 
 		 1067 aa  189  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  23.49 
 
 		 1062 aa  187  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  23.65 
 
 		 1069 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  23.81 
 
 		 1065 aa  184  8.000000000000001e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  23.88 
 
 		 1066 aa  184  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  23.55 
 
 		 1062 aa  182  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  25.9 
 
 		 1062 aa  182  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  23.6 
 
 		 1062 aa  179  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0011  amidohydrolase  23.8 
 
 		 1062 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  23.64 
 
 		 1062 aa  178  4e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  22.74 
 
 		 1060 aa  178  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  23.24 
 
 		 1049 aa  177  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0011  amidohydrolase  23.69 
 
 		 1062 aa  177  9e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0957331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  23.78 
 
 		 1081 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0015  amidohydrolase  23.89 
 
 		 1062 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000711997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0019  amidohydrolase  23.64 
 
 		 1062 aa  174  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000934915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.75 
 
 		 1071 aa  173  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  24.11 
 
 		 1111 aa  164  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1803  amidohydrolase  25.19 
 
 		 1052 aa  149  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000234818 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  23.7 
 
 		 1113 aa  148  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  24.04 
 
 		 1078 aa  146  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  27.23 
 
 		 686 aa  114  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0016  WD40 domain-containing protein  26.51 
 
 		 445 aa  114  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.56 
 
 		 1097 aa  112  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  28.83 
 
 		 1082 aa  112  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  26.81 
 
 		 1090 aa  107  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  24.88 
 
 		 445 aa  105  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2922  amidohydrolase  28.22 
 
 		 511 aa  103  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.802626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2410  amidohydrolase  27.17 
 
 		 438 aa  98.2  8e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0002152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  28.54 
 
 		 1125 aa  97.4  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2344  amidohydrolase  25.94 
 
 		 485 aa  95.1  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.684912  normal  0.818181 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.84 
 
 		 1067 aa  95.1  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2556  amidohydrolase  24.34 
 
 		 483 aa  93.6  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  27.19 
 
 		 459 aa  92.8  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  23.7 
 
 		 717 aa  92.4  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  25.22 
 
 		 432 aa  92.4  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2416  amidohydrolase  27.17 
 
 		 702 aa  91.7  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.0066037  normal  0.0385776 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  34.39 
 
 		 403 aa  89  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 436 aa  89  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  32.99 
 
 		 434 aa  87.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  34.2 
 
 		 430 aa  86.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1105  amidohydrolase  26.12 
 
 		 478 aa  84.3  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.310318 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  33.7 
 
 		 421 aa  84  0.00000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  33.68 
 
 		 430 aa  84  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  34.25 
 
 		 443 aa  84  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  31.98 
 
 		 434 aa  83.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  30.54 
 
 		 430 aa  83.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  33.68 
 
 		 430 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  32.43 
 
 		 429 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  21.66 
 
 		 441 aa  82.8  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  32.75 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1429  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 450 aa  83.2  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000134537  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  35.95 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  34.78 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  33.7 
 
 		 440 aa  82.4  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  34.78 
 
 		 431 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  36.05 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  29.5 
 
 		 430 aa  81.3  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  32.97 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2587  translocation protein TolB  34.16 
 
 		 431 aa  81.3  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  36.87 
 
 		 398 aa  80.5  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  34.78 
 
 		 431 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  24.94 
 
 		 486 aa  81.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  33.16 
 
 		 438 aa  80.9  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.14 
 
 		 432 aa  80.1  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  35.14 
 
 		 427 aa  80.5  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  26.54 
 
 		 421 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  33.51 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  25.06 
 
 		 451 aa  79.3  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  32.61 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  33.51 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  29.41 
 
 		 424 aa  78.6  0.0000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.17 
 
 		 427 aa  78.6  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  24.19 
 
 		 1084 aa  78.2  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  24.57 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  26.38 
 
 		 969 aa  78.2  0.0000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  25.52 
 
 		 590 aa  78.2  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3973  amidohydrolase  24.09 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.54 
 
 		 1076 aa  77.8  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  33.99 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3066  amidohydrolase  25.29 
 
 		 490 aa  77.8  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  31.19 
 
 		 419 aa  77.8  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0015  amidohydrolase  23.54 
 
 		 598 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  27.89 
 
 		 432 aa  77  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  33.48 
 
 		 437 aa  77  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0971  amidohydrolase 3  26.29 
 
 		 666 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.59323  normal  0.0406107 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.1 
 
 		 446 aa  77  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  31.94 
 
 		 445 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  29.41 
 
 		 354 aa  76.3  0.000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  29.81 
 
 		 442 aa  76.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>